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2010年11月30日

【期刊论文】广西流行的猪瘟病毒株E2基因序列测定及分析

罗廷荣, 廖素环, 吴显实, 刘芳, 陆芹章, 黄伟坚, 温荣辉, 秦爱珍, 余克伦

中国生物制品学杂志,2005,18(3):196~199,-0001,():

摘要

目的对广西流行的猪瘟病毒E2基因进行序列测定及分析。方法应用PCR对15株猪瘟病毒E2基因进行扩增、克隆及测序,利用DNAstar分析软件对所测定的15株毒株与兔化弱毒(HCLV)、石门(Shimen)毒株的相应基因片段进行同源性分析。结果得到长度为1092nt猪瘟病毒E2基因,编码364个氨基酸残基的目的基因片段。广西株与HCLV、Shimen株的核苷酸同源性分别为8115%~8218%和8218%~8413%,推导的氨基酸同源性分别为8711%~8818%和8815%~8919%,广西毒株之间核苷酸与推导的氨基酸同源性分别为9213%~9919%和9418%~100%。广西15株猪瘟病毒E2蛋白上的全部半胱氨酸(Cys)位点均未改变,推测其E2蛋白的抗原结构保持很高的稳定性。但广西毒株中与特定单克隆抗体结合的724、725、729、734和738位的氨基酸发生了变异,这些变异可能导致不完全免疫保护。把所测定的广西15株与国内外已发表的19株病毒相应序列进行比较,建立系统发育树,所比较的34株猪瘟病毒被分为两个群,广西毒株皆属于基因群?。结论成功进行了广西流行猪瘟病毒E2基因序列分析,为进一步探讨猪瘟病毒E2蛋白的抗原结构提供了依据。

关键词: 猪瘟病毒, E2基因 同源性, 变异

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2005年10月12日

【期刊论文】风疹病毒JR23株包膜糖蛋白E2的遗传与变异分析

王志玉, 王小凡, 王战勇, 薛永磊, 宋艳艳

病毒学报,2003,19(2):109~113,-0001,():

摘要

为了探讨风疹病毒(rubella virus, RV)包膜粮蛋白E2的基因与蛋白的遗传与变异特点,利用DNAstar软件比较JR23株与GenBank中各参考株E2的基因与多肽序列,分析不同RV株E2基因之间的同源性及E2蛋白功能关键区的氨酸变异。结果表明,RV E2基因序列比较保守,但JR23析E2基因序列与其它9个分离析之间有明显差异,变异主要集中在484nt-554nt。同源性为90.3%-92.6%之间,与美国疫苗株RA27/3同源性最高,与美国疫苗株HPV77同源性最低,GenBank中的参考株间同源性较高,在96.3%-100.0%之间。E2多肽变异集中于161aa-185aa,但在E2功能关键区,如N端序列、N联粮基化位点、胞质区等则无明显变异。表明RV E2基因序列相对保守,虽然JR23株与GenBank中各参考株的E2基因序列有明显差异,但JR23株E2蛋白在功能关键区表现出遗传稳定性。此结果为阐明RV分子流行病学特征提供了理论依据,也为研究RV分子进行特征病毒与宿主细胞的相互作用奠写了坚实的基础。

关键词: 风疹病毒, E2基因 同源性

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