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2011年01月14日

【期刊论文】基于小波的压缩图像索引技术

曾振柄, 张问银

计算机应用,2006,26(5):1004~1005,-0001,():

-1年11月30日

摘要

在JPEG2000压缩框架下给出了两种压缩图像索引方法,不需要完全解压缩,减少了数据处理量。实验结果证明,给出的索引方法具有很强的图像表征能力,利用该索引进行图像检索,提高了检索效率。

压缩图像索引, 小波提升, JPEG2000

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2011年01月14日

【期刊论文】Prediction of subcellular protein localization based on functional domain composition

曾振柄, Peilin Jia a, b, e, Ziliang Qian a, ZhenBin Zeng g, Yudong Cai c, d, *, Yixue Li a, f

Biochemical and Biophysical Research Communications 357 (2007) 366–370,-0001,():

-1年11月30日

摘要

Assigning subcellular localization (SL) to proteins is one of the major tasks of functional proteomics. Despite the impressive technical advances of the past decades, it is still time-consuming and laborious to experimentally determine SL on a high throughput scale. Thus, computational predictions are the preferred method for large-scale assignment of protein SL, and if appropriate, followed up by experimental studies. In this report, using a machine learning approach, the Nearest Neighbor Algorithm (NNA), we developed a prediction system for protein SL in which we incorporated a protein functional domain profile. The overall accuracy achieved by this system is 93.96%. Furthermore, comparisons with other methods have been conducted to demonstrate the validity and efficiency of our prediction system. We also provide an implementation of our Subcellular Location Prediction System (SLPS), which is available at http://pcal.biosino.org.

Protein subcellular localization, Pfam, Nearest Neighbor Algorithm

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2011年01月14日

【期刊论文】基于图形理解的汉字构形自动分析系统

曾振柄, 陈良育, , 张问银

计算机应用,2005,25(7):1629~1631,-0001,():

-1年11月30日

摘要

汉字构形自动分析系统将计算机视觉,图像理解等领域中业已成熟的诸多技术,应用到汉字构形学研究的各主要环节。以GB2312280汉字集合所生成的构件图片为基础对象,生成了汉字部件构形描述。有效率达90%以上。

汉字, 构件, 部件, 构形分析, 特征提取

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2011年01月14日

【期刊论文】Petri网系统的可达性分析

曾振柄

,-0001,():

-1年11月30日

摘要

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2011年01月14日

【期刊论文】一种基于图论的计算蛋白质数据库代表序列的算法

曾振柄, 刘鹏飞, , 蔡煜东·

计算机与应用化学,2008,25(5):607~610,-0001,():

-1年11月30日

摘要

许多生物序列数据库中都含有大量的冗余序列,这些序列通常不利于对数据库的统计分析和处理,而且它们要战胜更多的计算存储和处理资源。针对这个问题,本文中我们设计了一种去除蛋白质冗余序列的算法。该算法基于图论最大独立集的概念来生成非冗余序列集合,对目前存在的不少蛋白质去冗余程序所采用的由Hobohm和Sander最早设计的一种首先将序列分成若干簇然后取出代表序列的算法进行了改进,使得生成了更多的非冗余代表序列集合,避免了一些非冗余的序列也被去除。我们开发出了实现该算法的程序FastCluster,可以用来去除蛋白质数据库中的冗余序列。

生物信息学, 最大独立集, 代表序列, 去冗余

合作学者

  • 曾振柄 邀请

    华东师范大学,上海

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