丁小余
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- 姓名:丁小余
- 目前身份:
- 担任导师情况:
- 学位:
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学术头衔:
博士生导师
- 职称:-
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学科领域:
植物学
- 研究兴趣:
丁小余博士
学习工作经历:
1986年毕业于南京师范大学生物学系生物学专业,获理学学士学位。
1989年毕业于南京师范大学生物系植物学专业,获理学硕士学位;
2001年中国药科大学博士研究生毕业,获理学博士学位;
1989.7—1991.6南京师范大学生物学系 助教;
1991.7—1996.5南京师范大学生物学系 讲师;
1996.6—2003.5南京师范大学生命科学学院 副教授;
2003.6— 南京师范大学生命科学学院教授、博士生导师;
植物资源与环境研究所所长。
学术兼职:
权威期刊《药学学报》第10届编委会编委;
核心专业期刊《植物资源与环境学报》等编委;
淮阴师范学院兼职教授;
中国植物学会“药用植物与植物药”专业委员会委员;
江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室学术委员会委员;
担任了国家自然基金、教育部及江苏省自然科学基金及奖励的通讯评审专家。
担任了Plant Medica, Plant Science, Plant Systematics and Evolution,Journal of Integrative Plant Biology, European Food Research and Technology,Journal of the Science of Food and Agricultrue等SCI期刊,以及药学学报、植物资源与环境学报、南京林业大学学报、武汉植物学研究、上海交通大学学报、华南理工大学学报等十多个国内外专业核心期刊的审稿人。
所主持的主要课题:
1. 国家自然科学基金:中国特有濒危铁皮石斛的亲缘地理学与保护遗传学研究 (30870234),2009.1-2011.12,主持人。
2. 国家自然科学基金:铁皮石斛居群的遗传结构及道地性种质的分子标记(30370144),2004.1-2006.12,主持人。
3. 南京师范大学”十一五”“211” 重点学科项目:长江三角洲植物资源的分子生物学研究与利用2009.1-2012.12,主持人。
4. 江苏省自然科学基金:铁皮石斛的谱系鉴定及保护遗传学研究(BK2008431),2008.1-2010.12,主持人。
5. 江苏省自然科学基金:泽泻道地性居群的分子标记及引种江苏的GAP研究(BK2003101), 2003.1-2005.12,主持人。
6. 国家教育部博士点基金:濒危粉花石斛的遗传结构与亲缘地理学研究(20093207110006),2010.1 -2012.12,主持人。
获奖情况:
1. 获2002年度江苏省优秀博士论文奖;
2. 关于枫斗类石斛DNA barcoding鉴定方面的论文获2007年度第五届中国科协期刊优秀论文奖;
3. 江苏省优秀教学成果二等奖;
4. 所授“植物生物学”课程被评为江苏省一类优秀课程;
5. “珍稀中药材石斛的鉴定和质量评价研究” 获2008年国家教育部自然科学一等奖。
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丁小余, , 徐珞珊*, 王峥涛, 徐红, 周开亚
药学学报,2002,37(11):897-901,-0001,():
-1年11月30日
目的设计出齿瓣石斛的位点特异性鉴别引物,仅通过PCR就能完成对齿瓣石斛真伪进行准确鉴别。方法根据齿瓣石斛及其他枫斗类、黄草类石斛的rr)NAlls序列数据库,设计了齿瓣石斛的位点特异性PcR鉴别引物JB-Chinban-01S和J-B-Chibsn-01X。然后,对38种石斛属植物模板DNA进行了PCR扩增,阳性者即为齿瓣石斛正品。结果当退火温度设定为58℃时,只有齿瓣石斛的模板DNA能被扩增出来,而其他的37种石斛属植物均为阴性。该鉴别反应重复性好,已在鉴别齿瓣石斛时发挥重要作用。结论运用位点特异性鉴别引物能成功地对齿瓣石斛进行PCR鉴别,与DNA测序鉴别方法相比,位点特异性PCR具有高效、准确、简便、省时等优点。
齿瓣石斛, 位点特异性PCR, 鉴别
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【期刊论文】枫斗类石斛rDNA ITS区的全序列数据库及其序列分析鉴别
丁小余, *, 王峥涛, 徐红, 徐珞珊, 周开亚
药学学报,2002,37(7):567-573,-0001,():
-1年11月30日
目的建立枫斗类石斛的rDNA ITS区碱基全序列数据库,利用该数据库对枫斗类石斛待检种进行准确鉴别。方法对枫斗类石斛的rDNA ITS区进行了PCR扩增、测序,运用CLUSTRAL,MEGA等软件以及枫斗类石斛rDNA ITs区全序列数据库对待检种rDNA ITs区进行序列分析鉴别。结果建立了21种枫斗类石斛的rDNA ITs区全序列数据库,枫斗类石斛在该区的种司差异显著而稳定,转换和颠换总数为11~122,变异位点数为341,信息位点数为195。与外类群植物云南石仙桃司的差异较大,转换和颠换总数为132~161。枫斗类石斛居群司的差异较小,转换和颠换总数为0~6。结论利用枫斗类石斛的全序列数据库及遗传分析软件,通过对待检种rDNA ITs区进行序列测定,可以成功鉴别属于数据库中枫斗类石斛的待检种。
石斛属, 枫斗类石斛, rDNA ITS区全序列, DNA分子鉴别
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【期刊论文】铁皮石斛居群差异的研究(Ⅰ)——植物体形态结构的差异
丁小余, , 徐珞珊, 王峥涛, 施国新, 徐红*
中草药,2001,32(9):828~831,-0001,():
-1年11月30日
目的比较分析广西、贵州、云南三省区的铁皮石斛主要居群形态结构的差异。方法运用光镜对铁皮石斛茎进行比较解剖。结果将采集到的我国铁皮石斛主产区的主要居群分为二种类型:F型和H型。F型植株的茎相对短而柔软,具粘性,适宜加工成铁皮枫斗,其中广西西林居群和云南广南居群茎的表皮具较丰富的蜡质,不具下皮层,横切面上维管束密度小,维管束内外侧纤维群不发达,茎尤为柔软,是加工铁皮枫斗的优质居群。H型植株的茎较、质地较硬、粘性差,不适宜加工成铁皮枫斗。结论F型和H型居群铁皮石斛茎的形态结构具有明显差异,弄清铁皮石斛居群差异对指导铁皮石斛的采惚加工以及大面积人工繁殖具有重要意义。
铁皮石斛, 形态结梅, 居群差异
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丁小余, 徐红, 李晓波, 王峥涛*, 徐珞珊, 周开亚
药学学报,2001,36(10):777-783,-0001,():
-1年11月30日
目的研究黄草石斛ITS片段遗传多样性,分析该片段在黄草药材DNA分子鉴别和石斛属植物系统学研究中的意义。方法用一对引物进行PCR扩增,扩增产物纯化后用双脱氧终止法(Sanger dideoxy)测序。结果获得核糖体DNA中ITS和5.8S rDNA完整序列,14个石斛类群的ITS1与ITS2序列的长度分别为228-233bp和242-247bp。石斛种间ITS1序列的差异百分率为11.79%-31.58%,ITS2序列的差异百分率为10.29%-25.30%,金钗石斛种内ITS1序列的差异百分率为0.87%,ITS 2序列无差异。石斛各类群与外类群的差异百分率ITS1序列为23.56%-36/89%,ITS2序列为26.52%-33.31%。用NJ法根据ITS1与ITS2序列数据重建系统发生树。结论两段序列在石斛种内保守,在种间有较大的差异,与外类群的差异最大,可作为中药黄草石斛分子鉴定的标记,而石斛属的系统发生关系尚须进一步研究。
石斛属, 黄草, ITS序列
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【期刊论文】F型、H型居群的铁皮石斛rDNA ITS区序列差异及SNP现象的研究
丁小余, , 王峥涛, 徐珞珊, 徐红, 周开亚, 施国新
中国中药杂志,2002,27(2):85~89,-0001,():
-1年11月30日
目的:研究铁皮石斛主产区F型和H型居群rDNA ITS碱基序列的差异。方法:运用PCR直接测序法对广西、贵州、云南铁皮石斛主要居群的rI]NAITs区(包括ITS1,5.8S rDNA,ITS2)碱基序列进行了序列测定。结果:在铁皮石斛各居群中,F型居群与H型居群植株的rDNAITs区碱基序列有2个位点差异,且变异分别发生在ITS1区及5.8S区内。研究表明:铁皮石斛居群内部rDNA ITS区的差异与植物生活型的差异呈一定的相关性,H型居群的铁皮石斛是F型的变种。在F型与H型居群司,其5.8S rDNA区存在单核苷酸多态(SNP)现象。首次报道了铁皮石斛ITS区的碱基序列,ITS区总长度为634 bp,其中ITS1为231bp,5.8s为163bp,ITS2为240bp。结论:mNAITs区碱基序列的比较分析进一步证明铁皮石斛F型居群与H型居群司具有显著的差异性。
铁皮石斛, rDNA ITS区, DNA序列, 单核苷酸多态(, SNP), , 居群差异
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丁小余, 施国新, 陈维培
植物学报,1996,38(6):426~430,-0001,():
-1年11月30日
荇菜(Nymphoides peltatum(Gmel.)O. Kuntz)腺毛由具分泌功能的单列圆筒状细胞组成。它们起源于苗端倒数第二叶原基近轴面, 由原表皮细胞发育而来。处于分泌期的腺毛细胞其胞质浓厚, 液泡化程度小。细胞内具丰富的线粒体、高尔基体和内质网等细胞器, 还具发达的胞间连丝。粘液物质由高尔基体分泌小泡、内质网分泌小泡及多膜体共同携带至细胞边缘, 经胞吐和渗透相结合的方式分泌至细胞外。腺毛细胞侧壁因积有大量分泌物而呈膨胀状态。经检测, 粘液由多糖和蛋白质组成, 对营养芽的生长发育起保护作用。
荇菜, 腺毛, 发育, 分泌, 超微结构。
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【期刊论文】铁皮石斛居群差异的研究ⅡISSR指纹标记方法的建立与优化
丁小余, 沈洁, 丁小余*, 丁鸽, 刘冬扬, 唐凤, 贺佳
中国中药杂志,2006,31(4):291~294,-0001,():
-1年11月30日
目的:针对铁皮石斛ISSR的反应特点,建立稳定可靠的ISSR分子指纹标记反应体系,为进一步研究铁皮石斛的居群差异奠定基础。方法:通过筛选引物并设定影响铁皮石斛ISSR反应的诸因子的不同浓度,检测ISSR不同反应体系的扩增效果;通过分析非特异性条带的产生原因并进行条件优化,建立铁皮石斛ISSR稳定可靠的反应体系。结果与结论:首次建立了可用于铁皮石斛ISSR-PCR分析的最适宜的反应体系:25止P(m反应体系中,10×Taq酶配套缓冲液,1.5 U Taq DNA聚合酶,1.2~1.8mmol•L-1MgCl2,80μmol•L-1dNTP,0.2μml•L-1引物,DNA模板约20ng,退火温度52~60℃;实验表明:Taq酶质量、DNA模板品质、退火温度等对ISSR反应结果具有较大影响。所建立的铁皮石斛ISSR反应体系具有标记位点清晰、反应系统稳定、检测多态性能力较强、重复性好等特点,可以较好地应用于铁皮石斛的居群鉴别及居群分子生态的研究。
铁皮石斛居群, ISSR反应体系, 建立与优化
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丁小余, 保曙琳, 丁小余*, 常俊, 沈洁, 唐凤*
中草药,2004,35(8):926~930,-0001,():
-1年11月30日
目的野生菱和栽培菱种rDNA ITS片段进行分析,探讨该片段在两大群体中的系统学及鉴别研究意义。方法对菱的rDNA ITS区进行了PCR扩增、测序,运用Clustal、Mega210等软件对ITS 区进行序列分析鉴别。结果获得rDNA ITS1 、ITS2和518S rDNA完整序列,10个居群菱的ITS1与ITS2序列的长度分别为234~236 bp 和220~221bp,518S区均为164bp,不同居群的碱基差异为0.22%~2.94%。变异位点数为16个,信息位点数6个。用NJ法根据ITS序列数据构建系统发生树。结论尽管菱属各居群间rDNA ITS的差异百分率较小,其亲缘关系较近,但根据ITS 序列的特征可以很好地鉴别野生菱、栽培菱,菱属植物有可能都起源于同一种野生类居群。
菱属, rDNA ITS 序列, 种质鉴别, 物种起源
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【期刊论文】花椒及其混淆品的rDNA ITS区序列分析与鉴别
丁小余, 沈洁, 丁小余*, 张卫明, 保曙琳, 常俊, 唐凤
药学学报,2005,40(1):80-86,-0001,():
-1年11月30日
目的研究不同居群的花椒及其混淆品的rDNA ITS区碱基序列的特征及其差异,为花椒的鉴别提供可靠的分子标记。方法运用PCR产物直接测序和克隆测序法对甘肃、陕西、四川、河北等7个花椒居群及3个混淆种的rDNA ITS区(包括ITS1,5.8S,ITS2)碱基序列进行序列测定。结果首次报道花椒ITS区的碱基序列,序列总长度为619-620bp,长度变异较少,与混淆种长度仅相差4bp。花椒各居群中,rDNA ITS区碱基序列有15个变异位点、12个信息位点、3个特异性识别位点。与混淆品问的碱基差异则较为显著,多达71个变异位点,有4个花椒特异性识别位点。结论依据花椒ITS区的序列特征可准确鉴别各居群的花椒及其混淆品;亲缘关系密切的花椒居群在地理位置上也非常靠近;rDNA ITS序列特征可作为花椒种内和种间鉴别的有效分子标记。
花椒, 居群, 混淆品, rDNA ITS区, DNA分子鉴别
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