目的了解重庆市供水系统和三峡库区水体微囊藻毒素LR（MC - LR）污染状况及其进行研究。方法于2004年5.8月先后采集重庆市主城区5个自来水处理厂源水和出厂水共10个水样以及库区干流、支流共7个断面的水样，分别进行水样和膜样的预处理，运用高效液相色谱法（HPLC）结合二极管阵列式检测器检测重庆市供水系统、三峡库区水体中微囊藻毒素的浓度。结果（1）重庆市5个自来水处理厂源水和出厂水的MC-LR检测中，化机水厂采样点的源水膜样中检出了MC-LR，浓度为0.11 pg/L;其余样本均未检出MC-LR。（2）在三峡库区水域所布设的7个采样点中，有6个采样点的样本检出MC-LR，其浓度范围0.07～0.57μg/L。其中MC-LR水样检出率为86%，浓度范围0.07-0.44μg/L; MC-LR膜样检出率为43%，浓度范围0.12 -0.13μg/L。结论本次检测所有检测样本MC-LR浓度均未超过WHO推荐的1μg/L安全限值。（1）重庆市主城区供水系统出厂水未检出MC-LR，饮用水较为安全。（2）在藻类高发季节，三峡库区局部水域中已能够检测出囊藻毒素，但其污染程度较低，尚未超出安全限值。