A Gram-negative, non-motile, rod-shaped bacterium, strain SS011B1-20T, was isolated from sediments of the South China Sea. Growth occurred at NaCl concentrations between 0 and 10% and at temperatures between 10 and 37 6C. Strain SS011B1-20T contained Q-10 as the major respiratory quinone and C18: 1v7c (81.2%), C16: 0 (7.0%) and C18: 1 methyl (4.3%) as the predominant fatty acids. The G+C content of the genomic DNA was 64.7 mol%. A phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene sequence indicated that strain SS011B1-20T belonged to a clade within the genus Oceanicola in the Alphaproteobacteria, the highest sequence similarities being found with respect to Oceanicola batsensis (96.3%) and with Oceanicola granulosus (94.9%). Strain SS011B1-20T could be clearly distinguished from other Oceanicola species on the basis of the genotypic, phenotypic and phylogenetic data. Thus, it is proposed that strain SS011B1-20T represents a novel species of the genus Oceanicola, with the name Oceanicola nanhaiensis sp. nov. The type strain is SS011B1-20T (=LMG 23508T=CGMCC 1.6293T).

采用末端限制性片段长度多态性分析（T2RFLP）技术和16S rDNA克隆文库的方法, 分析了黄河三角洲滨海湿地土壤不同深度细菌和古菌的群落结构。研究表明, 随着深度的增加, 细菌群落的多样性下降, 而古菌群落多样性则有上升的趋势, 且土壤的细菌和古菌群落结构都呈现出规律的层状分布。该土壤包括各种硫酸盐还原菌、产甲烷古菌、光合细菌等丰富的细菌和古菌资源。

应用末端标记限制性片段长度多态性（Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism, T2RFLP）和克隆文库分析，以微生物群落16S rRNA基因（16S rDNA）为目标，对大庆油田过渡带油井采出液 （于2005年7月和10月取样）中的微生物群落结构进行了解析和比较。T2RFLP分析表明，2005年7月和10月油井采出液中古菌群落结构较为单一，随时间变化不大；而细菌群落结构较为复杂，不同时间群落中的优势菌有明显的差别。古菌和细菌16S rDNA片段测序和系统发育分析表明，大庆油田过渡带油井采出液古菌群落中的优势菌均为产甲烷菌；细菌群落中的优势菌则与β、γ、δ、ε变形杆菌（Proteobacteria） 、拟杆菌（Bacte-roidetes）和脱铁杆菌（Deferribacteres）有较高的相似性, 细菌群落中检出了大量的未培养微生物（Deep-branching lineages）。

末端限制性酶切片段长度多态性分析（terminal restriction hagment length polymorphism，T-RFLP）是近年来发展起来的、不依赖于培养的微生物群落分析方法之一。由于其在微生物群落结构分析方面的特点，包括分辨率高、易于实现自动化及互联网海量数据共享等优势，自1997年最先被报道以来得到了广泛的应用，成为环境微生物群落分析的最强有力的工具之一。本文详细介绍了T-RFLP技术的原理，并从环境样品群落DNA的提取、引物设计和PCR扩增、限制性酶切、电泳分离检测和T-RFLP图谱解析等5个方面讨论了用该技术解析环境微生物群落的方法和技巧，简述了近8a来国外T_RFLP技术在群落分析中的研究进展。类似于其他的分子微生物生态学技术，T-RFLP也有自身的缺陷，因此重点分析了该技术的局限性及相应的解决办法。