猪CKM基因启动子的克隆及分析

孙小瑞; 刘敏; 凌先锋; 徐德全; 熊远著

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猪CKM基因启动子的克隆及分析

首发时间：2011-02-22

孙小瑞 ¹
孙小瑞，女，在读硕士研究生，主要研究方向：分子生物学与动物育种
刘敏 ² 凌先锋 ² 徐德全 ²
徐德全（1977-），男，副教授，主要研究方向：动物功能基因组学与育种
熊远著 ²

1、华中农业大学动物科技学院
2、华中农业大学动物科技学院，武汉 430070

摘要：目的：克隆CKM基因的启动子，并分析其顺式作用元件和转录因子结合位点。方法：应用特异引物CKMF/CKMR从猪基因组DNA中扩增CKM基因的5'侧翼片段，通过T/A克隆法对CKM基因的启动子进行克隆，并对PCR鉴定为阳性的克隆子进行测序。利用NNPP、MotifFinder、TFSEARCH、SignalScan、CPGPLOT等生物信息学工具分析其顺式作用元件和转录因子结合位点。结果：克隆得到CKM 5'侧翼1444bp DNA序列，分析表明其包括启动子区，且存在2处CpG岛，具备多种启动子特征元件和转录因子结合位点。结论：成功克隆了CKM基因的启动子。

关键词：动物遗传育种与繁殖猪 CKM 启动子

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Cloning and analysis of porcine CKM promoter

SUN Xiaorui ¹
孙小瑞，女，在读硕士研究生，主要研究方向：分子生物学与动物育种
LIU Min ² LING Xianfeng ² XU Dequan ²
徐德全（1977-），男，副教授，主要研究方向：动物功能基因组学与育种
Xiong Yuanzhu ²

1、College of Animal Sciences & Technology, Huazhong Agriculture University
2、College of Animal Sciences & Technology, Huazhong Agriculture University,Wuhan 430070

Abstract：AIMS: To clone and analyze the promoter region of a porcine gene, CKM. METHODS: The 5' flanking region of CKM gene was amplified from porcine genomic DNA using PCR with specific primers CKMF/CKMR. The promoter of porcine CKM gene was cloned by T/A clone method. The positive clones identified by PCR were then sequenced. The cis-acting elements and transcript factor binding sites were analyzed by bioinformatic tools, such as NNPP, MotifFinder, TFSEARCH, SignalScan, CPGPLOT. RESULTS: 1444bp 5' flanking sequences of porcine CKM gene were cloned. It includes promoter regions, 2 CpG island, some promoter elements and transcript factor binding sites. CONCLUSION: The promoter of porcine CKM gene was successfully cloned.

Keywords： animal genetics breeding and reproduction pig CKM promoter

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孙小瑞，刘敏，凌先锋，等. 猪CKM基因启动子的克隆及分析[EB/OL]. 北京：中国科技论文在线 [2011-02-22]. https://www.paper.edu.cn/releasepaper/content/201102-543.

No.4410484315982129****

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论文编号	201102-543
论文题目	猪CKM基因启动子的克隆及分析
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