真海豚包括长喙真海豚和短喙真海豚2种，而中国水域的真海豚到底是哪一个种或是否同时有两个种的存在，并不清楚。本研究测定了12头中国水域真海豚mtDNA控制区366bp和细胞色素b（cytochInrnfIb，cyt 6）基因336 bp的序列，并与已发表的其它真海豚的序列合并分析，初步鉴定中国水域真海豚的分类地位。结果表明，中国水域的真海豚与东太平洋的长喙真海豚有相同的鉴别位点，且两者之间的核苷酸歧异度（控制区：1.93±0.22%，cyt 6基因：0.68±0.19%）显著低于与短喙真海豚之间的差异（控制区：2.92±0.41%，cyt 6基因：0.95±0.27%）。通过MJGA （rnokcular evolutionary genetic analysis）软件中的邻接法进行的系统发生分析中，中国水域的真海豚与长喙真海豚聚成一支，有明显较近的亲缘关系。因此，中国水域的真海豚在分类上应归属于长喙真海豚。