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李庆阁, 扈庆华, 郑薇薇, 石晓路, 叶宝英, 王冰, 庄志雄, 刘小立
CHfNA TROPlCAL MEDICINE Vol. 4 No.4 Angnst 2004,-0001,():
-1年11月30日
目的建立改良分子信标-实时PCR检测霍乱弧菌的快速方法,应用于霍乱监测。方法根据GenBank公布的霍乱弧菌肠毒素基因A亚单位(ctxA)的保守序列,设计一对引物和改良分子信标探针,并进行特异性和灵敏度分析; 同时以11种细菌作对照,建立改良分子信标检测霍乱弧菌的实时PCR反应体系,应用于霍乱监测。结果霍乱弧菌改良分子信标检测体系检测12种细菌,只有霍乱弧菌有荧光信号,与其他细菌无交叉反应,DNA灵敏度为102.4fg/ul,菌液灵敏度为32cfu/ml或3cfu反应体系,对100份海产品和30份腹泻病人大便标本进行检测,结果都为阴性。检测时间仅需2h结论改良分子信标-实时PCR检测体系快速、灵敏度高、特异性强,可用于霍乱的快速诊断,为霍乱的分子流行病学调查提供新的检测手段。∀
霍乱弧菌, 改良分子信标, 实时PCR, 快速检测
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引用
李庆阁, 张永有, 李庆阁*, 梁基选, 朱艳冰
ACTA BIOCHIMICA et BIOPHYSICA SINICA 2002, 34 (3): 329-332,-0001,():
-1年11月30日
基于分子信标的原理,设计了一种发夹型荧光探针作为限制性内切酶作用的专一底物,来研究限制性内切酶的剪切作用。检测Bg/II和NcoI表明,这种探针不仅可以灵敏、实时地指示内切酶的活性,采用不同荧光标记的探针还可以同时特异地显示双酶切反应中两个酶各自的活性。并且以Rotor2Gene 2000实时荧光PCR仪作仪器检测,实现了高通量的操作。利用其特有的作变温曲线的功能,能很好的区分限制性内切酶与发夹型荧光探针的特异剪切与非特异的结合。
限制性内切酶, 发夹探针, 实时检测
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引用
【期刊论文】双链置换探针实时PCR用于DNA池的等位基因频率测定
李庆阁, 程金平, 梁基选, 李庆阁*
厦门大学学报(自然科学版),2004,113~118,-0001,():
-1年11月30日
结合荧光双链置换探针的特异性和实时PCR的准确定量能力,建立了一种新颖、准确、价廉且高通量的测定DNA池等位基因频率的方法,该方法采用不同荧光标记的双链置换探针1次PCR反应即可测定出等位基因频率,实验以β-地中海贫血CDs41-42(-TCTT)突变为对象 分别用荧光染料FAM和ROX标记野生型和突变型探针,由实时CR检测建立的等位基因浓度与循环阈值的响应曲线计算DNA池的等位基因频率,结果表明,建立的系列等位基因浓度与循环阈值呈线性关系,线性相关系数分别为0.9977(野生型等位基因)和0.9938(突变型等位基因),可检测的最低等位基因频率达1%等位基因频率在1%~90%范围内测定误差小于4%该方法可广泛用于流行病学调查、遗传连锁分析以及全基因组连锁不平衡扫描等领域。
双链置换探针, 实时PCR, DNA池, 等位基因频率
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引用
李庆阁, 郭秋平, , 栾国彦, 梁基选
厦门大学学报(自然科学版),2002,(1)108~111,-0001,():
-1年11月30日
描述了一种利用特殊的双链引物突触引物,用于核酸扩增的特异定量检测,在传统的引物的5,端标记荧光物质,而在引物的互补序列的3,端标记荧光淬灭剂以封闭其延伸,二者杂交即成双链突触引物,在制备PCR反应混合物阶段以及加热的初期,突触引物保持稳定的双链结构而不能引导扩增,在退火阶段,突触引物部分解链导致引物延伸,荧光物质与淬灭剂分开而产生荧光,利用人β珠蛋白基因对此方法进行了验证,这种可自行退火的荧光引物不仅简单地实现了实时扩增,同时比常规的热启动PCR更有效地提高了扩增的特异性。
突触引物, 定量检测
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引用
李庆阁, 章晓波, 徐洵, ), 李庆阁), 徐丽美)
生物化学与生物理进展,2000,27(3):277~280,-0001,():
-1年11月30日
将对虾白斑杆状病毒的一段特异性DNA设计成分子信标探针,用于该病毒的PCR检测,温度与荧光强度之间的关系表明,所设计探针的发夹既可以形成也可以打开,符合PCR对分子信标探针的要求,结果表明,在PCR同时加入分子信标探针不影响PCR扩增,分子信标探针只能与目的DNA杂交,具有较高的特异性,随着PCR循环数的增加以及含目的DNA的质粒拷贝数的增加,荧光强度都随之增强。
对虾白斑杆状病毒, PCR, 分子信标探针
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