林魁
主要从事生物信息学和进化基因组学方面的教学和研究工作。
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- 姓名:林魁
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- 担任导师情况:
- 学位:
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学术头衔:
博士生导师
- 职称:-
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学科领域:
遗传学
- 研究兴趣:主要从事生物信息学和进化基因组学方面的教学和研究工作。
林魁博士,教授、博士生导师、“985创新团队”研究员。1983年6月本科毕业于兰州大学数学力学系,获理学学士学位(数学); 1990年6月获兰州大学理学硕士学位(应用数学);1997年6月获兰州大学理学博士学位(生态学);1998年1月至12月在新加坡国立大学(National University of Singapore)生物信息学中心做生物信息学的博士后研究;1999年1月至2002年先后在新加坡国立大学生物信息学中心(Research Fellow, Bioinformatics Centre, National University of Singapore)、分子与细胞生物学研究院(Research Fellow, Institute of Molecular and Cell Biology,Singapore)和新加坡基因组研究院(Research Scientist, Genome Institute of Singapore)从事生物信息学研究;2002年8月回国并作为优秀人才引进到北京师范大学生命科学学院任副教授并担任北京师范大学计算分子生物学校级重点实验室主任;2005年底获博士生指导教师资格;2005年底起任985创新团队研究员。从2002年8月起,主要从事生物信息学和进化基因组学方面的教学和研究工作。
申请者在回国后5年多的独立工作主要有:1)微生物基因组进化研究:利用原核生物基因组中普遍存在的重叠基因这一遗传标记,首次提出并实现了一种基于物种间共有的同源重叠基因而进行基因组间进化关系的度量。该方法避免了大量水平基因转移及基因顺序不保守等非有序进化事件对物种系统发育分析的影响。2)蛋白与蛋白相互作用网络的构建与分析:在全基因组水平上设计的计算方法已成功地应用于酵母菌基因组中,与其它的方法相比我们得到了更加全面的相互作用数据集,同时还能得到高质量的负数据集。3)蛋白质相似性比较研究:首次提出并实现了在整个蛋白质结构域架构的水平上对蛋白进行相似性比较的算法,实际的研究表明该方法能更好地体现蛋白之间的进化关系。4)真核生物内含子进化研究:采用基因内比较方法,研究了21个已经完全测序的真核生物基因组内编码蛋白质基因的内含子位置分布的规律,为进一步探讨内含子的位置与可变剪切的关系打下良好的基础。
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【期刊论文】An initial strategy for comparing proteins at the domain architecture level
林魁
,-0001,():
-1年11月30日
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【期刊论文】Overlapping genes as rare genomic markers:the phylogeny of g-Proteobacteria as a case study
林魁
,-0001,():
-1年11月30日
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-1年11月30日
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-1年11月30日
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