甘蓝型油菜PHT1家族的全基因组鉴定、结构及特征

董旭; 施德旭; 石磊; 蔡红梅; 徐芳森; 丁广大

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甘蓝型油菜PHT1家族的全基因组鉴定、结构及特征

首发时间：2016-05-26

董旭 ¹
董旭（1992-），男，硕士研究生，主要从事油菜磷高效分子机理研究
施德旭 ¹ 石磊 ¹ 蔡红梅 ¹ 徐芳森 ¹ 丁广大 ¹
丁广大（1983-），副教授，硕士生导师，主要研究方向：植物营养遗传与分子生物学

1、华中农业大学微量元素研究中心/资源与环境学院，武汉 430070

DOI:10.12383/SciencepaperOnline.201605.1275CSTR:20001.14.SciencepaperOnline.201605.1275

摘要：植物PHT1磷转运蛋白家族在植物磷吸收、体内磷分配及再利用等过程中发挥了重要作用。本研究从公共数据库中查找了甘蓝型油菜PHT1家族的全部成员，并利用生物信息学的方法分析了该家族成员的结构、进化及理化性质等基本特征。研究结果表明，甘蓝型油菜全基因组中至少存在48个PHT1家族成员，分布在除A1、A10和C1外的16条染色体上，mRNA长度为1152 bp ~2771 bp，氨基酸长度为281~805，其中39个成员含有10~12个跨膜结构域，少部分成员可能由于序列缺失或膜退化原因导致其跨膜结构域个数较少。进化分析表明甘蓝型油菜PHT1家族成员至少被分成4个的亚组，主要与双子叶植物同源基因聚在一类。本研究为深入探讨PHT1家族成员在油菜磷吸收转运中的作用奠定了基础。

关键词：甘蓝型油菜 PHT1家族基因结构进化树理化性质

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Whole-genomic identification and characterization of PHT1 family genes in Brassica napus

DONG Xu ¹
董旭（1992-），男，硕士研究生，主要从事油菜磷高效分子机理研究
SHI Dexu ¹ SHI Lei ¹ CAI Hongmei ¹ XU Fangsen ¹ DING Guangda ¹
丁广大（1983-），副教授，硕士生导师，主要研究方向：植物营养遗传与分子生物学

1、Microelement Research Centre/College of Resources and Environment, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070

Abstract：Plant PHT1 family have played vital important roles in phosphorus (P) absorption, P distribution and recycling in plants. In the present study, we identify all the members of PHT1 family in Brasscia napu from public data. In the present study, the structure, evolution and physicochemical properties of B. napus PHT1 family members are analyzed by bioinformatics tools. Our results show that there are 48 members in the whole genome of B. napus, scattering over 16 chromosomes except A1, A10 and C1. The mRNA length of all members varies from 1152 bp to 2771 bp, while the amino acid length ranges from 281 to 805. Among them, 39 members contain 10 to 12 transmembrane domains, except some with sequence deletion or membrane degradation. Phylogenetic analysis shows that PHT1 family genes can be divided into at least four groups, together with dicots. Our results provide basis for further research of the role of B. napus PHT1 family members in P uptake and transportation.

Keywords： Brassica napus PHT1 family Gene structure Phylogenetic tree Physicochemical properties

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董旭，施德旭，石磊，等. 甘蓝型油菜PHT1家族的全基因组鉴定、结构及特征[EB/OL]. 北京：中国科技论文在线 [2016-05-26]. https://www.paper.edu.cn/releasepaper/content/201605-1275.

No.4691499115052314****

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论文编号	201605-1275
论文题目	甘蓝型油菜PHT1家族的全基因组鉴定、结构及特征
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