目的：探讨肝气郁结证、肝火上炎证与五羟色胺转运体（5-HTT）、色氨酸羟化酶（TPH）基因三种多态性的相关性。方法：运用多聚酶链式反应技术（PCR）检测50例肝气郁结证、50例肝火上炎证患者与90例健康对照者三种基因多态性的分布频率。结果：肝火上炎证患者5-HTT 启动子区多态性（5-HTTLPR）的SS（shortPshort）基因型和S（short）等位基因频率分别为7-%和85%，健康对照者SS基因型和S等位基因频率分别为49%和71%，两组之间比较差异有显著性（P<0.05）。肝气郁结证患者5-HTTLPR的SS基因型和S等位基因频率分别为58%和74%，与健康组比较差异无显著性。5-HTT内含子- 可变数串联重复序列（VNTR）多态性和TPH基因A-18C多态性各基因型和等位基因频率在肝气郁结证、肝火上炎证患者组与健康人组中均差异无显著性（P>0.05）。结论：5-HTTLPR多态性SS型个体可能是肝火上炎证的易感人群。