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2011年06月07日

【期刊论文】玉米同核异质不育系小孢子发育的m RNA多态性分析

曹墨菊, 荣廷昭, 朱英国

玉米科学,2005,13(3):3-5,-0001,():

摘要

应用cDNA-RAPD技术分析了玉米同核异质不育材料在小孢子发育过程中花粉发育相关基因表达的差异。结果表明,在小孢子发育的相同时期,引物s330在48-2背景下的不同胞质之间存在差异,不同时期差异表现不一;引物s330在黄早四背景下的不同胞质之间未检测到差异,并且小孢子发育的3个时期表现一致。对同核异质不育系和同质异核不育系的比较发现,核背景对mRNA转录的影响大于细胞质,不育胞质T、C、S在48-2背景和黄早四背景下的差异表现不一。根据S330在48—2背景下的扩增结果,发现基于mRNA多态性的相似性比较结果与不育细胞质的败育特点及败育时期具有较好的一致性,即配子体不育类型与保持系的相似性高于孢子体不育类型,孢子体不育类型之间的相似性高于孢子体不育与配子体不育的相似性。

关键词: 玉米, 细胞质雄性不育, eDNA-RAPD分析, 同核异质系

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2011年06月07日

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2011年06月07日

【期刊论文】甘蓝型油菜矮化突变体抑制消减cDNA文库的构建及初步分析

赵云, 李小艳, 周云涛, 李熠毅, 王茂林*

中国油料作物学报,2008,28(4):396~402,-0001,():

摘要

采用抑制性消减杂交(suppresson stubtracitve hybridization, SSH)技术,以甘蓝型油菜矮化突变体“NDF-1”为实验方(tester),野生型“3529”为驱动方(driver)构建植株差异表达的抑制消减cDNA文库。所建cDNA文库的插入片段大小主要集中在100~1000bp之司。斑点杂交筛选得到了32个阳性克隆,序列测定和同源性对比分析表明,其中的12个克隆功能未知,其余涉及到激素信号转导、第二信使、光合作用、脂肪酸代谢及衰老等多个方面。还对部分差异表达基因的功能进行了分析。为进一步认识油菜植株矮化的机理奠定了基础。

关键词: 甘蓝型油菜, 矮化突变, 抑制消减杂交, cDNA文库

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2011年05月23日

【期刊论文】棉花纤维细胞分化相关基因的cDNA阵列分析*

孙杰, 高鹏, 李艳军, 夏桂先, **

自然科学进展,2007,17(9):1295~1298,-0001,():

摘要

利用陆地棉(Gdssypium hirsutum)品种徐州142(野生型)开花前1-3d的胚珠构建了一个高质量的cDNA文库,从该cDNA文库中提取13056个质粒,用Biomek2000高密度点阵系统,将这些质粒点于强化硝酸纤维素膜上。分别用徐州142野生型和无絮突变体开花前1-3d的胚珠mRNA反转录标记探针与cDNA阵列杂交,筛选到8个在野生型胚珠中高表达的基因,其中4个在GenBank中有同源序列,4个为未知新基因。Nofthern杂交表明有两个基因在野生型中比突变体中表达量显著提高。

关键词: cDNA阵列, 棉花, 纤维细胞

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2011年05月11日

【期刊论文】On the role of Cdc2 kinase during meiotic maturation of oocyte in the Chinese mittencrab, Eriocheir sinensis

邱高峰, Gao-Feng Qiu*, Ping Liu

Comparative Biochemistry and Physiology, Part B 152(2009)243-248,-0001,():

摘要

暂无

关键词: Cdc2 kinasecDNA cloningExpressionMeiotic maturationOogenesisMitten crab Eriocheir sinensis

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2011年05月11日

【期刊论文】Transcriptional regulation of ferritin mRNA levels by iron in the freshwater giantprawn, Macrobrachium rosenbergii

邱高峰, Gao-Feng Qiu*, Liang Zheng, Ping Liu

Comparative Biochemistry and Physiology, Part B 150(2008)320-325,-0001,():

摘要

暂无

关键词: FerritincDNA cloningRegulated expressionIronMacrobrachium rosenbergii

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2011年05月11日

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2011年03月28日

【期刊论文】鸡bcl-2表达质粒的构建及其对转染细胞凋亡的影响

张书霞, 步志高, 陈万芳

中国农业科学,13(6):88~94,-0001,():

摘要

构建了CMV驱动及牛生长激素polyA加尾信号修饰的bcl-2cDNA真核表达质粒pCDCB1。随后,采用脂质体转染方法,将扩增并纯化的pCDCB1转染至培养的SPF鸡胚次代单层成纤维细胞(CEF)内,96h后收集全部贴壁及上清脱落细胞,用Dotblot检测bcl-2的表达,用流式细胞术测定其细胞凋亡率。结果,pCDCB1转染后96h,bcl-2在CEF中呈高度表达;CEF平均凋亡率为1.14%,明显低于转染空白载体质粒的对照组7.64%的凋亡率,DNA合成期(S期)细胞为21.58%,也低于对照组。结果证实鸡bcl-2的表达可显著抑制体外培养CEF,亡进程,其效应与细胞DNA合成和增殖无关。

关键词: bcl 2, cDNA 真核表达质粒, 转染, 细胞凋亡

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2011年03月25日

【期刊论文】Comparative analysis of ESTs in response to drought stress in chickpea (C. arietinum L.)

麻浩, Wen-Rui Gao a, Xian-Sheng Wang a, Qing-You Liu b, Hui Peng a, Chen Chen a, Jian-Gui Li c, Ju-Song Zhang c, Song-Nian Hu b, *, Hao Ma a

Biochemical and Biophysical Research Communications 376 (2008) 578-583,-0001,():

摘要

暂无

关键词: Chickpea,, Drought stress,, Drought tolerance,, cDNA library,, Expressed sequence tags,, Quantitative real-time PCR

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2011年03月21日

【期刊论文】鸡白细胞介素-2cDNA克隆*

李祥瑞, 金红, 卢景良

南京农业大学学报,22(2):80~84,-0001,():

摘要

用哺乳动物细胞表达克隆系统克隆了鸡IL 22 cDNA。以Con A(20 Lg/mL)诱导SPF 鸡脾脏淋巴细胞,第20小时 收集细胞,提取mRNA,以Super Scrip t P lasm id System fo r cDNA Synthesis 试剂盒合成cDNA,定向连结于穿梭质粒pSV·Sport I,构建cDNA 文库。将文库分组提取重组质粒,转染CO S27 细胞,表达cDNA s。以淋巴细胞增殖试验检测表达产物IL 22 活性。经过3轮筛选,获得14个具有IL 22活性的克隆。选择其中4个进行酶切分析,结果显示这4个cDNA大小分别为1.5,1.0,0.8和0.8kb。

关键词: 鸡, 白细胞介素22, cDNA 克隆

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2011年01月27日

【期刊论文】Cloning and expression of a fat body-specific chitinase cDNA from the spider, Araneus ventricosus

李建洪, Ji Hee Hana, Kwang Sik Leea, Jianhong Lia, Iksoo Kimb, Yeon Ho Jec

Comparative Biochemistry and Physiology, Part B 140 (2005) 427-435,-0001,():

摘要

暂无

关键词: Araneus ventricosus, Baculovirus, cDNA Chitinase, N-Glycosylation, Glycosyl hydrolase, Insect cells, Spider

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2011年01月24日

【期刊论文】ARP-SRP基因表达谱芯片对脑损伤的初步研究

周亦武, 张益鹄, 邓伟年, 刘艳, 胡志红

Journal of Forensic Medicine, August 2002, Vol. 18. No.3,-0001,():

摘要

目的研究脑挫伤后ARP-SRP基因表达谱差异及其法医学意义。方法从脑组织提取mRNA,应用ARP-SRP-1.OS基因芯片,研究脑挫伤组织与对照脑组织细胞凋亡蛋白和应激反应蛋白相关基因特异性表达差异。结果基因芯片杂交结果中,发现人类溶酶体的胃蛋白酶抑制剂不敏感蛋白酶基因fCLN21表达水平显著下降。结论CLN2基因与一种婴儿致死性神经变性疾病LINCL有关,但CLN2基因在脑损伤中的作用尚有待进一步研究;基因芯片在研究脑损伤后相关基因的改变具有快速、高通量、高敏度等特点。

关键词: 基因芯片, 微矩阵基因芯片, 基因表达谱, 差异表达, 脑损伤

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2011年01月24日

【期刊论文】OTS-2.2S基因芯片对人脑挫伤后基因表达差异的初步研究

周亦武, 张益鹄, 刘艳, 邓伟年, 王成毅

法医学杂志,2004,20(2):77~81,-0001,():

摘要

目的利用基因芯片技术,研究人挫伤脑组织中基因表达差异。方法从脑组织提取mRNA,通过OTS-2.2S基因芯片,研究脑挫伤组织与对照脑组织细胞原癌及抑癌相关基因特异性表达差异。结果发现在挫伤脑组织中,HoJ-1和KlAAOO65基因表达水平显著下降,而p107mRNA表达水平显著升高。结论在脑挫伤中仅发现3条基因的表达有显著性差异;本研究是对脑损伤后基因表达水平及其法医学意义进行的探索性研究。

关键词: 微矩阵基因芯片, 基因表达谱, 脑挫伤, 原癌基因, 抑癌基因

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2011年01月20日

【期刊论文】6种重要经济鱼类生长激素完整cDNA的克隆和序列分析

邹记兴, 张竞男, 宋平, ①, 胡珈瑞, 莫赛军, 彭茂宇, 周伟, 胡隐昌

遗传学报,2005,32(1):19~29,-0001,():

摘要

通过RT-PCR、3'-RACE、5'-RACE方法,从6种重要经挤鱼类 大眼鳜(Siniperca kneir)、石斑鱼(Epi-nephelus coioides)、黄鳝(Monopterus albus)、鲶鱼(Silurus asotus)、泥鳅(Misgurnus anguillicaudaus)和方正银鲫(Carassiu auratus gibelio Bloch, Fang Zheng crucain carp)中克隆了生长激素(Growth Homone, GH)的完整cDNA序列(除石斑鱼序列外,其他生长激素序列均系第一次克隆),并详细分析了其序列特征。测序结果显示,克隆的6种GH cDNA长度依次为953bp、1023bp、825bp、1082bp、1154bp和1180bp,它们均包含一个长度为600个左右核昔酸的完整阅读框,分别编码一个200个右氨基酸的蛋白:大眼鳜、石斑鱼和黄鳝GH为204个氨基酸,鲶鱼GH,200个氨基酸,泥鳅和方正银鲫GH 21 0个氨基酸。这6种蛋白序列与其他已知的鱼类GH序列都有较高的同源性,特别是与相同目的鱼类序列相比。通过序列比对,在这些蛋白序列内鉴定了许多保守的氨基酸残基,其中的大多数聚集而成5个保守域。基于这6种鱼类序列的编码区和其他鱼类的GH编码序列进行分子系统学分析,结果(MP和NJ树)与根据形态特征构建的系统发育树基本一致,特别是在硬骨鱼类较大分类阶元(目间、目以上)的系统发育研究方面比较一致,尽管仍存在一定差异,说明生长激素基因的编码区应该在硬骨鱼类系统发育研究领域得到更多的重视。

关键词: 生长激素, 完整cDNA 序列分析

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2011年01月04日

【期刊论文】甘蓝型油菜种子不同发育时期SSH文库的构建

刘春林, 彭琦, 胡燕, 杜培粉', 谢青轩, 阮颖, 刘春林*

作物学报,2009,35(9):1576-1583,-0001,():

摘要

利用抑制差减杂交技术构建了20d和35d甘蓝型油菜湘油15发育种子特异表达基因的ssH文库。随机挑取单菌落进行PCR表明,文库质量较好。在20d和35dssH文库中随机挑选489个阳性克隆进行测序,获得452条高质量的表达序列标签(EST)。对序列进行Blast比对及功能注释,比较20d和35dSSH文库的基因表达谱,发现在20dssH库中参与糖代谢的基因出现频率较高,而在35dSSH库中与脂肪酸储存有关的油体蛋白家族、与脂肪酸转运有关的柠檬酸合酶、与脂肪酸合成有关的酰基载体蛋白去饱和酶等,参与油脂代谢相关基因出现频率较高。该结果对进一步研究油菜脂肪酸代谢调控的分子机制打下了基础。

关键词: 甘蓝型油菜, 种子发育, 脂肪酸, 抑制差减杂交, cDNA文库

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2010年08月31日

【期刊论文】蜡样杆菌(Bncillus ereus)M22 Mn-SOD cDNA片断的克隆

王琦, 惠芳, 尚玉磊, 王琦*, 王慧敏, 梅汝鸿

微生物学杂志,2004,24(3):8~11,-0001,():

摘要

析不同种细菌Mn-SOC氨基酸序列的保守区域,设计一对简并引物进行RT-PCR扩增,产物经T-A载体连接转化大肠杆菌JM109,筛选阳性克隆、测序并进行同源性分析,得到436 bp Mn-SOD cDNA片段。根据此片段设计5′端特异性引物,然后进行5′RACE扩增,获得Mn SOC 5′端387 bp cDNA片断。将2段序列进行拼接获得594 bp cDNA片断,编码172个氨基酸。对推定氨基酸序列进行BLAST分析,结果表明其与炭疽芽孢杆菌(岛Bacillus anthracis)同源性为95%,且Gly77,Aly78,phes86,G1n150和Asp151在已报道的Mn-SOD中均存在,构成Mn-SOD的活性中心。表明该序列为蜡样芽孢杆菌Mn-SOD的cDNA序列。

关键词: 样芽孢杆菌(, Bacillus cereus), Mn-SOD, eDNA, 克隆, 分析

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2010年07月16日

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2010年03月07日

【期刊论文】Analysis of part of the Trichophyton rubrum ESTs

马骊, WANG Lingling*, MA Li, *, †, LENG Wenchuan, YANG Jian, ZHU Junping, DONG Jie, XUE Ying, WAN Zhe, LI Ruoyu & JIN Qi

Science in China Ser. C Life Sciences 2004 Vol. 47 No.5 389-395,-0001,():

摘要

暂无

关键词: Trichophyton rubrum,, functional genomics,, cDNA library,, expressed sequence Tags,, drug targets.,

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2009年11月16日

【期刊论文】应用抑制性消减杂交技术从斑秃脱发区毛乳头中克隆出一条自身抗原基因

郝飞, 宋志强, 杨希川, 钟白玉, 杨卫兵, 叶庆佾

第三军医大学学报,2004,26(1):64~67,-0001,():

摘要

目的寻找斑秃脱发区毛乳头中特异表达的基因片段,探讨斑秃发病机制方法应用抑制性消减杂交构 建斑秃脱发区毛乳头差异表达基因的cDNA文库,并通过PCR筛选、杂交验证和同源性检索对差异表达基因进行分析。结果成功建立了高消减效率的斑秃脱发区毛乳头cDNA消减文库,并克隆到一条斑秃毛乳头特异表达的基因片段DP3(307 bp),应用cDNA斑点杂交及Northem杂交证实它仅在脱发区毛乳头特异表达,同源性检索其为一条甲状腺相关的自身抗原基因。结论DP3在斑秃脱发区毛乳头的特异表达提示其可能参与斑秃的发病过程,它的克隆为斑秃发病机制的自身免疫学说进一步提供了实验依据。

关键词: 斑秃, 毛乳头, cDNA文库

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