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孙杰

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期刊论文

拟南芥mRNA及其靶序列配对特征分析

孙杰刘冲范云六王磊

中国农业科技导报,2009,11(4):53~57,-0001,():

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摘要/描述

microRNAs(miRNAs)是真核生物中一类长度约为22nt的非编码小分子RNA,miRNA与AGO等蛋白形成RISC沉默复合体,通过剪切或翻译抑制对靶基因起负调控作用。对拟南芥miRNA序列及其配对的靶序列间的特征进行了统计分析,结果表明miRNA序列5'端富含A、U,第1、第19碱基位对U、C具有较强的倾向性;miRNA与靶序列间常有l~4个碱基错配,错配碱基常出现在第1,第2和第21位,而第3~第6,第9~第10,第16~第17碱基配对较为保守,为人工合成miRNA的设计及miRNA靶基因的预测以提供了依据。

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