1. 板栗营养体中酚类化合物和单宁物质含量高，DNA提取和纯化非常困难。本研究对CTAB法加以改良，总结出能够产生扩增产物的模板DNA提取和纯化方法。 2. 建立了稳定的板栗DNA扩增反应体系。并对影响RAPD 反应效果和特异性的两个关键因子，即对退火温度和镁离子浓度进行研究。板栗DNA扩增反应体系中，反应体积为20μL 。94℃预变性2min，然后执行38个扩增循环，每个循环中，94℃变性30s，72℃延伸90s，最后72℃延伸7min。从S系列的S1～S100共100个引物中筛选出适合板栗基因组DNA，能够扩增出稳定产物、扩增谱带清晰、特异性强的16个引物供板栗品种RAPD分析用。16个引物扩增的位点总数为119个，特异性多态位点69个，多态位点占总数的58%。 3. 研究品种间的遗传多样性。46个板栗品种样品的DNA，用16 个引物进行扩增反应，产生69 个多态位点。研究结果表明，各个位点上遗传多样性程度存在较大差别，有效等位基因数目（Ne）最大值为1.999 0，最小值为1.044 4；基因多样度（H）的最大值为0.4998，最小值为0.0425；Shannon信息指数的最大值为0.692 9，最小值为0.104 7。所检测位点的平均有效等位基因数目为1.526 0，平均基因多样度为0.361 8，平均信息指数为0.8432。有效等位基因数目、平均基因多样度和平均Shannon 信息指数的标准误都较小，分别为0.309 6、0.141 8、0.174 8，估计精度较高。这三个遗传多样性度量表明板栗品种间具有较高的遗传多样性。 品种间遗传距离最大值为0.800 1，相应的遗传共享度为0.449 3；品种间遗传距离最小值为0.091 0，对应的遗传共享度为0.913 0。遗传距离是评价品种间近缘关系的良好指标。 41 本研究建立了46个板栗品种的DNA 指纹数据库，并分析出这些板栗品种分子鉴别的最优化引物组合。结果表明，采用16个能产生特异扩增产生的引物中的4个引物，即可准确鉴别所研究的46个板栗品种。分子分类能够有效地揭示形态相似、经济性状相近或部分地理种源相同的品种间的近缘关系。分子标记方法鉴别品种具有广阔的前景。