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2011年04月25日

【期刊论文】影响PCR-SSCP的因素分析

姜运良, 李宁, 赵兴波, 吴常信

农业生物技术学报,2000,8(3):245~247,-0001,():

摘要

PCR-SSCP是一种基于PCR的单链构象多态性(single-stranded conformation polymorphism)分析技术,是DNA已知突变的检测或未知变异分析中十分常用和实用的技术之一。本研究从非变性聚丙烯酰胺凝胶的配制,校品的变性处理,电沪条件、显色方法和结果分析等方面对影响PCR-SSCP实验室操作的因素进行了分析,并结合作者的经验给出了大小在100~200bp范围以内的DNA片段进行SSCP分析的操作程序:凝胶浓度为10%~15%,98℃变性5~10min,4℃条件下5W过夜电泳,银染法染色。

关键词: PCR-SSCP, 碱基置换突变, 影响因素

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2011年04月25日

【期刊论文】猪雌激素受体基因(ESR)点突变的PCR—SSCP检测

姜运良, 李宁, 习欠云, 吴常信

遗传,2000,22(4):214 ~216,-0001,():

摘要

雌激素受体基因(ESR)是控制猪高产仔数的主效基因之一,具有明显的基因效应BB型比AA型母猪胎总产仔数和产活仔数分别高出1.40~3.37和0.63~3.58头。是目前商品猪育种和生产中重点检测的主要基因之一。常规采用PCR-RFLPs方法区分该基因由点突变造成的3种不同的基因型。本研究建立1种基于PcR的SSCP(single-stranded corformation polymorphism)方法对猪ESR该位置的点突变进行检测,具有操作简便、灵敏度高和不需要酶切等优点,可以在育种实践中广泛应用。

关键词: 猪, ESR基因, 点突变, PcR-SSCP

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2010年12月07日

【期刊论文】贵州地方猪种种UCP3基因多态性与肉质性状的相关性分析

王嘉福, 胡倩, 冉雪琴*

,-0001,():

摘要

解耦联蛋白3(uncouphllg proteill 3,uCP3)是调节能量和脂肪代谢的重要因子。以商品猪(杂交猪)为对照,采用sscP方法对贵州地方猪品种糯谷猪和萝卜猪的ucP3基因进行了多态性分析。结果表明:3个猪群体中,都检测到了3种基因型(从、BB、AB),X2独立性检验结果显示,3种基因型在3个群体间的分布不一致,糯谷猪和萝卜猪以AB基因型为主,杂交猪以BB基因型占优势,杂交猪与地方猪种之间的差异显著(P<0.01);对纯合基因型的ucP3基因片段进行克隆测序。证实从基因型中ucP3基因外显子6编码区第842位碱基发生了单碱基突变(T—c),导致编码的氨基酸从苏氨酸突变为甲硫氨酸。进一步分析3种基因型与胴体和内质性状之间的相关性,证明AB基因型个体的内质最优,贵州地方猪种的大理石纹、肌内脂肪含量和嫩度3项指标显著优于商品猪(p<0.01),因此推测ucP3基因与贵州地方猪种的肉质性状具有相关性,可能是贵州地方猪种肉质性状的候选基因。

关键词: 肉质性状, ucP3基因, sscP 胴体,

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2010年12月07日

【期刊论文】贵州白山羊GDF9基因外显子2的多态性研究

王嘉福, 杜智勇, 林尖兵, 覃成, 冉雪琴*

Animal Husbandry & Velerinary Medicine 2008 Vol.40 No.4,-0001,():

摘要

生长分化因子9(GDF9)是卵母细胞分泌的生长因子,对早期卵泡的生长和分化起重要的调节作用。采用RFJP和sscP方法检测贵州白山羊GD,9基因外显子2的单核苷酸多态性,结果表明:在所有检测样本中均未发现GDF9基因的FecGh突变;在高繁殖率(3羔以上/胎)母羊和公羊中检测到8个杂合的AB基因型,其中5个为高产的母羊,3个为公羊。碱基序列分析证实GD丹基因编码区第1 189 bp位点的碱基由G突变为A,该位点位于外显子2中,导致活性肽第79位缬氨酸突变为异亮氨酸(V79I)。但在低繁殖率(1—2羔/胎)母羊中没有发现该突变。虽然贵州白山羊GDF9基因中G1189A突变的发生率仅为5%,但该位点编码的氨基酸与FecGh突变(s77F)仅相隔1个氨基酸,因此推测GD冈基因中的G1189A突变可能与贵州白山羊的高繁殖力有关。

关键词: 贵州白山羊, GDF9基因, RFLP, sscP FecGh

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2009年08月17日

【期刊论文】自制试剂盒在基因突变检测中的应用

吕申, 赵春霞①, 许国旺①**, 石先哲①, 马坚妹②, 张岩②, 吕申①②, 杨青①

中国科学(B辑),2003,33(6):496~503,-0001,():

摘要

利用自制试剂盒,在ABI310型遗传分析仪上建立了单链构象多态性分析、单链构象多态性/杂合分析及SNaPshot分析的基因突变检测方法,并将其应用于31例大肠癌病人P53基因外显子7-8和k-ras基因外显子1的突变筛查,结果表明,在各自的优化条件下,用自制试剂盒比用商品化的试剂盒分析时间更短,分离性能更好。对实际样品的检测结果表明,P53基因外显子7-8和k-ras基因外显子1在被检测人群中的突变频率分别为24%和26%,均为单点突变,其中大部分样品的突变发生在单个基因,只有一例样品同时在两个基因发生突变,这说明肿瘤的发生发展有多种途径,而且与多个基因的突变相关,

关键词: 单核苷酸多态性(, SNP), 单链构象多态性(, SSCP), 杂合分析(, HA), SNaPshot, 线性聚丙烯酰胺(, LPA), 聚甲基丙烯酰胺(, PDMA),

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2009年06月09日

【期刊论文】宫颈癌组织中人乳头瘤病毒16型E5基因的变异*

楚雍烈, 杨娥, 刘文康, 曹春霞

微生物学杂志,2001,21(4):11 ~ 12,-0001,():

摘要

探讨了HPV16 E5基因突变与宫颈癌发病的关系。应用银染聚合酶链反应.单链构象多态性(PCR-SSCP)分析对50份人宫颈癌活检标本进行基因突变的筛查。PCR检测显示,50例官颈癌组织中艘V16 E5的检出率为 30%(15/50),其中6例宫颈癌唧V16 E5扩增片段在行SSCP分析时发现有泳动变位,突变率为40%(6/15)。可见HPVl6磷基因的突变在宫颈癌的发生过程中具有重要作用。

关键词: HPV16 E5基因, PCR-SSCP, 突变, 宫颈癌

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2009年04月28日

【期刊论文】p21WAF1/CIP1 gene DNA sequencing and its expression in human osteosarcoma

廖威明, LIAO Wei-ming, ZHANG Chun-lin, LI Fo-bao, ZENG Bing-fang and ZENG Yi-xin

Chinesse Medical Journal 2004; 117(6): 936-940,-0001,():

摘要

暂无

关键词: p21WAF1/, CIPI gene, osteosarcoma, gene expression, DNA sequencing, PCR-SSCP

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2006年11月01日

【期刊论文】Nested PCR-SSCP assay for the detection ofp53 mutations in paraffin wax embedded bonetumours: improvement of sensitivity and fidelity

王连唐, L T Wang, A Smith, B Iacopetta, D J Wood, J M Papadimitriou, M H Zheng

J Chin Pathol: Pathol 1996; 49: M176-M178,-0001,():

摘要

暂无

关键词: extraction,, PCR amplification,, SSCP,, paraffin wax embedded bone tumour specimens

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2006年12月06日

【期刊论文】Homoeologous gene silencing in hexaploid wheat

夏光敏, A. Bottley, *, G.M. Xia and R.M. D. Koebner

The Plant Journal (2006) 47, 897-906,-0001,():

摘要

暂无

关键词: polyploidy,, gene silencing,, wheat,, SSCP,, epigenesis.,

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2005年10月26日

【期刊论文】PCR-SSCP as a molecular tool for the identification of Benedeniinae (Monogenea: Capsalidae) from marine fish*

伦照荣, An-Xing Li a, Xiang-Yun Wu a, Xue-Juan Ding a, Rui-Qing Lin b, Ming-Quan Xie a, Zhao-Rong Lun a, Xing-Quan Zhu b, *

A.-X. Li et al./Molecular and Cellular Probes 19(2005)35-39,-0001,():

摘要

暂无

关键词: Single strand conformation polymorphism (, SSCP), Polymerase chain reaction, Large subunit ribosomal DNA (, lsrDNA), First internal transcribed spacer (, ITS-1), Benedeniinae

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2005年06月30日

【期刊论文】Sequences and polymorphisms of exons 3 and 4 in porcine UCP2 gene*

赵兴波, FANG Meiying, LIU Chousheng, ZHAO Xingbo**, LI Ning and WU Changxin

PROGESS IN NATURAL SCIENCE Vol. 12, No.7, July 2002,-0001,():

摘要

暂无

关键词: pig, mlCouplillg proteins, PCR-SSCP.,

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2005年05月23日

【期刊论文】马尾松表达序列标签多态性初步分析

尹佟明, 李东, 陈颖, 黄敏仁, 王明庥

林业科学,2004,40(6):176~180,-0001,():

摘要

暂无

关键词: 单链构象多态性(, SSCP), ,, 表达序列标签(, EST), ,, 马尾松,, 遗传图谱

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2005年03月24日

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2005年03月24日

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2005年03月08日

【期刊论文】猪HSL基因多态性研究及其部分DNA片段的测序

熊远著, 吴珍芳, I Harbitz, 邓昌彦, 蒋思文

遗传学报,2000,27(8):686~690,-0001,():

摘要

激素敏感脂肪酶(HSL)是动物体脂肪分解的关键酶。采用PCR-SSCP法研究猪HSL基因的启动于区。部分5'-端转录非翻译区、第7外显于区、第8外显子区和3'-端部分转录非翻译区域DNA多态性。结果在对应于HSL基因第8外显子区域发现1 DNA片段的SSCP,表现出3种基因型MM、MN和NN,脂肪型猪种梅山猪和通城猪含有更多的等位基因M(频率分别为0.690和0.740),而瘦肉型猪种大白猪和长白猪则含有更多的等位基因N(频率分别为0.847和0.845);该DNA片段经测序分析,发现位于基因cDNA第2249和2280处发生碱基序列的改变(均为A→G),使天冬酰胺变为天冬氨酸(Asa→Asp)和谷氨酸变为甘氨酸(Glu→Gly)。

关键词: 激素敏感脂肪酶, 猪, SSCP

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