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论文题目 DNA甲基化及突变对KRAS启动子区G-四链体结构的影响
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DNA甲基化及突变对KRAS启动子区G-四链体结构的影响

首发时间:2022-05-11

谭江 1   

谭江(1993-),男,药物分析

李杨峰 1   

李杨峰(1989-),男,副教授,硕导,药物化学生物学

李亦舟 1   

李亦舟(1987-),男,教授,博导,药物化学生物学

周江 2   

周江(1978-),男,教授,化学生物学

  • 1、重庆大学药学院,重庆,401331
  • 2、北京大学化学与分子工程学院,北京,100871

摘要:目的:研究K-RAS基因启动子区富G序列胞嘧啶甲基化或突变对其G-四链体结构的影响。方法:首先利用胞嘧啶突变为胸腺嘧啶确定关键胞嘧啶,然后将对应位点的胞嘧啶甲基化,再通过圆二色谱和离子淌度质谱对比甲基化前后G-四链体结构的差异。结果:圆二色谱结果显示,甲基化后该序列在260 nm处的吸收增加,而在290 nm处的吸收均降低,说明G-四链体结构有序性增加;离子淌度质谱分析则发现,甲基化序列的漂移时间明显小于野生型及突变序列,说明甲基化后G-四链体结构更加收敛有序。结论:胞嘧啶甲基化有利于提升K-RAS Mid GG-四链体正向平行结构的稳定性和有序性。

关键词: K-RAS 离子淌度质谱 圆二色谱 5-甲基胞嘧啶 G-四链体

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Effects of DNA methylation and mutations on the structure of the G-quadruplex in KRAS promoter region

TAN Jiang 1   

谭江(1993-),男,药物分析

LI Yangfeng 1   

李杨峰(1989-),男,副教授,硕导,药物化学生物学

LI Yizhou 1   

李亦舟(1987-),男,教授,博导,药物化学生物学

ZHOU Jiang 2   

周江(1978-),男,教授,化学生物学

  • 1、School of Pharmaceutical Sciences,Chongqing University,Chongqing 401331
  • 2、College of Chemistry and Molecular Engineering,Peking University,Beijing,100871

Abstract:Purpose: To investigate the effects of 5-methylcytosine on the structure of the G-quadruplex in the promoter region of the K-RAS gene. Methods: The key cytosine was firstly dertermined by the mutation of cytosine to thymine, and then the cytosine at the corresponding site was methylated.Therefore the differences before and after G-quadruplex methylation were compared by circular dichroism and ion mobility mass spectrometry. Results: The results of circular dichroism showed that the absorption of the methylated sequence increased at 260 nm and decreased at 290 nm, indicating that the structural order of G-quadruplex increased; Ion mobility mass spectrometry found that the drift time of methylated sequence was significantly less than that of wild-type and mutant sequence, indicating that the G-quadruplex structure was more convergent and orderly after methylation. Conclusion: cytosine methylation is beneficial to improve the stability and order of the parallel G-quadruplexstructure from K-RASMid G.

Keywords: K-RAS Ion mobility mass spectrometry Circular dichroism 5-Methylcytosine G-quadruplex

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谭江,李杨峰,李亦舟,等. DNA甲基化及突变对KRAS启动子区G-四链体结构的影响[EB/OL]. 北京:中国科技论文在线 [2022-05-11]. https://www.paper.edu.cn/releasepaper/content/202205-66.

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