采用微粒吸附法从广东省一慢性丙型肝炎病人血清中提取丙型肝炎病毒（HCV）RNA，经随机引物逆转录为cDNA，再经聚合酶链反应（PCR），获得包膜蛋白区（E1，E2/NS1）两个部分重叠的产物片段，分别为489bp和806bp。其中，489bp片段主要位于E1区，小部分位于C区;806bp片段位于E2/ NS1区。将489bp片段插入pUC19载体，再亚克隆进pUC18质粒载体。806bp片段则插入到pBV220质粒及M13mp18、M13mp19噬菌体。将所测定的序列（共为1246bp）与多个已知分离株相应序列比较后发现，核苷酸同源性介乎61.00%-89.41%，与Ⅱ（1b）型同源性最大，超过86%；推导的氨基酸同源性为60.24%-87.23%。与其它株比较，HCV广东株（HCV-GD）较大变异区包括251-258、383-406、434-446及475-480位氨基酸。其中两个与公认的高变异区（383-408、475-480）相对应。