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2010年10月19日

【期刊论文】Marinobacter segnicrescens sp. nov., a moderate halophile isolated from benthic sediment of the South China Sea

吴晓磊, Bin Guo, Jun Gu, Yu-Guang Ye, Yue-Qin Tang, Kenji Kida and Xiao-Lei Wu, Correspondence Xiao-Lei Wu

International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (2007), 57, 1970-1974,-0001,():

-1年11月30日

摘要

A Gram-negative, motile, non-spore-forming and moderately halophilic ellipsoid-shaped marine coccobacillus, designated strain SS011B1-4T, was isolated from benthic sediment of the South China Sea. Optimum growth occurred at 30-37 6C, pH 7.5-8.0 and 4-8% (w/v) NaCl. Strain SS011B1-4T utilized a variety of organic substrates as sole carbon sources, but did not utilize toluene, n-tetradecane or crude oil. Strain SS011B1-4T had ubiquinone-9 as the major respiratory quinone and C18: 1v9c, C16: 0 and C12: 0.3-OH as the predominant fatty acids. The genomic DNA G+C content was 62.2 mol%. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences showed that strain SS011B1-4T belonged to the genus Marinobacter of the Gammaproteobacteria. The results of the phenotypic, phylogenetic and genomic analyses revealed that strain SS011B1-4T represents a novel species of the genus Marinobacter. The name Marinobacter segnicrescens sp. nov. is therefore proposed, with strain SS011B1-4T (5LMG 23928T5CGMCC 1.6489T) as the type strain.

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2010年10月19日

【期刊论文】黄河三角洲湿地土壤微生物群落结构分析*

吴晓磊, 刘芳, 叶思源, 汤岳琴, 滝川清, 木田建次, 吴晓磊**

应用与环境生物学报,2007,13(5): 691~696,-0001,():

-1年11月30日

摘要

采用末端限制性片段长度多态性分析(T2RFLP)技术和16S rDNA克隆文库的方法, 分析了黄河三角洲滨海湿地土壤不同深度细菌和古菌的群落结构。研究表明, 随着深度的增加, 细菌群落的多样性下降, 而古菌群落多样性则有上升的趋势, 且土壤的细菌和古菌群落结构都呈现出规律的层状分布。该土壤包括各种硫酸盐还原菌、产甲烷古菌、光合细菌等丰富的细菌和古菌资源。

滨海湿地, 微生物群落结构, 末端限制性片段长度多态性分析, 16S rDNA 克隆文库, 种群多样性

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2010年10月19日

【期刊论文】提高微生物可培养性的方法和措施

吴晓磊, 郭斌, 吴晓磊*, 钱易

微生物学报,2006,46(3):504~507,-0001,():

-1年11月30日

摘要

目前自然界中只有极少部分微生物能够得到培养,严重阻碍了对微生物生命活动规律的研究和微生物资源的开发。改进传统培养方法,采用新型培养技术,提高微生物可培养性,大量培养自然界中存在的微生物,从而更全面、准确地了解微生物细胞的生命规律、获悉微生物群落中各种微生物之间的动态相互作用和相互协调的规律,对环境微生物工艺进行准确地设计、精细地调控和高效地利用。简要介绍了微生物不可培养的原因,系统总结了有关提高微生物可培养性方法的最新研究进展,提出研究中存在的问题,并阐述了模拟自然环境条件、强调微生物相互关系是提高微生物可培养性的关键。

微生物可培养性, 纯培养技术, 群体感应

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2010年10月19日

【期刊论文】油田回注水中硫酸盐还原原核生物的快速检测和群落结构分析

吴晓磊, 曾景海, 吴晓磊*, 赵桂芳, 钱易

环境科学,2006,27(5):972~976,-0001,():

-1年11月30日

摘要

利用荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization, FISH) 技术,采用荧光标记的rRNA 探针及其组合对胜利油田胜利采油厂回注水中硫酸盐还原原核生物(Sulfate reducing prokaryotes, SRPs, 包括硫酸盐还原细菌和硫酸盐还原古菌)进行检测,分析了该回注水中SRPs 群落结构。结果表明:SRPs在胜利油田回注水中具有极高的种群多样性,广泛分布于4个细菌门和1个古菌门;总数可达2.86×104个/mL,占回注水中总微生物细胞的20%左右;其中优势菌属为脱硫弧菌属(Desulf ovibrio)和脱硫肠状菌属(Desulf otomaculum), 分别占回注水微生物总细胞数的8.71%(±4.45%),和12.15% (±3.90%)Desulfobacterales 和Syntrophobacterales这2个目中的SRPs, Thermodesulf obacteriales 以及Thermodesulf ovibro属的SRPs分别占样品微生物总量的7159%(±2.92%),3.57%(±1.39%)和2.32%(±0.80%)。除此之外,也检测到了占微生物总量4.29%(±1.75%)的A rchaeoglobus 属的SRPs, 证明了古菌类SRPs是回注水中一个不容忽视的硫酸盐还原微生物种群。FISH法能够快速、准确地检测回注水中SRPs数量,解析SRPs群落结构。

荧光原位杂交, 硫酸盐还原原核生物, 基因探针, 群落结构, 绝迹稀释法

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2010年10月19日

【期刊论文】油井采出液中硝酸盐还原菌的分离培养及对硫酸盐还原的抑制*

吴晓磊, 谭燕, 程杰成, 屈睿, 吴晓磊**

应用与环境生物学报,2007,13 (3):390~394,-0001,():

-1年11月30日

摘要

采用油井采出液培养基和加入无机盐成分的改良油井采出液培养基,对大庆油田萨北过渡带油井采出液中的细菌进行分离培养及初步鉴定,比较了两种情况下培养出的具有硝酸盐和/或亚硝酸盐还原,以及/或反硝化能力菌群结构的差异。利用采出液培养基培养出一组新的微生物菌株,并且分离的硝酸盐和/或亚硝酸盐还原菌,以及/或反硝化细菌(Nitrate/nitrite reducing bacteria, denitrifying bacteria, NRDB)比例明显高于无机盐- 采出液培养基;但培养基中无机盐成分的添加,提高了可培养NRDB的群落生物多样性。仅仅向油井采出液中直接投加硝酸盐作为电子受体,对其中硝酸盐还原、亚硝酸盐还原和反硝化微生物(NRDB)的激活作用以及产抑制硫化物产生的能力有限,而同时加入分离自采出液的NRDB和硝酸盐则对硫酸盐还原菌(SRB)的生长和产硫化物活性都产生了明显的抑制。但是NRDB与硝酸盐同时投加对不同SRB的抑制效果并不相同,导致了SRB群落结构的变化。

微生物可培养性, 荧光原位杂交(, F ISH), , 硝酸盐还原菌, 硫酸盐还原菌

合作学者

  • 吴晓磊 邀请

    北京大学,北京

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