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许丽艳

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期刊论文

人食管癌cDNA酵母杂交文库的构建与鉴定及其应用*

许丽艳许丽艳)**李恩民)牛永东)蔡唯佳)韩溟)吴炳礼)张灿)沈忠英)曾毅)

生物化学与生物物理进展,2003,30(2):295~300,-0001,():

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摘要/描述

以往在研究由促癌物12-o-十四烷酰佛波醇-13-乙酯(12-o-tetradecanoylphorbol-13-acetate, TPA)诱导的人永生化食管上皮细胞恶性变中基因的差异表达情况时,曾获得中性粒细胞明胶酶相关lipocalin(netutrophil gelatinase-associated lipocalin, NGAL)等新的食管癌癌变相关基因为深入研究这些癌变相关基因在食管癌中以蛋白质—蛋白质或蛋白质—DNA相互作用为基础的功能网络调控关系,建立了一个食管癌cDNA酵母杂交文库采用Trizol试剂从一种新的人食管癌细胞(SHEEC,由人永生化食管上皮细胞转化而来)中提取细胞总RNA,采用Oligotex mRNA Kit从细胞总RNA中制备PolyA+mRNA,采用superscriptT”choice System For cDNA Synthesis Kit合成cDNA,以PolyA+mRNA为探针,化学发光法监测cDNA合成的质量,以pGADT7为载体构建了SHEEC细胞的cDNA酵母杂交文库文库的滴度为l.19×l09cfu/ml,重组片段大小主要集中在0.5~6.0kb,重组率为50%,在此基础上,应用酵母单杂交技术手段对该文库中的NF-kB出元件结合因子进行了筛选,在SD/-his/-leu/[+15mmol/L3-AT]缺陷培养基平板上共获得了约360个单克隆按照平板上酵母单克隆直径的大小,选择直径大于2 rr蚰者91个,提取质粒进行酶切鉴定和一对一酵母单杂交验证实验,结果获得了30个阳性重组子,并随机取其中的9个阳性重组子进行测序和GenBank/BLAST同源分析,发现某些基因编码的蛋白质产物在关键氨基酸残基位点上与D65和p50的NFkB元件结合域公共序列具有高度一致性这些实验结果表明,所构建的人食管癌cDNA酵母杂交文库是成功的

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