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姚开泰
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期刊论文
成人视网膜假定蛋白基因ARHP的克隆及生物信息学分析*
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从UniGene库中选取编号为BG222624来自人鼻咽组织的表达序列标签（EST）序列，联网到NCBI调用Blast服务器分析，发现该EST序列是一个代表新基因的未知序列。利用Blast检索GenBank的nr数据库和EST数据库，构建EST重叠群，联网到NCBI的ORF finder服务器，分析发现该EST重叠群具有完整的阅读框架。分别在cDNA序列阅读框架的起始密码子和终止密码子的两侧设计引物，以人胎脑cDNA文库为模板，进行PCR扩增，测序确定该基因的cDNA全长序列。该基因cDNA序列全长为1672bp，阅读框架位于第304～1557位之间，编码由417个氨基酸组成，分子质量为46158ku 的蛋白质，其理论pI为4121。将蛋白质序列通过NCBI的Blast服务器进行序列相似性分析，发现该基因编码的蛋白质和成年小鼠视网膜未知蛋白（BAB32214）同源。经与国际人类基因组命名委员会协商定名为成人视网膜假定蛋白（adult retina hypothetical protein, ARHP），GenBank 登录号为AY174896。生物信息学分析表明，该蛋白质可能为一参与转录调控的核蛋白。ARHP基因定位在染色体5q35，跨越35163 bp，含4个外显子和3个内含子。在基因的5非翻译区有2个CpG岛。
【免责声明】以下全部内容由[姚开泰]上传于[2005年03月08日 17时55分46秒]，版权归原创者所有。本文仅代表作者本人观点，与本网站无关。本网站对文中陈述、观点判断保持中立，不对所包含内容的准确性、可靠性或完整性提供任何明示或暗示的保证。请读者仅作参考，并请自行承担全部责任。
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