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2005年05月28日

【期刊论文】Detection and analysis of alternative splicing in the silkworm by aligning expressed sequence tags with the genomic sequence

夏庆友, X.-F. Zha, Q.-Y. Xia, P. Zhao, J. Li, J. Duan, Z.-L. Wang, J.-F. Qian and Z.-H. Xiang

Insect Molecular Biology (2005) 14 (2), 113-119,-0001,():

-1年11月30日

摘要

We identified 277 alternative splice forms in silkworm genes based on aligning expressed sequence tags with genomic sequences, using a transcipt assembly program. A large fraction (74%) of these alternative splices are located in protein-coding regions and alter protein products, whereas only 26% are in untranslated regions. From the alternative splices located in protein-coding regions, some (43%) affect protein domains that bind various biological molecules. The vast majority of the detected alternative forms in this study appear to be novel, and potentially affect biologically meaningful control of function in silkworm genes. Our results indicate that alternative splicing in silkworm largely produces protein diversity and functional diversity, and is a widely used mechanism for regulating gene expression.

alternative splicing,, Bombyx mori,, genome,, EST.,

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2005年05月28日

【期刊论文】Identification and expression pattern of Bmlark, a homolog of the Drosophila gene lark in ombyx mori

夏庆友, Zi-Long Wang *, Juan Li *, Qing-You Xia †, Ping Zhao, Jun Duan, Xing-Fu Zha and Zhong-Huai Xiang

,-0001,():

-1年11月30日

摘要

Two Bombyx mori isoforms of the gene lark, which is shown to play an important role in Drosophila circadian rhythms, were identified and named Bmlark-PA and Bmlark-PB, respectively. Bmlark-PA consists of 5 exons and encodes a protein of 343 amino acid residues which contains 3 functional domains: two RRM (RNA recognization motif) domains and an RTZF (retroviral-type zinc finger), and shares 72% identity with the Drosophila gene lark at the amino acid level. Bmlark-PB lacks the sequence between 118 and 791 nt of Bmlark-PA and codes for a protein of 68 amino acid residues, which contains no distinct functional domains. Alignments of the cDNAs of Bmlark to the genomic draft sequence of B. mori showed that the gene Bmlark had a single copy in the genome, suggesting that an alternative splicing mechanism occurs in the gene Bmlark. RT-PCR analysis indicated that Bmlark-PA was expressed only in late pupae and adult but Bmlark-PB was broadly expressed in many tissues and throughout the developmental stages from embryo to adult.

Bombyx mori, homolog, in silico cloning, circadian rhythm, alternative splicing

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2005年05月28日

【期刊论文】siRNA介导的家蚕ABC转运蛋白相关基因的干涉研究

夏庆友, 王根洪, 刘春, 侯勇, 李娟, 赵萍

,-0001,():

-1年11月30日

摘要

由siRNA(short interfering RNAs)介导的RNAi作为一种工具已被广泛用于基因功能研究中,并有望在不久的将来成为防治生物体疾病的强大工具。本研究通过显微注射,在家蚕中首次以siRNA介导的方式,对家蚕ABC 转运蛋白(ATP Binding Cassette Transporter)系列相关基因(Bmwh1,Bmwh2,Bmwh3)进行了siRNA干涉研究,在部分基因中得到了高效特异的干涉现象。比较分析结果初步证实siRNA正义链3’碱基错配可以增强siRNA的干涉效果。同时,实验显示了siRNA较之于dsRNA介导的RNAi具有较强的优势,表明siRNA介导的RNAi可作为基因功能分析和未来的基因操作手段在家蚕中进行应用。

siRNA, RNAi, ABC, 转运蛋白, 显微注射

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2005年05月28日

【期刊论文】家蚕不同品种与个体的血液胰凝乳蛋白酶抑制剂差异研究

夏庆友, 赵萍, 藤井博, 伴野丰

蚕业科学,2003,29(4):349~354,-0001,():

-1年11月30日

摘要

胰凝乳蛋白酶抑制剂(Chymotrypsin inhibitor,CI)是家蚕血液中主要的蛋白酶抑制因子,为其正常生长发育所不可缺少,研究a对阐明家蚕正常生理以及害虫防治等都具有重要意义。采用pH8.3、4.0聚丙烯酰胺凝胶电泳和CI活性染色法,对6个家蚕品种血液中的蛋白质含量和CI活性进行了测定,并对各品种CI活性的个体差异性进行了分析。结果表明:结合pH 8.3和pH4.O的电泳条件,可检测出Ict-D,Ict-E,Ict-A,Ict-B,Ict-H基因所支配的15种CI;6个品种中有3个具有CI个体差异性,而且Ict-E和Ict-B在有的品种或个体无活性,为非必需种类。

家蚕, 血液, 胰凝乳蛋白酶抑制剂, 比活性, 个体差异

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2005年05月28日

【期刊论文】家蚕母性基因的表达序列标签分析

夏庆友, 邱咏梅, 夏庆友*, 程道军, 沈以红, 刘春, 林英, 查幸福, 向仲怀

昆虫学报,2004,47(2):159-165,-0001,():

-1年11月30日

摘要

为了研究家蚕Bombyx mori卵中储存的母性遗传信息,以未受精的肾脏型和正常型蚕卵为材料构建了cDNA文库,并对其随机测序,共获得391条表达序列标签(EST)序列,经拼接后得到374条非重复序列。生物信息学分析发现,172个非重复序列与国际数据库GenBank和silkbase中的已知基因具有较高的相似性。除3个已知母性基因外,其余主要与DNA复制、能量代谢、信号转导、转录、蛋白质结构以及胚胎发育中个体形成等相关:该结果可为进一步研究家蚕胚胎早期发育的调控提供基础数据。

家蚕, 表达序列标签, 未受精卵, 胚胎发育, 母性基因

合作学者

  • 夏庆友 邀请

    西南农业大学,重庆

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