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2010年10月19日

【期刊论文】环境微生物群落分析的T. RJFLP技术及其优化措施*

吴晓磊, 余素林, 吴晓磊**, 钱易

应用与环境生物学报,2006,12(6):861~868,-0001,():

摘要

末端限制性酶切片段长度多态性分析(terminal restriction hagment length polymorphism,T-RFLP)是近年来发展起来的、不依赖于培养的微生物群落分析方法之一。由于其在微生物群落结构分析方面的特点,包括分辨率高、易于实现自动化及互联网海量数据共享等优势,自1997年最先被报道以来得到了广泛的应用,成为环境微生物群落分析的最强有力的工具之一。本文详细介绍了T-RFLP技术的原理,并从环境样品群落DNA的提取、引物设计和PCR扩增、限制性酶切、电泳分离检测和T-RFLP图谱解析等5个方面讨论了用该技术解析环境微生物群落的方法和技巧,简述了近8a来国外T_RFLP技术在群落分析中的研究进展。类似于其他的分子微生物生态学技术,T-RFLP也有自身的缺陷,因此重点分析了该技术的局限性及相应的解决办法。

关键词: 微生物群落, 末端限制性片段长度多态性分析(, T-RFLP), 分子微生物生态学, 生物多样性

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2010年10月19日

【期刊论文】黄河三角洲湿地土壤微生物群落结构分析*

吴晓磊, 刘芳, 叶思源, 汤岳琴, 滝川清, 木田建次, 吴晓磊**

应用与环境生物学报,2007,13(5): 691~696,-0001,():

摘要

采用末端限制性片段长度多态性分析(T2RFLP)技术和16S rDNA克隆文库的方法, 分析了黄河三角洲滨海湿地土壤不同深度细菌和古菌的群落结构。研究表明, 随着深度的增加, 细菌群落的多样性下降, 而古菌群落多样性则有上升的趋势, 且土壤的细菌和古菌群落结构都呈现出规律的层状分布。该土壤包括各种硫酸盐还原菌、产甲烷古菌、光合细菌等丰富的细菌和古菌资源。

关键词: 滨海湿地, 微生物群落结构, 末端限制性片段长度多态性分析 16S rDNA 克隆文库, 种群多样性

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