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2010年03月19日

【期刊论文】白鱀豚MHC基因类DQBl座位第二外元的序列变异分析

杨光, 严洁①, 杨光①, 周开亚①, 魏辅文②

动物学报,2003,49(1):501~507,-0001,():

-1年11月30日

摘要

测定了45个克隆的白紧豚(Lipotes zexilifer)MHCⅡ类基因DQB座位第二外元172bp的核苷酸序列,共获得15种序列,发现了22个变异位点。核苷酸的非同义替换明显多于同义替换,并造成了15个氨基酸的改变。氨基酸的替换趋于集中在假定的与抗原的选择性识别相关的位点附近。白鱀豚DQB基因的核苷酸和氨基酸序列与文献报道的白鲸(Delphinapterus leutcas)和一角鲸(Moncdon monoceroS)DQBl序列具有较高的同源性。氨基酸序列不具备人及其它一些灵长类动物DQB2基因所共有的基序(Motif),而与牛DQBl基因的基序相近,说明本研究得到的白紧豚MHC序列应属于类DQBl基因。同一个体出现了多种序列的情况,提示白鱀豚的DQB基因可能存在着座位重复。白鱀豚的类DQBl座位的序列中存在多种基序的不同组合,推测是由于基因转换造成的。

白鱀豚, MHC类DQBl(, DQBL-like), 座位, 基因重复, 基因转换

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2010年03月19日

【期刊论文】线粒体DNA序列分析在中国水域真海豚物种鉴定中的初步应用

杨光, 王加连, 刘海, 周开亚, 魏辅文

兽类学报,2003,23(2):120~126,-0001,():

-1年11月30日

摘要

真海豚包括长喙真海豚和短喙真海豚2种,而中国水域的真海豚到底是哪一个种或是否同时有两个种的存在,并不清楚。本研究测定了12头中国水域真海豚mtDNA控制区366bp和细胞色素b(cytochInrnfIb,cyt 6)基因336 bp的序列,并与已发表的其它真海豚的序列合并分析,初步鉴定中国水域真海豚的分类地位。结果表明,中国水域的真海豚与东太平洋的长喙真海豚有相同的鉴别位点,且两者之间的核苷酸歧异度(控制区:1.93±0.22%,cyt 6基因:0.68±0.19%)显著低于与短喙真海豚之间的差异(控制区:2.92±0.41%,cyt 6基因:0.95±0.27%)。通过MJGA (rnokcular evolutionary genetic analysis)软件中的邻接法进行的系统发生分析中,中国水域的真海豚与长喙真海豚聚成一支,有明显较近的亲缘关系。因此,中国水域的真海豚在分类上应归属于长喙真海豚。

真海豚, 线粒体DNA, 控制区, 细胞色素b基因, 中国水域

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2010年03月19日

【期刊论文】中国大陆梅花鹿mtDNA控制区序列变异及种群遗传结构分析

杨光, 刘海, , 魏辅文, 李明, 胡锦矗

动物学报,2003,49(1):53~60,-0001,():

-1年11月30日

摘要

测定了37只中国大陆梅花鹿(Cervusnippon)不同种群mtDNA控制区5端351bp的序列,共发现23个变异位点,定义了5种单元型。分子变异分析表明,中国大陆梅花鹿出现了显著的种群分化(Фst=0.45,Fst=0.60,P<0.001),支持把分布于东北、华南和四川的梅花鹿种群归入各自独立的管理单元。中国大陆、日本南部和日本北部之间无共享单元型,且有25个鉴别位点。最小跨度网络图(Minimumspanningnetwork,MSN)和基于最大似然法和邻接法的系统发生分析均把单元型聚类为对应于中国大陆、日本南部和日本北部的三个单系,其中中国大陆和日本南部梅花鹿有相对较近的亲缘关系,支持日本梅花鹿的祖先通过至少两个大陆桥从亚洲迁移到日本的观点[动物学报49(1):53~60,2003]。

梅花鹿, mtDNA控制区, 遗传结构, 保护

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2010年03月19日

【期刊论文】马边大风顶自然保护区大熊猫种群生存力模拟分析

杨光, 任文华, , 魏辅文, 胡锦矗

兽类学报,2002,22(4):264~269,-0001,():

-1年11月30日

摘要

采用漩涡模型Vortex mondel 7.3,模拟了马边大风顶自然保护区大熊猫种群在未来100年内的变动趋势。结果显示:在无交配限制、无密度制约、无近亲交配衰退等条件下,马边大风顶自然保护区大熊猫种群数量呈下降趋势;在考虑近交衰退的影响后,遗传多样性水平降低,灭绝率提高;竹子开花虽能加速大熊猫种群的绝灭,但由于保护区分布有多个竹种,因此并不会对大熊猫种群产生灾难性影响;但是人为捕杀可迅速减少大熊猫种群数量,加速其灭绝过程。因此,对该保护区大熊猫进行保护的最重要措施就是严格控制人为捕杀,并保护栖息地及走廊带。

大熊猫, 漩涡模型, 种群生存力分析, 保护

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2010年03月19日

【期刊论文】MHC及其在种群遗传学和保护遗传学中的应用

杨光, 陈旭衍, 任文华, 严洁

遗传,2002,24(6):712~714,-0001,():

-1年11月30日

摘要

主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex, MHC)是脊椎动物体内与免疫应答调节密切相关的一个基因家族,是基因组中多态性最丰富的区域。通过MHC的遗传变异分析可以提供物种的遗传多样性水平、进化历史和种群动态,以及种群遗传结构等信息,并在濒危物种饲养繁殖种群的遗传管理中有重要应用。

主要组织相容性复合体, 遗传多样性, 种群生存力, 种群遗传结构, 饲养繁殖

合作学者

  • 杨光 邀请

    南京师范大学,江苏

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