本研究基于前期已获得的中华蜜蜂（简称中蜂）幼虫肠道转录组数据进行可变剪切（AS）基因分析，旨在揭示可变剪切基因在宿主响应球囊菌胁迫过程中的作用. 利用TopHat2软件鉴定已知的剪切位点；利用在线分析软件对各样品的可变剪切基因进行Venn分析；可变剪切基因利用Blast软件对可变剪切基因进行GO分类和KEGG代谢通路（pathway）富集分析.通过可变剪切分析本研究中，在正常（AcCK）及球囊菌胁迫的中蜂幼虫肠道样品（AcT1、AcT2、AcT3）中共鉴定出发生于9124个基因的57327个可变剪切事件，其中以基因间（17.68%）、可变3'端剪切（15.32%）、外显子跨越（14.12%）和可变5'端剪切（12.81%）类型为主.Venn分析结果显示4个肠道样品的共有可变剪切基因数为8111个，特有可变剪切基因数分别为272、189和385个.GO分类结果显示共有可变剪切基因分布在涉及47个GO terms，AcT1、AcT2、AcT3的特有可变剪切基因分别分布富集于24、20和34个GO terms条目.KEGG pathway富集分析结果显示，共有可变剪切基因富集在327个pathways，基因富集数最多的是RNA转运、内质网蛋白加工及核糖体；AcT1、AcT2、AcT3的特有可变剪切基因分别富集在22、46和83个pathways.本研究在转录组水平对中蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫的可变剪切基因进行全面分析，研究结果揭示了可变剪切基因在宿主的胁迫响应过程中的重要作用，为探究中蜂幼虫肠道的可变剪切基因的功能提供了丰富信息.