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2011年03月25日

【期刊论文】基于线粒体COI基因序列探讨长江华溪蟹的遗传分化

孙红英, 郑芳, 吕秀玲, 赵强

南京师大学报(自然科学版),2006,29(2):103~105,-0001,():

-1年11月30日

摘要

测定了长江华溪蟹3个亚种,包括指名亚种,桐柏亚种和陕县亚种共39个样本的线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COI)基因部分的序列。重建的系统发生结果显示,长江华溪蟹分化成2个分支,一支代表雄性第1腹肢末节呈平直型的指名亚种支;另一支则代表雄性第1腹肢末节弯向背内方的内弯型支,包括稍向内弯的桐柏亚种和明显内弯的陕县亚种在内。在内弯型支内,桐柏亚种和陕县亚种之间的遗传距离为01018,是两大分支间的1/10。提示长江华溪蟹COI基因的遗传分化与其雄性第1腹肢末节弯曲程度的形态分化基本一致。

长江华溪蟹,, 形态变异,, 遗传分化,, CO I基因

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2011年03月25日

【期刊论文】中华绒螯蟹与合浦绒螯蟹两地理亚种的线粒体DNA序列变异*

孙红英, 王光跃m张代臻, 周开亚**

动物学报,2005,51(5):862~866,-0001,():

-1年11月30日

摘要

根据线粒体16S rDNA的PCR/RFLP鉴定和对Cytb基因全序列的分析对中国大陆7水系绒螯蟹地理种群的遗传分化进行探讨。结果表明:中华绒螯蟹与合浦绒螯蟹两亚种在17条Cytb全序列上以40个固定的碱基变异位点相区别。前者分布在瓯江及其以北的水系;后者主要分布在瓯江及其以南的水系。发现了4种在鸭绿江以南的北方水系中生活的合浦亚种单元型,对这些单元型的形成提出了3种可能的解释。

中华绒螯蟹 合浦绒螯蟹 遗传变异 16S rRNA 细胞色素b

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2011年03月25日

【期刊论文】从线粒体16S rDNA序列探讨绒螯蟹类的系统发生关系*

孙红英, 周开亚**, 杨小军

动物学报,2003,49(5):592~599,-0001,():

-1年11月30日

摘要

测定了绒螯蟹类各物种的线粒体16SrDNA部分片段的序列,构建了NJ树、ML树和MP树。序列歧异数据比较和各系统发生树都支持新绒螯蟹属(Neoeriocheir)为一个独立的属。在3种系统发生树中,直额绒螯蟹(Eriocheirrecta)都是绒螯蟹属(Eriocheir)所有其它成员的姐妹群,并且广东珠江1只直额绒螯蟹标本的16SrDNA部分序列与台湾产台湾绒螯蟹(Eriocheir formosa)的相应序列相同。这些结果不支持平绒螯蟹属(Platyeriocheir)是一个有效的属,并表明E。formosa是E. recta的同物异名。绒螯蟹属(Eriocheir)所有其它成员聚为一个单系的分支,支持中华绒螯蟹、合浦绒螯蟹与日本绒螯蟹属于同一个物种Eriocheirjaponica。16SrDNA部分序列的比对表明,产于台湾的日本绒螯蟹的此段序列与合浦绒螯蟹的相同,产于崇明岛的和产于美国旧金山海湾的中华绒螯蟹的此段序列与中华绒螯蟹单元型B的序列相同。

绒螯蟹 系统发生关系 线粒体16S rRNA 基因

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2011年03月25日

【期刊论文】节肢动物线粒体基因组与系统发生重建

孙红英, 周开亚, 宋大祥

动物学研究,2003,24(6):467~479,-0001,():

-1年11月30日

摘要

对mt基因组的比较研究是探讨节肢动物系统发生的有效手段之一。基因的排列和DNA序列可以为重建节肢动物的系统发生提供有用的信息。目前,已测定mt基因组全序列的节肢动物已增加到44种。归纳、总结了节肢动物mt基因组的基本特征、基因顺序、基因重排的发生和机制等。简要评述基于mt基因组的节肢动物系统发生研究。

节肢动物, 线粒体基因组, 基因重排, DNA 序列变异, 系统发生重建

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2011年03月25日

【期刊论文】国大陆绒螯蟹线粒体16S rDNA序列变异分子鉴定标记*

孙红英, 周开亚**, 陆健健, , 杨光

自然科学进展,2002,12(5):485~490,-0001,():

-1年11月30日

摘要

选取了中国大陆东部6个水系合计110个绒螯蟹个体,通过DNA序列测定和PCR/RFLP分析,对线粒体16s rDNA部分片段的序列变异进行研究结果表明,在401bp的16s rDNA片段中,合浦绒螯蟹(Eruocheir japonica hepuensis)与中华绒螯蟹(E. j. sinensis)之间存在3~4个固定的碱基替代;合浦绒螯蟹的闽江、九龙江和南流江种群之间未发现碱基变异,表现为1种单元型(C型);中华绒螯蟹长江和辽河的种群中,有1个固定的碱基替代,表现为A,B两种单元型单元型之间的碱基变异反映了绒螯蟹地理种群之间的遗传歧异经,Jrn I酶切形成的16s rDNA酶切片段差异,为2个亚种的鉴定提供了一种准确、简捷的DNA分子标记对长江水系部分水域绒螯蟹的分子鉴定提示,长江下游至长江口以中华绒螯蟹的2个单元型为主,但已混有合浦绒螯蟹的单元型。在江苏、安徽渔场中的饲养种群分别属于单元型A型和B型16s rDNA的PCR/RFLP差异可作为正确鉴定中华绒螯蟹和合浦绒螯蟹的分子鉴定标记;16s rDNA片段中1个固定位点的碱基替代可作为区分中华绒螯蟹两种单元型的分子鉴定标记。

中华绒螯蟹 合浦绒螯蟹 16S rDNA序列变异 PCR/, RFLP分子鉴定标记

合作学者

  • 孙红英 邀请

    南京师范大学,江苏

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