有向基因组移位排序问题的O(n2)快速算法，成果详细信息-中国科技论文在线

朱大铭

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期刊论文

有向基因组移位排序问题的O(n2)快速算法

朱大铭，刘晓文) ，朱大铭) ，马绍汉) ，李子茂) ，王鲁生)

计算机学报第，2004，27（10），-0001，（）：

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摘要/描述

有向基因组移位排序问题在计算生物学研究中占有重要位置。以前最好的算法时间复杂度为0（n2logn)，该文给出一个有向基因组移位排序的新多项式算法，将移位排序的时间复杂度改进为O（n2）。算法改进的关键在于找到一种寻找有效合理移位的新方法，通过在最小子排列中删除无关顶点确定一个合理移位是否有效，从而将寻找一个有效移位的时间复杂度改进为O（n），总时间复杂度由此降为O（n2）。

关键词: 基因组，移位，计算生物学，算法，时间复杂度

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