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2011年03月25日

【期刊论文】节肢动物线粒体基因组与系统发生重建

孙红英, 周开亚, 宋大祥

动物学研究,2003,24(6):467~479,-0001,():

摘要

对mt基因组的比较研究是探讨节肢动物系统发生的有效手段之一。基因的排列和DNA序列可以为重建节肢动物的系统发生提供有用的信息。目前,已测定mt基因组全序列的节肢动物已增加到44种。归纳、总结了节肢动物mt基因组的基本特征、基因顺序、基因重排的发生和机制等。简要评述基于mt基因组的节肢动物系统发生研究。

关键词: 节肢动物, 线粒体基因组 基因重排, DNA 序列变异, 系统发生重建

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2009年09月27日

【期刊论文】扬子鳄的线粒体全基因组与鳄类系统发生

吴孝兵, 吴孝兵①③, 王义权①②*, 周开亚①, 朱伟栓①, 聂继山④, 王朝林④

科学通报,2003,48(18):1954~1958,-0001,():

摘要

通过酶切、克隆、测序、结合Long-PCR和PrimerWalking法对扬子鳄线粒体DNA基因组进行全序列测定,结果表明,扬子鳄线粒体基因组DNA序列全长为16746bp,其基因组碱基组成为29.43%A,24.59%T,14.86%G,31.12%C.与其他大多数脊椎动物相同,其基因组由13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因及1个非编码的控制区(D-loop)组成,基因的排列与已测序的鳄类相似在全序列分析的基础上,对12SrRNA基因序列、16SrRNA基因序列、蛋白质编码基因序列及其合并数据用MP法和ML法构建系统发生树,结果表明扬子鳄与密河鳄的亲缘关系较近,支持传统观点根据树的支长数值估计钝吻鳄属发生的时间为74.9MaBP,扬子鳄与密河鳄分歧的时间为50.9MaBP.

关键词: 扬子鳄, 线粒体基因组 全序列, 系统发生, 分歧时间

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2009年08月17日

【期刊论文】鸮形目两种鸟类线粒体基因组全序列测定与比较研究

李庆伟, 孙毅①, 马飞①, 肖冰①, 郑俊杰②, 袁晓东②, 汤敏谦②, 王黎③, 于业飞③, 李庆伟①**

中国科学C辑生命科学,2004,34(6):527~536,-0001,():

摘要

利用Long-PCR和PrimerWalking结合克隆测序法对短耳鸮和长耳鸮线粒体基因组进行了全序列测定,结果表明:短耳鸮mtDNA序列全长为18858bp,长耳鸮mtDNA全长为18493bp,其中短耳鸮mtDNA是目前已知最长的鸟类线粒体基因组,两种鸮类的基因组结构和基因排列顺序与家鸡相同,无假控制区,在ND3基因174位点都存在一个额外插入的胞苷酸(C).控制区序列异常增大是造成这两种鸟类mtDNA增大的主要原因,短耳鸮控制区长度为3288bp,长耳鸮为2926bp,这是目前已知的脊椎动物线粒体基因组中仅次于盲鳗的最大的控制区,在其控制区3,端存在大量的串联重复序列,分析发现这两种鸮类的重复序列和Mt5调控元件有较高的序列相似性,且能形成多重的茎环二级结构,这表明该重复序列可能具有一定的生理功能,影响线粒体基因组的复制或转录表达,从而使相应物种具有更大的选择优势,以适应环境和生存竞争.

关键词: 短耳鸮, 长耳鸮, 线粒体基因组控制区, 重复序列

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2007年03月14日

【期刊论文】应用长PCR扩增蝗虫线粒体全基因组

黄原, 刘念, 胡婧

Chinese Journal of Zoology(动物学杂志) 2006, 41(2): 61-65,-0001,():

摘要

介绍了用两对长PCR 引物扩增蝗虫(Acridoidea) 线粒体全基因组的方法。从NCBI 的核酸数据库下载得到36 种已测昆虫线粒体全基因组,选取cytochrome b (Cyt b) 、cytochrome oxidase subunit Ⅱ(CO Ⅱ) 、cytochrome oxidase subunit Ⅰ(CO Ⅰ) 基因的保守区域设计两对引物。其中引物LP03 和LP04 从CO Ⅰ向Cyt b 扩增;引物LPCyt b 和LPCO Ⅱ从Cyt b 向CO Ⅱ扩增,两对引物扩增的片段之间有大约1 kb 的重叠。应 用这两对引物成功扩增出10 种蝗虫的线粒体基因组。考虑到在设计引物过程中所选序列在其他昆虫 中的保守性,它们应能在大部分昆虫线粒体基因组扩增中发挥作用。

关键词: 长PCR, 引物, 蝗虫, 线粒体基因组

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2007年03月14日

【期刊论文】节肢动物线粒体基因组研究进展与基因顺序分析

黄原, 胡婧, 刘念

昆虫分类学报第28卷第2期,-0001,():

摘要

在总结了68 种节肢动物线粒体基因组的测序种类、基因组组成、结构及基因排序情况的基础上,特别对节肢动物线粒体基因组基因排列顺序数据进行了详细的分析。线粒体基因组基因排列顺序数据显示六足动物与甲壳动物之间相似,螯肢动物与多足动物相似,这个结果和以前Boore(1998)对节肢动物线粒体基因组顺序分析结果不同, 却和核rRNA 数据的分析结果一致。

关键词: 节肢动物, 线粒体基因组 基因顺序, 系统发育

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