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孙杰

棉花遗传育种、植物基因工程。

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姓名：孙杰
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担任导师情况：
学位：
学术头衔：

博士生导师
职称：-
学科领域：

作物育种学与良种繁育学
研究兴趣：棉花遗传育种、植物基因工程。

个人简介

孙杰，博士，教授，博士生导师，主要研究领域：棉花遗传育种、植物基因工程。1991年7月毕业于新疆农业大学农学系，获得学士学位；1994年9月至1997年7月，石河子大学作物遗传育种专业硕士研究生，获得硕士学位。1999年9月至2003年6月，中国农科院研究生院（棉花所）博士研究生，获博士学位；2010年1月至2010年7月，美国加州大学戴维斯分校植物生物学系访问学者。近几年发表论文50余篇，其中SCI收录3篇，选育棉花新品种3个，参加和主持各类科研课题15项。

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2011-05-23

【期刊论文】陆地棉棕色纤维色泽的遗传效应

孙杰，冯鸿杰，，王杰，孙君灵，张新宇，贾银华， *，杜雄明

作物学报，2010，36（6）：961～967，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

以2个棕色和3个白色纤维陆地棉做完全双列杂交，分析陆地棉棕色纤维的遗传效应、长绒与短绒的遗传相关及F1的色泽差异。用扫描仪获取长绒和短绒图像，利用Photoshop9.0获取图像RGB信息、量化纤维色泽。按照QGAStation软件中的ADM和AD模型，采用MINQuE法分析，调整无偏预测法（AUP）预测各遗传效应值。结果表明，棕色棉的长绒和短绒的遗传规律一致，其加性和显性遗传方差均极显著，其中，长绒的加性遗传方差比率为0.8501，约为显性遗传方差比率的6倍，短绒的加性遗传方差比率为0.8726，约为显性遗传方差比率的8倍；相关分析显示长绒和短绒的基因型和表现型均达显著相关，基因型相关系数达0.9935；5个亲本加性效应均不相同，但均达极显著水平，其中，棕色棉为正效应，白色棉为负效应。说明棕色纤维陆地棉的长绒和短绒色泽的遗传变异主要来自加性和显性效应，其中加性效应起主导作用；长绒和短绒的色泽遗传存在连锁和互作；因不同品种（系）的加性效应大小不同，造成不同F1纤维色泽的表现差异。

天然棕色棉，遗传效应，纤维色泽，遗传分析

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2011-05-23

【期刊论文】棉纤维特异表达蓝铜蛋白基因（GhBCP1）的克隆与鉴定

孙杰，田琴，李艳军，郭芳，张新宇，王海云

中国农业科学，2010，43（3）：612-617，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

【目的】对从棉纤维细胞分离获得的基因GhBCP1进行序列和表达分析，初步分析其功能。【方法】采用mRNA荧光差异显示结合cDNA末端快速扩增技术克隆基因全长cDNA序列，用生物信息学方法对获得的cDNA序列及推定氨基酸序列进行分析，并用荧光实时定量PCR法研究基因在不同组织中的表达。【结果】克隆了一个棉纤维特异表达基因的全长cDNA，命名为GhBCP1（GenBank登录号：EF222282），该cDNA全长721bp，含有一个编码176个氨基酸蛋白的开放阅读框。BLAST分析表明该基因所编码产物为一个蓝铜蛋白。Southern杂交分析表明该基因在陆地棉（Gossypium hirsytumL.）中有2个拷贝。实时荧光定量PCR分析发现该基因在棉花纤维细胞特异表达，在纤维发育过程中，GhBCP1转录产物的累积主要发生在纤维细胞发育由伸长向次生壁合成转换阶段。【结论】GhBCP1基因的组织特异性和发育阶段性表达初步证明该基因的功能可能与次生壁合成的起始密切相关。

棉花，纤维，蓝铜蛋白，特异表达

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2011-05-23

【期刊论文】天然棕色棉查尔酮合成酶基因(GbCHSl)的克隆和实时定量表达分析

孙杰，杨会娜，田新惠，李艳军，李明月，冯鸿杰，孙杰*

棉花学报，2010，22（1）：42～48，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

根据植物查尔酮合成酶基因保守区序列设计引物，以发育18d的天然棕色棉纤维为材料，用RT-PCR结合RACE技术分离得到了一个查尔酮合成酶基因的全长cDNA（GenBank登录号：EU921263），将该基因命名为GbCHSl。实时荧光定量PCR检测显示。GhCHSl基因在棕色棉纤维细胞中优先表达，且在棕色棉纤维中的表达量远高于其近等基因系白色棉，但是该基因在绿色棉中几乎检测不到。这些试验结果暗示。该基因可能在棕色棉纤维色素形成中发挥重要作用。

查尔酮合成酶，天然彩色棉，实时定量RT-PCR

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2011-05-23

【期刊论文】基于UV光谱扫描天然彩色棉色素定量测定方法研究

孙杰，田琴，张小均，张新宇

新疆农业科学，2009，46（6）：1188～1191，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

【目的】测定彩色棉色素含量。【方法】对不同浓度天然彩色棉纤维色素粗提液扫描分析。【结果】绿色棉纤维色素提取液在252舢附近吸收峰随色素浓度减小向短波长方向小幅度移动，棕色棉纤维色素吸收峰随浓度减小向紫外短波长方向移动幅度较大。对色素粗提液200～700nm所有吸收值与相对浓度的相关系数进行筛选，选择最大相关系数对应波长为定量分析特征波长，确定绿色棉纤维提取液定量分析特征波长为417nm，棕色棉纤维提取液定量分析特征波长为613nm，并且建立直线回归方程，回归方程分别为：C绿=0.0535A，R2=0.9965；C棕=0.0217A，R2=0.9878。相关系数均达到0.99以上。【结论】彩色棉纤维色素吸收值对相对浓度的回归方程有明确意义。

天然彩色棉，色素，定量分析， UV光谱

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2011-05-23

【期刊论文】TRAP转运体——一种新的依赖于胞外溶质结合受体的转运系统

孙杰，王永宝，，陈爱民，王彦章

《生命的化学》，2009，29（6）：789～793，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

TRAP转运体（tripartite ATP-independent periplasmic transporter，TRAP-T）是近期发现的一类溶质吸收系统，广泛存在于原核生物中。该转运体具有一个与ABC转运系统相似的胞外溶质结合受体（extracy toplasmic solute-bindingreceptor，ESR），是一类新的依赖于ESR的二级主动转运系统，它利用离子电化学势梯度而不是ATP水解，为溶质吸收提供能量。对于少数TRAP-T的溶质底物和生理作用的研究，揭示了TRAP-T不仅具有高度的溶质亲和性，而且其组分也可以被招募行使其他功能。本文综述了TRAP-T的组成、调控机制及其功能的研究进展。

TRAP转运体，胞外溶质结合受体， ABC转运系统，溶质吸收系统

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2011-05-23

【期刊论文】拟南芥mRNA及其靶序列配对特征分析

孙杰，刘冲，，范云六，王磊

中国农业科技导报，2009，11（4）：53～57，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

microRNAs（miRNAs）是真核生物中一类长度约为22nt的非编码小分子RNA，miRNA与AGO等蛋白形成RISC沉默复合体，通过剪切或翻译抑制对靶基因起负调控作用。对拟南芥miRNA序列及其配对的靶序列间的特征进行了统计分析，结果表明miRNA序列5'端富含A、U，第1、第19碱基位对U、C具有较强的倾向性；miRNA与靶序列间常有l～4个碱基错配，错配碱基常出现在第1，第2和第21位，而第3～第6，第9～第10，第16～第17碱基配对较为保守，为人工合成miRNA的设计及miRNA靶基因的预测以提供了依据。

拟南芥，基因沉默， RNAi，微小RNA，人工小RNA

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2011-05-23

【期刊论文】两种不同熟性陆地棉品种在北疆棉铃发育比较研究

孙杰，唐钱虎，张新宇，李艳军

新疆农业科学，2009，46（4）：715～718，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

选用两种熟性不同的棉花品种，在北疆比较其棉铃发育及适应性，结果表明：特早熟品种新陆早10号和新陆早13号棉铃生长发育快，蕾铃多，但蕾铃脱落率较高，植株自下而上果枝第一果节棉铃发育所需积温逐渐减少；早中熟品种中棉所35号和冀棉668生育期较长，比特早熟棉长7～8d，棉铃的成铃率较高，单株平均成铃数也比早熟棉多1.2～2.5个，中部和下部棉铃发育所需积温变化不大，但自上部第6果枝棉铃发育所需积温明显减少。

北疆，陆地棉，棉铃发育

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2011-05-23

【期刊论文】利用抑制差减杂交技术分离棕色棉纤维特异表达基因

孙杰，李艳军，张新宇，杨会娜，田新惠，孙杰*

分子植物育种，2009，7（1）：194～198，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

采用棕色棉新彩棉5号为Tester，其白色近等基因系NIL-C5为Driver，通过抑制差减杂交法（sup-pressivesubtractivehybridization，SSH）构建了一个棕色棉纤维色素差异表达基因差减文库。从文库中随机挑选400个克隆，将这些克隆的PCR产物点膜进行反向Northern杂交检测，挑选20个差异明显的克隆进行序列分析，结果表明：有5个eDNA片段与已知的功能基因序列相似，其中1个cDNA片段与合成色素的重要酶基因4-香豆酸；CoA连接酶（4CL）基因有较高的同源性，其它cDNA片段在数据库中未找到同源序列。

彩棉,，抑制扣除杂交,，差异基因

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2011-05-23

【期刊论文】天然彩色棉纤维色素提取及光谱特性研究

孙杰，张小均，田新惠，李明月，刘海峰，李少昆，宋武，孙杰*

棉花学报，2008，20（2）：133～136，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

以白色棉、绿色棉、棕色棉成熟纤维为材料，选用氯仿、乙酸乙酯、乙酸乙酯-乙醇（1：1）、乙醇、蒸馏水等5种不同的中性溶剂，分别对经石油醚脱脂后的不同颜色纤维中色素进行提取。结果表明，绿色棉纤维色素乙酸乙酯-乙醇（1：1）提取效果最好，棕色棉纤维色素蒸馏水提取效果最好；绿色棉纤维色素乙酸乙酯-乙醇（1：1）提取液有3个吸收蜂，由弱到强分别在252nm、300nm和328nm，其色素随相对浓度减小，光吸收值相应变小，300nm和328nm处吸收峰的光吸收值与浓度的变化有明显的线性关系；棕色棉纤维色素蒸馏水提取液在237nm处有1个吸收峰，其色素随相对浓度的减小，光吸收值也相应交小，但吸收峰迅速向紫外短波长方向移动。

天然彩色棉，色素，光谱特性

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2011-05-23

【期刊论文】蒺藜苜蓿子叶节高频再生系统的建立

孙杰，冯利兴，傅力，刘伟，陈爱民，王彦章

草业科学，2008，25（8）：52～56，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

通过直接的芽嚣官发生途径。建立了蒺纂苜蓿Medicngotruncatual子叶节外植体的高频植株再生体系。选用在高达5mg/L6-苄氨基嘌呤（6-BA）的种子萌发培养基上生长3d的蒺苜苜蓿幼苗，制备获得由1片子叶和半个胚轴组成的子叶节外植体。以SH培养基为基本培养基。对不同浓度a-萘乙酸（NAA）和6-BA组合诱导不定芽形成条件进行优化的结果表明。不定芽诱导培养基中仅用浓度为4mg/L6-BA的平均不定芽数达到3.56。显著优于与其它生长调节物质组合的处理。

蒺藜苜蓿，子叶节外植体，植株再生

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2011-05-23

【期刊论文】TRAP转运体——一种新的依赖于胞外溶质结合受体的转运系统

孙杰，王永宝，，陈爱民，王彦章

《生命的化学》，2009，29（6）：789～793，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

TRAP转运体，胞外溶质结合受体， ABC转运系统，溶质吸收系统

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2011-05-23

【期刊论文】棉纤维特异表达蓝铜蛋白基因（GhBCP1）的克隆与鉴定

孙杰，田琴，李艳军，郭芳，张新宇，王海云

中国农业科学，2010，43（3）：612-617，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

棉花，纤维，蓝铜蛋白，特异表达

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2011-05-23

【期刊论文】蒺藜苜蓿子叶节高频再生系统的建立

孙杰，冯利兴，傅力，刘伟，陈爱民，王彦章

草业科学，2008，25（8）：52～56，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

蒺藜苜蓿，子叶节外植体，植株再生

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2011-05-23

【期刊论文】天然棕色棉查尔酮合成酶基因(GbCHSl)的克隆和实时定量表达分析

孙杰，杨会娜，田新惠，李艳军，李明月，冯鸿杰，孙杰*

棉花学报，2010，22（1）：42～48，-0001，（）：

-1年11月30日

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查尔酮合成酶，天然彩色棉，实时定量RT-PCR

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2011-05-23

【期刊论文】基于UV光谱扫描天然彩色棉色素定量测定方法研究

孙杰，田琴，张小均，张新宇

新疆农业科学，2009，46（6）：1188～1191，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

天然彩色棉，色素，定量分析， UV光谱

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【期刊论文】陆地棉棕色纤维色泽的遗传效应

孙杰，冯鸿杰，，王杰，孙君灵，张新宇，贾银华， *，杜雄明

作物学报，2010，36（6）：961～967，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

天然棕色棉，遗传效应，纤维色泽，遗传分析

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2011-05-23

【期刊论文】棉花微管蛋白基因GhTub1在纤维细胞中的特异表达*

孙杰，李园莉①，孙杰①， ②，李春红③，朱勇清③，夏桂先①**

中国科学（C辑），2002，32（5）：385～391，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

以陆地棉（Gossypium hirsutum）纤维发育前期和中期的胚珠及纤维细胞为材料构建cDNA文库，通过ESTs分析获得了一个β-微管蛋白家族成员（GhTub1）。以该cDNA的3’-UTR为探针，利用Northern杂交方法，对GhTub1基因在棉花不同器官及棉纤维不同发育阶段的表达进行了分析，发现该基因的表达具有棉纤维细胞特异性。在纤维发育过程中，GhTub1转录产物的累积主要发生在纤维细胞延伸阶段，在纤维延伸速度最快时达到高峰。利用裂殖酵母系统，对GhTub1的细胞内功能进行了初步分析，发现该基因在酵母中过量表达能使其细胞显著伸长或分支。这些实验结果暗示GhTub1基因可能在纤维细胞的极性延伸中具有功能。

棉花，微管骨架， β-微管蛋白，纤维发育

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【期刊论文】两种不同熟性陆地棉品种在北疆棉铃发育比较研究

孙杰，唐钱虎，张新宇，李艳军

新疆农业科学，2009，46（4）：715～718，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

北疆，陆地棉，棉铃发育

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2011-05-23

【期刊论文】拟南芥mRNA及其靶序列配对特征分析

孙杰，刘冲，，范云六，王磊

中国农业科技导报，2009，11（4）：53～57，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

拟南芥，基因沉默， RNAi，微小RNA，人工小RNA

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2011-05-23

【期刊论文】豆科模式植物——蒺藜苜蓿

孙杰，陈爱民，，连瑞丽，王彦章， *

植物生理学通讯，2006，42（5）：997～1003，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

蒺藜苜蓿（Medicagotruncatula）是国际上广泛用于研究仅属于豆科植物或者与之有关的某些生物过程的豆科模式植物，这些生物过程无法采用模式植物拟南芥进行研究。蒺藜苜蓿的基因组较小，二倍体，遗传学简单，遗传转化相对容易，再生时间较短。2003年，国际间合作的蒺藜苜蓿基因组测序计划已经启动。文章概述了蒺藜苜蓿基因组测序、生物信息数据库、遗传转化系统以及功能基因组研究工具的研究进展。

蒺藜苜蓿，基因组，遗传转化，遗传突变

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