解耦联蛋白3（uncouphllg proteill 3，uCP3）是调节能量和脂肪代谢的重要因子。以商品猪（杂交猪）为对照，采用sscP方法对贵州地方猪品种糯谷猪和萝卜猪的ucP3基因进行了多态性分析。结果表明：3个猪群体中，都检测到了3种基因型（从、BB、AB），X2独立性检验结果显示，3种基因型在3个群体间的分布不一致，糯谷猪和萝卜猪以AB基因型为主，杂交猪以BB基因型占优势，杂交猪与地方猪种之间的差异显著（P<0.01）；对纯合基因型的ucP3基因片段进行克隆测序。证实从基因型中ucP3基因外显子6编码区第842位碱基发生了单碱基突变（T—c），导致编码的氨基酸从苏氨酸突变为甲硫氨酸。进一步分析3种基因型与胴体和内质性状之间的相关性，证明AB基因型个体的内质最优，贵州地方猪种的大理石纹、肌内脂肪含量和嫩度3项指标显著优于商品猪（p<0.01），因此推测ucP3基因与贵州地方猪种的肉质性状具有相关性，可能是贵州地方猪种肉质性状的候选基因。