液质/光谱和计算机分子对接研究甘草素与人白蛋白的相互作用

马宏跃; 陆国弟; 范欣生

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液质/光谱和计算机分子对接研究甘草素与人白蛋白的相互作用

首发时间：2012-12-27

马宏跃 ¹
马宏跃，（1980-），男，副教授，临床药学。
陆国弟 ¹ 范欣生 ²
范欣生（1958-），女，教授，呼吸道疾病中医药研究

1、南京中医药大学药学院江苏省方剂研究重点实验室，南京 201146
2、南京中医药大学中医学一级学科，南京 210046

摘要：研究甘草素与人血清白蛋白（HSA）相互作用的机制。采用平衡透析-超高液相-四级杆质谱，测得甘草素与HSA浓度比在2:1，5:1时的结合率为（66.24±1.82）%和（84.26±0.99）%，表明甘草素与HSA发生高强度结合。荧光光谱研究了甘草素对HSA的荧光淬灭效应，结果在296，302和310 K时，甘草素与HSA的结合常数Ka分别为4.92×10E6，4.04×10E6，2.69×10E6 Lomol-1，结合强度随着温度的升高而降低，说明发生静态猝灭；计算热力学常数△H：-24.36 kJomol-1，△S：45.81 Jo(mol-1oK)-1，△G: -37.92 kJomoL -1，提示疏水力和氢键是甘草素与HSA的主要作用力类型。分子对接首先进行了方法有效性和位点选择性的考察。采用了以能量评分和药物结合特征为指标的构象选择标准，筛选出甘草素在位点I的特异性构象：①甘草素的A/C环位于非极性氨基酸Leu238和Ala291之间，形成疏水性作用；②甘草素C环的环氧基和羰基以对称氢键的形式分别键合到口袋内Tyr150和口袋入口Arg222；③A环和B环的两个羟基以另一组对称氢键形式，分别键合到口袋内Arg257和入口的Ser192。甘草素在位点I的疏水力评分大于氢键，无静电力相互作用。甘草素分子的四个氧原子形成两两平衡的氢键，以及周围的疏水力，恰好将甘草素分子固定在位点I的疏水性口袋内。

关键词：甘草素白蛋白分子对接荧光光谱液质

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Studies on the binding of liquiritigenin with human serum albumin by liquid chromatography mass spectrometry, spectroscopy and computer modeling

MA Hongyue ¹
马宏跃，（1980-），男，副教授，临床药学。
LU Guodi ¹ FAN Xinsheng ²
范欣生（1958-），女，教授，呼吸道疾病中医药研究

1、Jiangsu Key laboratory for TCM formulae research, College of Pharmacy, Nanjing University of Chinese Medicine, Nanjing 210046
2、Traditional Chinese Medicine Department of Nanjing University of Chinese Medicine, Nanjing, 210046

Abstract：In this paper, the interaction between liquiritigenin and human serum albumin (HSA) was investigated. Equilibrium dialysis and ultra-performance liquid chromatography tandem mass spectrometry (UPLC-MS/MS) were used to analyze the binding rates of liquiritigenin to HSA. The binding rate at 2:1 and 5:1 is 66.24% and 84.26%, respectively. Fluorescence data showed that the quenching of HSA by liquiritigenin was result of forming the complex of liquiritigenin-HSA. The binding parameters (296, 302 and 310 K) are 4.92×10E6, 4.04×10E6 and 2.69×10E6 Lomol-1. The enthalpy change (△H) and entropy change (△S) were calculated to be -24.36 kJmol(-1) and 45.81 Jmol(-1)K(-1), indicating that the hydrogen bonds and hydrophobic interactions played a dominant role in the binding. The molecular docking investigation revealed that the site I was the main binding site of liquiritigenin. In site I, A/C ring of liquiritigenin pinned snugly between the apolar side-chains of Leu238 and Ala291. Moreover, liquiritigenin makes hydrogen-bond interactions with Tyr150 and Arg257 inside the pocket, and Arg222 and Ser192 at the entrance of pocket, which appears particularly well adapted to the site I pocket.

Keywords： Liquiritigenin HSA Molecular docking Fluorescence spectrum UPLC-MS/MS

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马宏跃，陆国弟，范欣生. 液质/光谱和计算机分子对接研究甘草素与人白蛋白的相互作用[EB/OL]. 北京：中国科技论文在线 [2012-12-27]. https://www.paper.edu.cn/releasepaper/content/201212-908.

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论文编号	201212-908
论文题目	液质/光谱和计算机分子对接研究甘草素与人白蛋白的相互作用
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