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2010年12月07日

【期刊论文】人类A3腺苷受体配基稠合1,2,4三唑并[1,5-c]嘧啶衍生物的3D-QSAR研究

叶德泳, 黄莉, 唐赟

复旦学报(医学版),2005,32(6):1~5,-0001,():

摘要

目的 建立人类A3腺苷受体配基稠合1,2,4一三唑并[1,5-c]嘧啶衍生物的三维定量构效关系,为设计高活性的该类化合物提供依据。方法利用比较分子场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)建立39个该类化合物的三维定量构效关系模型。结果 CoMFA和CoMSIA模型均有良好的预测能力,但CoMSIA模型包含的力场较全面,给出信息更丰富。结论 CoMSIA模型可为该系列化合物的进一步结构改造提供指导。

关键词: 三维定量构效关系 比较分子场分析, 比较分子相似性指数分析, 人类A3腺苷受体配基

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2007年11月28日

【期刊论文】3-哌啶甲酸和四氢烟酸的4,4-二芳基-3-丁烯衍生物的三维定量构效关系(比较分子力场分析)研究

闻韧, ZHENG

中国药物化学杂志2004年8月第14卷第4期总60期/Chinese Journal of Medicinal Chemistry Aug., 2004, Vol. 14, No. 4, p. 197, Sum 60,-0001,():

摘要

目的 研究3-哌啶甲酸和四氢烟酸的4,4-二芳基-3-丁烯衍生物结构和对y-氨基丁酸摄取抑制活性之间的关系。方法 使用三维定量构效关系(3D-QSAR)-比较分子场分析(CoMFA)方法进行构效关系研究。结果 交叉验证系数q2和非交叉验证系数r2分别为0.726和0.986,方差比F为117.562,标准估计误差(SEE)为0.062。结论 这些数值表明所得的CoMFA模型有实际意义,并且对3-哌啶甲酸和四氢烟酸的4,4-二芳基-3-丁烯衍生物抑制活性具有较好的预测能力。

关键词: 药物化学, 三维定量构效关系 比较分子场分析, 3-哌啶甲酸衍生物, 四氢烟酸衍生物, GABA摄取抑制剂

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2007年11月28日

【期刊论文】应用比较分子力场法对3-取代的4,6-二氯吲哚-2-甲酸类化合物进行3D-QSAR 的研究

闻韧, SONG

Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences 2004, 13 (2),-0001,():

摘要

研究一系列新的C-3取代的4,6-二氯吲哚-2-甲酸类化合物的结构和它们与NMDA受体甘氨酸位点亲和活性之间的关系。方法 比较分子力场法(CoMFA)是一种三维定量构效关系(3D-QSAR) 研究方法。结果 所建立模型的交叉验证相关系数q2和非交叉验证相关系数r2分别为0.744和0.993,标准偏差E = 0.039,F = 261.343。结论 所得到的模型对该类化合物的活性会有较好的预测,用此模型设计的新化合物的活性预测数值也符合我们得到的结论。

关键词: 三维定量构效关系;比较分子力场法分析;C-3取代4 , 6-二氯吲哚-2-甲酸;N-甲基-D-天冬氨酸受体

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2008年04月25日

【期刊论文】新磺酰脲类化合物除草活性的3D-QSAR分析

王宝雷, 马宁, 王建国, 马翼, 李正名, 李永红

物理化学学报(Wuli Huaxue Xuebao)/Acta Phys. -Chim. Sin., June. 2004, 20(6): 577-581,-0001,():

摘要

用比较分子力场分析(CoMFA)方法和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)方法对所合成的新磺酰脲类化合物的除草活性进行了较为系统的3D-QSAR分析。两种方法所建立的模型对化合物的除草活性预测能力均较好,所得三维等值线图为合成高活性的化合物能提供指导作用。

关键词: 磺酰脲, 三维定量构效关系(3D-QSAR), 比较分子力场分析(CoMFA), 比较分子相似性指数分 析(CoMSIA)

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2008年04月25日

【期刊论文】脒类KARI酶抑制剂的分子对接和3D-QSAR研究

王宝雷, 王建国, 马翼, 李正名, 李永红, 王素华

化学学报2006年第64卷第13期,1373~1378/ ACTA CHIMICA SINICA Vol.64, 2006, No.13, 1373~1378,-0001,():

摘要

对设计合成的20个单脒类化合物的水稻KARI酶体外抑制活性和体内除草活性进行了分子对接和三维定量构效关系研究。前者采用Auto Dock3.0方法,研究发现化合物活性变化趋势与分子对接计算结果基本一致,通过分析化合物9与KARI酶活性氨基酸残基结合模式发现,残基Glu319,Asp315,Glu496,Gly253,Met254,Cys517等对氢键和静电相互作用以及疏水作用都有重要贡献;后者研究采用比较分子力场分析(CoMFA)方法,结果表明立体场和静电场对活性的贡献分别为67.8%和32.2%,交叉验证系数r2cv=0.774,非交叉验证r2=0.999,F=1593.134,标准偏差s=0.036,所建立的3D-QSAR模型对化合物除草活性具有较好的预测能力。两种方法研究结果为进一步设计合成更高活性的KARI酶抑制剂提供了指导。

关键词: KARI酶, 分子对接, 三维定量构效关系

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