利用3对线粒体引物对玉米同核异质和同质异核不育系的基因组总DNA进行PcR扩增；对检测到多态性的引物，再分别对供试材料小孢子发育至四分体、单核期和双核期的花药总RNA进行差异显示分析。结果表明：以基因组总DNA为模板，引物P1-P2在所有供试不育材料都有一相同的特异扩增带，而在保持系中均无扩增；引物P3-P4在所有供试材料中均无扩增；引物P5一P6仅在保持系黄早四中有扩增，而在其他供试材料中无扩增。这一结果说明以P1-P2为引物所检测到的特异扩增带为所有供试不育细胞质所特有，且不受供试材料不同核背景的影响。对于在不育材料基因组总DNA中具有特异扩增的引物P1-P2，进一步以cDNA为模板进行PcR扩增（RT-PcR），所有不育材料在小孢子发育的3个时期均有一相同的特异扩增带，而保持系在小孢子发育的相应时期均无扩增，说明以P1-P2为引物所检测到的转录本的大小和数目，在同核异质及同质异核不育材料间均表现一致，且不受小孢子发育时期的影响。这说明以P1-P2为引物所检测到的不育材料DNA水平的共同结构特点在小孢子发育中具有转录上的一致性，因此可以认为供试不育细胞质DNA水平的这一特异序列结构与雄性不育性状的表现有关。