棕色和绿色纤维中的色素可用HNO3/乙醇提取，提取液中的色素含量可在412nm波长下根据吸收值的大小进行估计。在开花后15d前后，棕色和绿色纤维中的色素已经形成和积累，并在开花后20d色素含量达到最高值. 棕色纤维颜色发生明显加深的时期是开花后30～35d，棕色纤维的颜色较稳定，在阳光下甚至有加深的趋势。绿色棉纤维在开花后20d时纤维出现绿色，之后随着纤维的发育颜色逐渐加深，但在阳光下易退色。在棕色和绿色纤维中纤维素含量明显低于白色纤维，可能是由色素物质的积累所引起。在开花后15～30d期间，白色纤维细胞的pH值呈快速下降趋势，但棕色和绿色纤维细胞的pH值下降速度比白色纤维细胞明显要慢，在这一时期pH值下降速度的快慢可能与纤维的伸长、次生壁的加厚和色素的形成有关。与白色纤维比较，棕色和绿色纤维品质较差，如：长度偏短，强度偏低，其可能原因本文进行了探讨。