人左脑和前列腺中酪氨酸羟化酶（TH）上游抑制无义转录物UPF3调控因子同源A（UPF3A）的亚网络通过细胞核到线粒体到细胞质的RNA结合诱导的学习

郗瑞鹏; 黄菊香; 王琳

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Tyrosine hydroxylase (TH) upstream-inhibited UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog A (UPF3A) subnetwork for learning in human left hemisphere|Prostate via nucleus to mitochondrion to cytosol RNA binding

首发时间：2020-09-21

Xi Ruipeng ¹
Xi Ruipeng(1994-),Male,Master,Bioinformation
HUANG Juxiang
HUANG Juxiang(1986-),Famale,Assistant professor,bioinformation
WANG Lin
WANG Lin(1964-),Famale,Professor,Bioinformation

1、School of Electronic Engineering, Beijing University of Posts and Telecommunications, 100876

Abstract：High tyrosine hydroxylase (TH) upstream-inhibited UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog A (yeast) (UPF3A) molecular subnetwork was constructed, including upstream hypothetical LOC400642 (LOC400642), retinoblastoma binding protein 6 (RBBP6), ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 (UBR5); downstream chromosome 10 open reading frame 10 (C10orf10), sulfotransferase family 1A member 2 (SULT1A2) reported relation with learning in human left hemisphere. The common biology process of TH upstream-inhibited UPF3A subnetwork was identified by DAVID, containing upstream RBBP6, upstream UBR5, downstream SULT1A2, second-core UPF3A, first-core TH as protein binding; upstream RBBP6, upstream UBR5 as ubiquitin protein transferase activity, zinc ion binding, ligase activity, cellular response to DNA damage stimulus, protein ubiquitination involved in ubiquitin dependent protein catabolic process; upstream UBR5, second-core UPF3A as RNA binding; downstream SULT1A2, first-core TH as small molecule metabolic process; The common cellular component of upstream RBBP6, upstream UBR5, second-core UPF3A, first-core TH as cytoplasm; upstream RBBP6, upstream UBR5, second-core UPF3A as nucleoplasm; upstream UBR5, second-core UPF3A, first-core TH as nucleus; downstream SULT1A2, second-core UPF3A, first-core TH as cytosol; downstream C10orf10, first-core TH as mitochondrion; The common tissue distributions as Prostate_3rd maybe exist the same pattern with human left hemisphere. We propose and mutual positively verify tyrosine hydroxylase (TH) upstream-inhibited UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog A (yeast) (UPF3A) subnetwork for learning in human left hemisphere|Prostate via nucleus to mitochondrion to cytosol RNA binding.

keywords： TH upstream-inhibited UPF3A subnetwork for learning human left hemisphere|Prostate nucleus to mitochondrion to cytosol RNA binding

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人左脑和前列腺中酪氨酸羟化酶（TH）上游抑制无义转录物UPF3调控因子同源A（UPF3A）的亚网络通过细胞核到线粒体到细胞质的RNA结合诱导的学习

郗瑞鹏 ¹
Xi Ruipeng(1994-),Male,Master,Bioinformation
黄菊香 ¹
HUANG Juxiang(1986-),Famale,Assistant professor,bioinformation
王琳 ¹
WANG Lin(1964-),Famale,Professor,Bioinformation

1、北京邮电大学电子工程学院，100876

摘要：本文通过GRNInfer构建了人类左脑中酪氨酸羟化酶（TH）上游抑制无义转录物UPF3 调控因子同源物A (UPF3A) 的分子亚网络，包括上游的假基因LOC400642，成视网膜细胞瘤结合蛋白6（RBBP6），E3泛素蛋白连接酶5识别子（UBR5）；下游的染色体10开放阅读框10（C10orf10），磺基转移酶家族1A成员2（SULT1A2），这些分子均与学习有关。基于DAVID，确定了TH上游抑制UPF3A亚网络相同的生物学过程包括上游RBBP6、上游UBR5、下游SULT1A2、次中心UPF3A、主中心TH的蛋白结合，上游RBBP6、上游UBR5的泛素蛋白转移酶活性、锌离子结合、连接酶活性、细胞对DNA损伤刺激的反应、涉及泛素依赖性蛋白分解代谢过程的蛋白泛素化，上游UBR5、次中心UPF3A的RNA结合，下游SULT1A2、主中心TH的小分子代谢过程；相同的细胞定位包含上游RBBP6、上游UBR5、次中心UPF3A、主中心TH的细胞质，上游RBBP6、上游UBR5、次中心UPF3A的核质，上游UBR5、次中心UPF3A、主中心TH的细胞核，下游SULT1A2、次中心UPF3A、主中心TH的胞质溶胶。下游C10orf10、主中心TH为线粒体；相同的组织分布显示前列腺可能与人类左脑存在相同的模式。我们提出并相互验证假说人左脑和前列腺中酪氨酸羟化酶（TH）上游抑制无义转录物UPF3调控因子同源A（酵母）（UPF3A）的亚网络通过细胞核到线粒体到细胞质的RNA结合诱导的学习。

关键词： TH上游抑制UPF3A学习亚网络; 人左脑|前列腺; 细胞核到线粒体到细胞质; RNA结合

基金：

1. National Natural Science Youth Fondation of China （No. 81501372）

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Xi Ruipeng,HUANG Juxiang,WANG Lin. Tyrosine hydroxylase (TH) upstream-inhibited UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog A (UPF3A) subnetwork for learning in human left hemisphere|Prostate via nucleus to mitochondrion to cytosol RNA binding[EB/OL]. Beijing:Sciencepaper Online[2020-09-21]. https://www.paper.edu.cn/releasepaper/content/202009-58.

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论文编号	202009-58
论文题目	人左脑和前列腺中酪氨酸羟化酶（TH）上游抑制无义转录物UPF3调控因子同源A（UPF3A）的亚网络通过细胞核到线粒体到细胞质的RNA结合诱导的学习
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