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2010年03月19日

【期刊论文】The phylogenetic position of the zokors (Myospalacinae) and comments on the families of muroids (Rodentia)

杨光, Ryan W. Norris, a, ; Kaiya Zhou, b, ; Caiquan Zhou, b; Guang Yang, b; C. William Kilpatrick, a; and Rodney L. Honeycutt c

Molecular Phylogenetics and Evolution 31(2004)972-978,-0001,():

-1年11月30日

摘要

Recent molecular studies have concluded that the genus Myospalax evolved from within the rodent subfamily Cricetinae. This conclusion was tested using the complete sequences from the mitochondrial 12S rRNA and cytochrome b genes. Based on our analyses, Myospalax appears to be sister to a clade containing the subfamilies Spalacinae and Rhizomyinae, and all three of these lineages appear to be basal to the superfamily Muroidea. Based on the position of these three lineages, we suggest that they be placed in a distinct family, the Spalacidae, rather than subsumed as subfamilies in the family Muridae. Finally, our analyses suggest that the earlier placement of Myospalax as a member of the Cricetinae is the result of a single misidentified specimen, which was not a Myospalax.

Myospalacinae, Muroidea, Muridae, Spalacidae, 12S rRNA, Cytochrome b

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2010年03月19日

【期刊论文】Molecular systematics of the Asian mitten crabs, genus Eriocheir (Crustacea: Brachyura)

杨光, Boping Tang, a, ; Kaiya Zhou, *; Daxiang Song, a; Guang Yang, a and Aiyun Dai b

Molecular Phylogenetics and Evolution 29(2003)309-316,-0001,():

-1年11月30日

摘要

To help resolve phylogenetic relationships among the mitten crabs, complete sequences of the nuclear DNA internal transcribed spacer (ITS) and portions of the mitochondrial genome corresponding to the cytochrome oxidase I (COI), were sequenced for all Asian mitten crabs of the genus Eriocheir and seven species of the Grapsoidea. The resulting phylogeny supports the establishment of a separate genus Neoeriocheir, but does not provide justification for the recognition of Platyeriocheir. A female mitten crab specimen from the Zhujiang River, China, was considered to be Eriocheir recta (Stimpson, 1858), a species previously synonymized with Eriocheir japonica (de Haan, 1835). In the ITS analysis, a sequence from Eriocheir formosa (from Taiwan) falls within a wellsupported E. recta group, which indicates that E. formosa may have to be synonymized with E. recta. Three previously recognized members of the genus, E. japonica, Eriocheir sinensis, and Eriocheir hepuensis constitute a monophyletic sister group to E. recta in all phylogenetic trees. We provide evidence for the conspecific status of these taxa. Phylogenetic trees based on COI and combined COI and ITS sequences indicate that E. japonica consists of three subgroups. Since the name E. japonica (de Haan, 1835) takes precedence over E. sinensis (H. Milne Edwards, 1853) and E. hepuensis Dai, 1991, we suggest that these three subgroups correspond to three subspecies of E. japonica: E. j. japonica, E. j. sinensis, and E. j. hepuensis.

Mitten crabs, Systematics, rDNA ITS, mtDNA COI

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2010年03月19日

【期刊论文】鲸类分子系统学研究进展

杨光, 杨 光, 季国庆, 魏辅文

动物分类学报,2003,28(3):367~373,-0001,():

-1年11月30日

摘要

综述了近年来分子生物学标记技术在鲸类系统学研究中的进展。分子生物学证据支持鲸目与有蹄类之间有较近的亲缘关系,并支持鲸类的单系起源,但鲸类不同类群(须鲸类、抹香鲸类及不包括抹香鲸类的齿鲸类)之间的系统发生关系仍存在争议。抹香鲸类到底与须鲸类还是与其它齿鲸类有更近的亲缘关系,不同的分子生物学家所得到的结果并不一致。此外,分子生物学技术还被用于解决须鲸亚目和齿鲸亚目内科间以及科内种间的系统发生关系,特别是齿鲸亚目的海豚科、鼠豚科和淡水豚类。通过分子标记技术来研究鲸类种下的遗传结构是鲸类分子系统学研究中的一个新热点,使用的标记主要是mtDNA控制区、核DNA微卫星和主要组织相容性复合体(major histo. compatibility complex, MHC)等。

鲸类, 分子系统学

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2010年03月19日

【期刊论文】中国大陆梅花鹿mtDNA控制区序列变异及种群遗传结构分析

杨光, 刘海, , 魏辅文, 李明, 胡锦矗

动物学报,2003,49(1):53~60,-0001,():

-1年11月30日

摘要

测定了37只中国大陆梅花鹿(Cervusnippon)不同种群mtDNA控制区5端351bp的序列,共发现23个变异位点,定义了5种单元型。分子变异分析表明,中国大陆梅花鹿出现了显著的种群分化(Фst=0.45,Fst=0.60,P<0.001),支持把分布于东北、华南和四川的梅花鹿种群归入各自独立的管理单元。中国大陆、日本南部和日本北部之间无共享单元型,且有25个鉴别位点。最小跨度网络图(Minimumspanningnetwork,MSN)和基于最大似然法和邻接法的系统发生分析均把单元型聚类为对应于中国大陆、日本南部和日本北部的三个单系,其中中国大陆和日本南部梅花鹿有相对较近的亲缘关系,支持日本梅花鹿的祖先通过至少两个大陆桥从亚洲迁移到日本的观点[动物学报49(1):53~60,2003]。

梅花鹿, mtDNA控制区, 遗传结构, 保护

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2010年03月19日

【期刊论文】台湾海峡厦门一东山水域瓶鼻海豚的种群密度、分布和误捕研究

杨光, 周开亚, 徐信荣

生态学报,2000,30(6):1002~1008,-0001,():

-1年11月30日

摘要

台湾海峡厦门-东山水域瓶鼻海豚(Tursiops aduncus)的种群密度约为0.0436±O.0286头/km2,该水域南部瓶鼻海豚的发现辛高于中部和北部;问卷谓查和随船出海调查表明围网作业发现和误捕小型鲸类的频率要高于拖网,同时拖网又高于刺网。调查期间从东山港记录到的误捕致死的20头小型鲸类中,6头(占30%)为瓶鼻海豚,分别由拖罔和围网捕获,需要开展对当地渔民的宣传教育和加强台湾海峡瓶鼻海豚等小型鲸类的种群生物学和保护生物学的研究。

瓶鼻海豚, 小型鲸类, 种群, 误捕, 台湾海峡

合作学者

  • 杨光 邀请

    南京师范大学,江苏

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