胶质瘤细胞中ADAR2 mRNA前体选择性模式的分析

李朝晖; 田男; 魏君; 李小玲; 杜超; 田宇

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胶质瘤细胞中ADAR2 mRNA前体选择性模式的分析

首发时间：2013-12-27

李朝晖 ¹
李朝晖（1982.11- ），男，主治医师，胶质瘤的基因调控
田男 ² 魏君 ¹ 李小玲 ² 杜超 ¹ 田宇 ¹
田宇（1962.3- ），男，教授、主任医师，胶质瘤的基因调控

1、吉林大学中日联谊医院神经外二科
2、浙江中医药大学生命科学学院

摘要：目的：比较胶质瘤细胞U87、U251、A172和正常星形胶质细胞HA1800中ADAR2 mRNA前体选择性剪接模式的差别。方法：RT-PCR产物测序检测胶质瘤细胞和正常胶质细胞中Glu2 Q/R位点的A-to-I编辑水平。根据前期研究鉴定出的选择性剪接位点设计特异性引物，Real-time PCR方法检测胶质瘤细胞U87、U251、A172和正常星形胶质细胞HA1800中不同剪接转录本的相对表达量，比较胶质瘤细胞和正常胶质细胞中ADAR2 mRNA前体剪接模式的差异。结果：胶质瘤细胞中Glu2 Q/R位点的A-to-I编辑水平明显下降。Real-time PCR检测到在胶质瘤细胞中，Exon 5a（+）/5a（-）的比值明显高于正常星形胶质细胞HA1800。Exon 1a（+）/1a（-）、Exon 2（+）/2（-）的比值在胶质瘤细胞和正常星形胶质细胞中无差异。结论：Exon 5a位点的剪接在胶质瘤细胞和正常细胞中存在明显差别，Exon 5a（+）转录本的表达增加可能是导致胶质瘤细胞中ADAR2编辑活性下降的原因。

关键词：外科学胶质瘤 ADAR2 选择性剪接

For information in English, please click here

Analysis the alternative splicing pattern of ADAR2 pre-mRNA in human glioma cell lines

Li Zhaohui ¹
李朝晖（1982.11- ），男，主治医师，胶质瘤的基因调控
Tian Nan ² Wei Jun ¹ Li Xiaoling ² Du Chao ¹ Tian Yu ¹
田宇（1962.3- ），男，教授、主任医师，胶质瘤的基因调控

1、Department of Neurosurgery, China–Japan Union Hospital, Jilin University
2、College of life science, Zhejiang Chinese Medicine University

Abstract：Objective：To analysis the differences of ADAR2 alternatively splicing pattern between glioma cell lines and normal human astrocyte. Methods：Real-time PCR was performed to detect the expression level of each alternatively splicing variant using specific primer which was confirmed to amplify only the targeted template and not other alternatively spliced variant fragments. Results：Real-time PCR revealed that the ADAR2 pre-mRNA splicing pattern has no significant difference at exon 1a and exon 2 between glioma cell lines and normal human astrocyte; At the same time, we detected that the amount of alternative splicing variants including exon 5a was higher than that of alternative splicing variants not including exon 5a in human glioma cell lines, however, the expression of alternative splicing variants including exon 5a was lower than that of alternative splicing variants not including exon 5a in human astrocyte. Conclusion：The different alternatively splicing pattern at exon 5a may attribute to the decreased activity of ADAR2..

Keywords： Surgery Glioma ADAR2 Alternative splice

基金：

1. 国家自然科学基金资助项目（30672159）

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李朝晖，田男，魏君，等. 胶质瘤细胞中ADAR2 mRNA前体选择性模式的分析[EB/OL]. 北京：中国科技论文在线 [2013-12-27]. http://www.paper.edu.cn/releasepaper/content/201312-975.

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论文编号	201312-975
论文题目	胶质瘤细胞中ADAR2 mRNA前体选择性模式的分析
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