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2011年01月24日

【期刊论文】ARP-SRP基因表达谱芯片对脑损伤的初步研究

周亦武, 张益鹄, 邓伟年, 刘艳, 胡志红

Journal of Forensic Medicine, August 2002, Vol. 18. No.3,-0001,():

摘要

目的研究脑挫伤后ARP-SRP基因表达谱差异及其法医学意义。方法从脑组织提取mRNA,应用ARP-SRP-1.OS基因芯片,研究脑挫伤组织与对照脑组织细胞凋亡蛋白和应激反应蛋白相关基因特异性表达差异。结果基因芯片杂交结果中,发现人类溶酶体的胃蛋白酶抑制剂不敏感蛋白酶基因fCLN21表达水平显著下降。结论CLN2基因与一种婴儿致死性神经变性疾病LINCL有关,但CLN2基因在脑损伤中的作用尚有待进一步研究;基因芯片在研究脑损伤后相关基因的改变具有快速、高通量、高敏度等特点。

关键词: 基因芯片, 微矩阵基因芯片, 基因表达谱 差异表达, 脑损伤

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2011年01月24日

【期刊论文】OTS-2.2S基因芯片对人脑挫伤后基因表达差异的初步研究

周亦武, 张益鹄, 刘艳, 邓伟年, 王成毅

法医学杂志,2004,20(2):77~81,-0001,():

摘要

目的利用基因芯片技术,研究人挫伤脑组织中基因表达差异。方法从脑组织提取mRNA,通过OTS-2.2S基因芯片,研究脑挫伤组织与对照脑组织细胞原癌及抑癌相关基因特异性表达差异。结果发现在挫伤脑组织中,HoJ-1和KlAAOO65基因表达水平显著下降,而p107mRNA表达水平显著升高。结论在脑挫伤中仅发现3条基因的表达有显著性差异;本研究是对脑损伤后基因表达水平及其法医学意义进行的探索性研究。

关键词: 微矩阵基因芯片, 基因表达谱 脑挫伤, 原癌基因, 抑癌基因

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2009年09月06日

【期刊论文】大鼠退变颈椎间盘组织基因表达谱的研究

施杞, 王拥军, 李家顺, 贾连顺

第二军医大学学报,2002,23(12):1335~1338,-0001,():

摘要

目的:研究正常和退变模型大鼠颈椎间盘的基因表达谱,分析大鼠颈椎间盘基因表达水平的变化,用于指导诊断和治疗。方法:建立动静力失衡性大鼠颈椎间盘退变模型,从造模后5个月对照组和模型组大鼠颈椎间盘中抽提mRNA,经逆转录分别用cy3、Cy5荧光标记,获得两组动物椎间盘cDNA 的探针,再与512cDNA 基因表达谱芯片杂交,结果由激光扫描仪扫描并用软件进行图像分析、标准化处理、ratio值分析、聚类分析。结果:共筛选出18条表达有差异的基因,11条基因表达量明显下降(ratio<0.4),其中细胞信号转导类有4条;7条基因表达量明显上升(ratio>2.5)。这些基因在颈椎间盘退变的表达模式与其他的报道类似。结论:退变大鼠椎间盘基因表达的调节发生变化,细胞内外的信号转导参与了椎间盘退变过程。

关键词: 基因芯片, 基因表达谱 椎间盘退变

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2009年08月07日

【期刊论文】胚胎肺和正常肺组织基因表达谱差异①

李殿俊, 张薇, 石玉枝l

癌变·畸变·突变 2004,16(2)92~100,-0001,():

摘要

背景与目的:利用基因芯片技术研究胚胎肺和正常肺组织基因表达谱差异,筛选出人肺在发育过程中基因的变化。材料与方法:分别抽取胚胎肺组织和证常肺组织的总RNA并纯化mRXA,用逆转录的方法,将备mRXA的两种荧光cy5和cy3标记的cDNA链做探针,并与含有l152条人类全长基因芯片上进行杂交。以ScanArrav4000荧光扫描仪扫描芯片上两种荧光信号,用计算机处理和分析。结果:胚胎肺和正常肺组织比较差异2倍以上基因共有317条,其中193条表达增加.124条表达降低。结论:胚胎肺和正常肺组织之问存在有基囡差异,初步证明人师组织在发育过程中受环境响。

关键词: 胚胎肺, 正常肺组织, 基因表达谱

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2009年04月06日

【期刊论文】基因表达谱及其在人体肿瘤研究中的应用

田勇泉, 刘仲奇, 田勇泉*

中南大学学报(医学版),2004,29(1):105~108,-0001,():

摘要

肿瘤发生是遗传、环境等多种致瘤因子共同作用的结果,经历了多个不同的发展阶段。每一阶段中机体机能的改变必然反应一系列基因功能的变化,构成机体在每一种机能状态时的特征性基因表达。要揭示肿瘤发生、发展的规律,最终找到攻克肿瘤的可靠途径,必须从研究肿瘤相关基因入手。基因芯片提供了一种大通量研究手段,通过基因芯片构建肿瘤相关基因表达谱,研究肿瘤相关基因在肿瘤发生、发展过程中的功能,就是找到了研究肿瘤发生、发展规律的金钥匙,为肿瘤病原、病因、病理学研究,各种肿瘤的临床诊断、治疗药物筛选、预后判断、治疗效果监测甚至肿瘤预防等领域的研究开辟了广阔的前景。

关键词: 肿瘤, 基因芯片, 基因表达谱

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2009年01月09日

【期刊论文】高糖对大鼠微血管内皮细胞基因表达谱的影响

高鑫, 张斌高, 鑫李欣

上海医学,2004,27(12):913~916,-0001,():

摘要

目的 研究高糖对SD大鼠肺微血管内皮细胞基因表达谱的影响,进一步探索高糖导致微血管内皮细胞功能紊乱的可能分子机制。方法 体外培养SD大鼠肺微血管内皮细胞,以Affymetrix公司的RG-U34A基因芯片分别检测正常浓度(5.56mmol/L)和高浓度(20mmol/L)D一葡萄糖培养基中培养24h后内皮细胞的基因表达谱。结果 高糖培养细胞较正常浓度糖培养细胞有961个基因表达下调,509个基因表达上调,其中变化幅度大于2倍的分别有22个(P>0.998)和11个(P<0.0025),这些基因主要与细胞物质代谢、细胞信息传递、细胞膜结构、细胞外基质合成及分解等有关。结论 高糖可能通过影响微血管内皮物质代谢、信号转导、细胞膜结构和细胞外基质等的表达而导致血管内皮功能紊乱。

关键词: 基因表达谱 微血管内皮细胞, 高浓度葡萄糖

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2006年10月25日

【期刊论文】胶原诱导性关节炎大鼠滑膜基因表达谱的cDNA微阵列研究

梁清华, 王安宇, 李春燕, 陈疆, 罗徐, 包太成

中华风湿病学杂志,2005,9(1):31-33,-0001,():

摘要

目的 研究胶原诱导性关节炎大鼠滑膜基因表达谱,探讨类风湿关节炎的发病机制。方法 用含588个基因的大鼠基因表达谱芯片研究胶原诱导性关节炎及正常大鼠滑膜基因表达谱。结果 胶原诱导性关节炎大鼠差异表达基因共有68个,上调基因有63个,下调基因有5个。结论 胶原诱导性关节炎是一个涉及多基因表达异常的全身免疫性疾病,筛选到的差异表达基因将为进一步研究类风湿关节炎发病机制及防治提供重要线索。

关键词: 基因表达谱 胶原, 关节炎, cDNA微阵列

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2006年05月31日

【期刊论文】肺腺癌酪氨酸激酶信号传导通路中基因异常表达的复杂性

吴一龙, WU Yi-long, LIN Jia-ying, YANG Xue-ning

肿瘤防治研究,2004,31(2)65~69,-0001,():

摘要

目的 探讨肺腺癌患者酪氨酸激酶信号传导通路的紊乱情况。方法 抽提10例肺腺癌标本及其癌旁组织的总RNA,标记荧光,与含13824个基因的基因芯片进行杂交,经洗片、扫描,计算机分析比较两种组织的差异表达基因。每次实验重复两次,结果取平均值,共进行20次杂交,最后统计分析酪氨酸激酶信号传导通路中各种组分的表达情况。结果在酪氨酸激酶信号传导通路中,5例以上标本差异表达的基因共67个,其中上调基因31个,下调基因36个,涉及配体、受体、相关酶类、转录因子及调控基因等。结论 肺腺癌患者酪氨酸激酶信号传导通路的异常是多个环节的,多种组分在转录水平上发生了不同程度的改变;生长因子与酪氨酸激酶介导的信号传导有不同程度的激活,而抗增殖和免疫防御的信号传导受到不同程度的抑制,表现出一种系统复杂性的状态。

关键词: 信号传递, 酪氨酸激酶, 基因表达谱 基因芯片, 肺肿瘤

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2006年07月07日

【期刊论文】神经干细胞分化与神经节细胞胶质瘤恶化相关分子研究

黄强, 王爱东, 董军, 王飞, 孙继勇, 兰青

肿瘤,2005,25(1):15-18,-0001,():

摘要

目的 神经干细胞分化障碍是否是神经胶质瘤发生的原因尚未定论,主要是分子变化规律还未阐明。本研究旨在探讨神经干细胞与神经节细胞胶质瘤分化的相关基因,为阐明胶质瘤起源的细胞分子病因创造条件。方法 对自建的神经节细胞胶质瘤恶变为多形性胶质母细胞瘤基因表达谱中的分化发育相关基因进行生物信息学聚类筛选,所得基因用RT-PCR方法检测其在体外培养神经干细胞分化过程中的表达变化。结果 基因谱中的CXCR4、TN-C、GLT1、ILl-RI、EGFR-8、CDC2、Ndr3和MAPKK4共8条基因的表达变化与神经干细胞分化相关,其中GLT1、CDC2和MAPKK4基因随神经干细胞分化而表达量下降,随神经节细胞胶质瘤恶性进展而表达量增高。结论 源于神经干细胞分化障碍所致的神经节细胞胶质瘤的进一步恶变(去分化)与神经干细胞分化过程中的基因GLT1、CDC2和MAPKK4等表达量呈负相关,在延伸研究中可作为胶质瘤起源细胞的分子病因的目标基因作诸如RNA干扰、基因转染或敲除等功能研究。

关键词: 神经系统, 干细胞, 神经节神经胶质瘤, 细胞分化, 基因表达谱 在体外

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2005年04月25日

【期刊论文】采用基因表达谱芯片技术筛选新基因AngRem104的功能相关基因

张宏, 粱秀彬, 王海燕

中华肾脏病杂志,2002,18(3):159~165,-0001,():

摘要

目的采用基因芯片技术来筛选新基因AngReml04的功能相关基因,为进一步的基因功能研究提供线索。方法建立新基因An小eml04的正义和反义表达的系膜细胞模型,应用含有4000个人类基因的eDNA表达谱芯片,对过量表达AngReml04基因和抑制表达An小eml04基因的人肾小球系膜细胞RNA表达进行检测。部分基因的差异表达由RT-PCR方法来验证。结果筛选出的差异表达基因共96个,其中94个基因上调表达,2个基因下调表达。差异表达的基因涉及到细胞外基质和受体蛋白、细胞信号传导相关基因、DNA结合及转录相关蛋白、免疫相关蛋白、细胞骨架和动力蛋白和细胞合成及代谢相关蛋白等。特别是纤连蛋白(FN)及整台素13l(integrib 131)表达明显上调。RT-PCR的方法也证实了An小eml04与FN表达的相关性。结论应用作为研究基因功能有效手段的基因表达谱芯片技术来筛选新基因AngReml04的功能相关基因,发现AngReml04与FN的表达有关,为其功能研究提供了重要线索。

关键词: 血管紧张素II, 纤连蛋白, 基因表达谱芯片

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2005年04月22日

【期刊论文】多囊卵巢综合征相关基因的差异表达研究

乔杰, 胡振兴, 乔杰△, 李美芝, 张小为, 陈咏健, 李蓉, 孙春玲

北京大学学报(医学版),2004,36(6):60~65,-0001,():

摘要

目的:研究多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)患者相关基因的差异表达。方法:应用人类全基因组基因芯片U133A,以体外受精一胚胎移植(in uitro fertilizatiorl embryo transfer, IVF-ET)的多囊卵巢综合征(polycyvstic ovarv syndrome, PCOS)患者和对照者取卵后所剩的卵泡颗粒细胞为研究对象,检测5例PcOs患者和5例对照者颗粒细胞中相关差异表达的基因。结果:与对照组比较,共筛查出与Pcos明显相关的差异表达基因46个,其中25个基因表达增加(上凋),21个表达减少(下调)。这些差肆表达基因具有多种生物学功能,如脂类代谢调节、细胞问的信号传导和免疫炎症反应,反映了PCOS患者临床症状的多样性。结论:应用基因芯片技术,可筛查出新的PCOS遗传相关候选基罔。

关键词: 多囊卵巢综合征, 卯泡颗粒细胞, 基因芯片, 基因表达谱

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2005年01月28日

【期刊论文】EF延缓HPAT轴衰老的基因表达谱研究①

沈自尹, 陈瑜, 黄建华, 胡作为

,-0001,():

摘要

目的:淫羊藿总黄酮(EF)延缓下丘脑-垂体-肾上腺-胸腺(IiPAT)轴衰老的分子机制。方法:利用基因芯片技术,分别检测淫羊藿总黄酮组、右归饮组、桃红四物汤组、老年大鼠对照组及青年大鼠对照组下丘脑、垂体、肾上腺、脾脏淋巴细胞的基因表达谱。结果:老年大鼠和青年大鼠相比,HPAT轴多种神经递质、激素、细胞因子或其受体表达下调;EF组HPAT轴多种神经递质、激素、细胞因子或其受体表达上调;右归饮组及桃红四物汤组未见广泛的调节作用。结论:老年大鼠HPAT轴与生长、发育、衰老相关的基因表达以衰退的表现为主;EF能上调神经递质受体的表达并通过NEI网络的下行通路激活神经内分泌和免疫系统;通过下调促凋亡、抗增殖基因,上调抗凋亡、促增殖基因的表达,重塑淋巴细胞基因表达的平衡,延缓免疫衰老。

关键词: 淫羊藿总黄酮, 衰老, HPAT轴, 基因表达谱

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2005年01月28日

【期刊论文】老年大鼠下丘脑-垂体-肾上腺-胸腺轴基因表达谱的研究

沈自尹, 黄建华, 陈瑜, 胡作为

,-0001,():

摘要

目的 阐明衰老时下丘脑一垂体一决策肾上腺一胸腺(HPAT)轴基因表达规律,探索神经内分泌和免疫衰老的分子机制。方法利用基因芯片技术研究老年大鼠与青年大鼠HPAT轴差异表达的基因。结果 老年大鼠下丘脑多种神经递质或其受体如GABA-AR、a1 ER、GluR、多巴胺转运蛋白表达下调;垂体多种促性腺激素包括FSH、LH、GnRH下调;生长激素和生长激素释放因子受体下调;脾淋巴细胞促凋亡基因caspase-1、caspase-3、CPP32β、Dnase7、PKC delta、Bnip31、p47上调,抗凋亡基因cathepsin B、MTAl下调,抗增殖基因Rb、BTGl表达上调,促增殖基因Jaggedl及c-myc、c-fos、v-jun、Rgc32、CyclinBl、CyclinG-associated kinase下调。结论衰老时HPAT轴的衰退以下丘脑-垂体-性腺轴、下丘脑-垂体-生长激素轴、免疫系统受损最为明显,神经递质、生长激素、促性腺激素基因低表达及免疫细胞促凋亡基因高表达而抗凋亡基因低表达,促增殖基因低表达而抗增殖基因高表达是受损的分子机制。

关键词: 衰老, 老年大鼠, 基因表达谱 下丘脑-垂体-肾上腺-胸腺轴

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2005年03月04日

【期刊论文】强直性脊柱炎病人关节液单核细胞基因谱的初步研究

古洁若

,-0001,():

摘要

目的 了解强直性脊柱炎病人关节液单核细胞(SFMC)基因的变化及其特点, 探讨与AS关节炎发生相关的基因及可能的意义。方法 采用含1176个基因cDNA微阵列检测5例AS,6例健康人和5例RA病人的基因表达,挑选其中9个AS SFMC表达异常的致炎,抗炎,信息传导基因或受体和黏附分子,扩大例数以半定量PCR再验证微阵列检测结果。结果 cDNA微阵列和PCR结果显示,AS的SFMC 1176基因图谱和阳性基因数量在RA和AS病人组无明显区别;比较AS或RA病人的SFMC和PBMC,则显示AS和RA的SFMC中的阳性基因均少于各自的PBMC;在RA的PBMC有53个基因明显高于RA SFMC(P<0.05),但在AS PBMC仅有5个基因明显高于AS SFMC(P<0.05)。AS病人SFMC的IL-1β,TNF-a;TGF-β,TGF-β2;c-jun, JAK-3显著高于健康人PBMC(p<0.05)。结论 AS患者的SFMC基因表达谱异常,但与RA的SFMC未见明显特征型区别,IL-1β,TNF-a;TGF-β,TGF-β2;c-jun JAK-3与AS关节炎的发生和发展相关。

关键词: 强直性脊柱炎, 关节液单核细胞, 基因表达谱

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2005年03月04日

【期刊论文】cDNA芯片技术在强直性脊柱炎研究中的初步应用

古洁若, 黄烽, 余得恩

,-0001,():

摘要

目的 了解强直性脊柱炎(AS)患者外周血单个核细胞(PBMC)基因表达谱与类风湿关节炎(RA)及健康志愿者有无差异,寻找疾病发生及炎症相关的异常变化基因,初步探讨其变化意义。方法 以含588个基因的cDNA微阵列检测7例活动期AS、6例活动期RA患者以及7例健康志愿者PBMC基因表达谱,并挑选至少有4例关节炎患者表达增多的13个炎症反应相关的细胞因子,扩大研究病例数以半定量RT-PCR方法验证其表达水平。结果 cDNA微阵列检测结果显示,AS和RA患者基因表达谱明显异常。在健康志愿者组,AS和RA患者的异常高表达的基因表达率分别为8.4%,32.5%和44.8%,两组关节炎患者与健康志愿者P均<0.001;而且RA组异常表达率又明显多于AS组(P<0.012),2例活动性肺结核患者也有类似的高表达。以RT-PCR法验证的13个基因的表达水平,发现22例AS,8例RA患者基因表达结果与cDNA微阵列检测结果一致。结论 AS患者PBMC基因表达谱明显异常,与RA患者也显著不同,13个细胞因子的高表达对AS无特异性。

关键词: 强直性脊柱炎, cDNA阵列技术, 外周血单个核细胞, 炎症基因表达谱

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2005年03月04日

【期刊论文】髓样细胞核分化抗原(MNDA)在强直性脊柱炎病人的表达

古洁若, 黄烽, 余得恩

,-0001,():

摘要

目的通过比较强直性脊柱炎(AS)患者和健康志愿者的基因表达谱,寻找与AS相关的新基因并探讨其在病因和发病机制中的意义。方法 用含588个基因的cDNA微阵列,检测AS和健康志愿者的外周血单个核细胞的基因表达谱,初步筛选出在AS中差异表达的基因,为了进一步验证cDNA微阵列差异表达基因结果,扩大各组病例数,再用RT-PCR技术同时检测、对比健康志愿者和AS患者外周血单个核细胞(PBMC)、关节液单个核细胞(SFMC)和关节滑膜细胞这些差异表达基因的变化。结果 和健康志愿者组的PBMC比较,AS病人的MNDA、迁移抑制因子相关蛋白8(MRP8)和MRP14、粘附分子ICAM-1和Integrinβ1表达明显增高,其中MNDA和MRP8的变化相关系数为0.793。在AS的SFMC和关节滑膜细胞中,MNDA表达也显著增高(与健康志愿者组PBMC比较,P值分别为0.038和0.027);MNDA区别AS和健康志愿者的统计学鉴别准确率达1。AS病人在接受抗TNF-α单克隆抗体治疗3个月后,MNDA在关节滑膜细胞的表达水平显著下降(P=0.018)。结论 MNDA是AS发病过程中一个重要的并与单核/巨噬细胞致炎密切相关的免疫因子,可能成为一种用于AS的诊断、治疗监控指标。

关键词: 髓样细胞核分化抗原(, MNDA), 强直性脊柱炎, cDNA微阵列, 基因表达谱

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