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论文编号 201512-943
论文题目 蛋白质-RNA模板数据库的构建
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  • 原稿 ( 勘误表 )开放数据

    发布日期:2015-12-28
  • 蛋白质-RNA模板数据库的构建11

    0、

    1    第6行  "PDB数据库" 改成 "数据库"
    2    第14行  "Physics school "  改成 "School of physics"
    3    第15行  "a"         改成     "an"
    4    第15行  "protein RNA "  改成  protein-RNA
    5    第16行   "constructure"  改成 "construct"
    6    第16行    "file"    改成  "files"
    7    第17行    删除database
    8    第17行    "file"    改成  "files"
    9    第18行  "blastcluster"  改成 "blastclust"
    9    第39行     "633"  改成 "包含633"
    10   第129行    删除 "文件""
    11   第134行   "越低着" 改成 "值越低"
    12   第132行    "原子"  改成 "原子坐标"
    13   第112行    5.0  改成 4.5

  • 修改稿

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    发布日期:

蛋白质-RNA模板数据库的构建

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郑进芳

郑进芳(1988-),男,博士生,蛋白质-RNA复合物结构预测

刘士勇

刘士勇(1978-),男,副教授,主要从事功能蛋白质设计、蛋白质分子对接、蛋白质-蛋白质、蛋白质-RNA相互作用研究

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发送给

华中科技大学物理学院,武汉,430074

摘要:数据库在研究蛋白质-RNA的相互作用中是十分重要的,因此在本文中我们构建了一个数据库。从PDB数据库下载到所有的蛋白质-RNA的复合物坐标文件,之后选择长度、分辨率、界面残基的个数等条件对PDB的复合结构进行筛选,聚类构成模板库,构建出一个包含633个界面,208个复合物的模板库,以此作为下一步研究的数据集基础。。

关键词: 生物物理 蛋白质-RNA 模板 二元界面 RNA二级结构

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