您当前所在位置: 首页 > 首发论文
动态公开评议须知

1. 评议人本着自愿的原则,秉持科学严谨的态度,从论文的科学性、创新性、表述性等方面给予客观公正的学术评价,亦可对研究提出改进方案或下一步发展的建议。

2. 论文若有勘误表、修改稿等更新的版本,建议评议人针对最新版本的论文进行同行评议。

3. 每位评议人对每篇论文有且仅有一次评议机会,评议结果将完全公示于网站上,一旦发布,不可更改、不可撤回,因此,在给予评议时请慎重考虑,认真对待,准确表述。

4. 同行评议仅限于学术范围内的合理讨论,评议人需承诺此次评议不存在利益往来、同行竞争、学术偏见等行为,不可进行任何人身攻击或恶意评价,一旦发现有不当评议的行为,评议结果将被撤销,并收回评审人的权限,此外,本站将保留追究责任的权利。

5. 论文所展示的星级为综合评定结果,是根据多位评议人的同行评议结果进行综合计算而得出的。

勘误表

上传勘误表说明

  • 1. 请按本站示例的“勘误表格式”要求,在文本框中编写勘误表;
  • 2. 本站只保留一版勘误表,每重新上传一次,即会覆盖之前的版本;
  • 3. 本站只针对原稿进行勘误,修改稿发布后,不可对原稿及修改稿再作勘误。

示例:

勘误表

上传勘误表说明

  • 1. 请按本站示例的“勘误表格式”要求,在文本框中编写勘误表;
  • 2. 本站只保留一版勘误表,每重新上传一次,即会覆盖之前的版本;
  • 3. 本站只针对原稿进行勘误,修改稿发布后,不可对原稿及修改稿再作勘误。

示例:

上传后印本

( 请提交PDF文档 )

* 后印本是指作者提交给期刊的预印本,经过同行评议和期刊的编辑后发表在正式期刊上的论文版本。作者自愿上传,上传前请查询出版商所允许的延缓公示的政策,若因此产生纠纷,本站概不负责。

发邮件给 王小芳 *

收件人:

收件人邮箱:

发件人邮箱:

发送内容:

0/300

论文收录信息

论文编号 202012-129
论文题目 花生TCP基因家族全基因组鉴定及生物信息学分析
文献类型
收录
期刊

上传封面

期刊名称(中文)

期刊名称(英文)

年, 卷(

上传封面

书名(中文)

书名(英文)

出版地

出版社

出版年

上传封面

书名(中文)

书名(英文)

出版地

出版社

出版年

上传封面

编者.论文集名称(中文) [c].

出版地 出版社 出版年-

编者.论文集名称(英文) [c].

出版地出版社 出版年-

上传封面

期刊名称(中文)

期刊名称(英文)

日期--

在线地址http://

上传封面

文题(中文)

文题(英文)

出版地

出版社,出版日期--

上传封面

文题(中文)

文题(英文)

出版地

出版社,出版日期--

英文作者写法:

中外文作者均姓前名后,姓大写,名的第一个字母大写,姓全称写出,名可只写第一个字母,其后不加实心圆点“.”,

作者之间用逗号“,”分隔,最后为实心圆点“.”,

示例1:原姓名写法:Albert Einstein,编入参考文献时写法:Einstein A.

示例2:原姓名写法:李时珍;编入参考文献时写法:LI S Z.

示例3:YELLAND R L,JONES S C,EASTON K S,et al.

上传修改稿说明:

1.修改稿的作者顺序及单位须与原文一致;

2.修改稿上传成功后,请勿上传相同内容的论文;

3.修改稿中必须要有相应的修改标记,如高亮修改内容,添加文字说明等,否则将作退稿处理。

4.请选择DOC或Latex中的一种文件格式上传。

上传doc论文   请上传模板编辑的DOC文件

上传latex论文

* 上传模板导出的pdf论文文件(须含页眉)

* 上传模板编辑的tex文件

回复成功!


  • 0

花生TCP基因家族全基因组鉴定及生物信息学分析

首发时间:2020-12-31

陈娟娟 1   

陈娟娟(1996-),女,在读硕士,主要研究方向:花生遗传育种

张靖男 1    崔顺立 1    韦丽君 1    候名语 1    杨鑫雷 1   

杨鑫雷(1984-),男,副教授,硕导,主要研究方向:花生遗传育种

刘立峰 1   

刘立峰(1966-),男,教授,博导,主要研究方向:花生遗传育种

  • 1、华北作物改良与调控国家重点实验室/河北省种质资源实验室/河北农业大学农学院,河北省保定市 071001

摘要:TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea /Proliferating cell factors)转录因子作为植物特有的一类转录因子,参与植物生长发育的多个重要过程。花生作为重要的油料作物,关于TCP基因家族的研究却鲜见报道。本文通过生物信息学的方法对花生TCP基因家族成员进行鉴定并对其进行了染色体定位、系统进化、结构特征、理化性质、启动子顺式元件、基因组共线性、基因复制和选择压力等分析。结果表明:在四倍体花生AABB、二倍体AA和BB基因组中各鉴定获得30(AhTCPs)、11(AduTCPs)和10(AipTCPs)个,分别定位到14、6和5条染色体上;与拟南芥AtTCPs蛋白构建系统进化树发现,花生TCP蛋白可分为ClassⅠ和ClassⅡ两类;51个花生TCP成员均含有非典型bHLH结构,蛋白质结构均以α-螺旋和无规则卷曲为主,氨基酸数目显示四倍体成员较二倍体成员多,且多数家族成员被定位到细胞外;基因家族成员上游2000bp启动子区含有多种与光响应、激素响应和植物生长发育等相关的顺式作用调控元件。另外,15对共线基因存在于AABB和AA基因组间,17对共线基因存在于AABB与BB基因组间;基因复制及选择压力分析发现,在四倍体基因组内发现5对片段复制,且仅有一对基因处于正向选择压力下。本研究首次对花生TCP基因家族进行全基因组鉴定及生物信息学分析,为进一步了解TCP家族的生物学功能提供理论基础。

关键词: 花生 TCP 转录因子 生物信息学分析

For information in English, please click here

Genome-wide identification and bioinformatics analysis of TCP gene family in peanut

CHEN Juanjuan 1   

陈娟娟(1996-),女,在读硕士,主要研究方向:花生遗传育种

ZHANG Jingnan 1    CUI Shunli 1    WEI Lijun 1    HOU Mingyu 1    YANG Xinlei 1   

杨鑫雷(1984-),男,副教授,硕导,主要研究方向:花生遗传育种

LIU Lifeng 1   

刘立峰(1966-),男,教授,博导,主要研究方向:花生遗传育种

  • 1、State Key Laboratory of North China for Crop Improvement and Regulation/Laboratory of Crop Germplasm Resources of Hebei Province/ Hebei Agricultural University, Baoding, HeBei 071001

Abstract:TCP (Teosinte branched 1/Cycloidea /Proliferating cell factors), as a unique transcription factor, which involve in many important processes of growth and development in plants. Peanut is an important oil crop, but there are few reports about TCP gene family. In the present study, TCP gene family was identified by bioinformatics methods in peanut, and then their chromosome location, phylogenetic evolution, structural characteristics, prediction of physical and chemical properties, promoter cis elements, genome collinearity, gene duplication and selection pressure were analyzed. The results indicated that 30 AhTCPs, 11 AduTCPs and 10 AipTCPs were located to 14, 6 and 5 chromosomes on one tetraploid genome and two wild diploids (AA and BB), respectively. Compared with AtTCPs protein, 51 members divided into class I and class II, and contained an untypical bHLH structure. Their protein structures were mainly composed of α-helix and random coil, and the tetraploid members had more amino acids than two diploids, and most of the members were located at extracellular. A variety of cis elements were predicted at the upstream 2000bp promoter region, which related to light response, hormone response, plant growth and development, etc. In addition, 15 pairs of collinear genes existed between AABB and AA genomes, and 17 pairs existed between AABB and BB genomes. There were only 5 pairs of fragments in AABB genome, and only 1 pair of genes was under positive selection pressure. In this study, we firstly identified and analyzed TCP gene family on the whole genome in peanut, and these results will provide theoretical basis for further understanding the biological function of TCP family.

Keywords: peanut TCP transcription factor bioinformatics analysis

Click to fold

点击收起

论文图表:

引用

导出参考文献

.txt .ris .doc
陈娟娟,张靖男,崔顺立,等. 花生TCP基因家族全基因组鉴定及生物信息学分析[EB/OL]. 北京:中国科技论文在线 [2020-12-31]. http://www.paper.edu.cn/releasepaper/content/202012-129.

No.****

同行评议

未申请同行评议

评论

全部评论

0/1000

勘误表

花生TCP基因家族全基因组鉴定及生物信息学分析