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2009年09月27日

【期刊论文】Regression analysis between body and head measurements of Chinese alligators (Alligator sinensis) in the captive population

吴孝兵, X. B. Wu, H. Xue, L. S. Wu, J. L. Zhu & R. P. Wang

Animal Biodiversity and Conservation Vol. 29 No.1 (2006) 65-71,-0001,():

-1年11月30日

摘要

Regression analysis between body and head measurements of Chinese alligators (Alligator sinensis) in the captive population.— Four body–size and fourteen head–size measurements were taken from each Chinese alligator (Alligator sinensis) according to the measurements adapted from Verdade. Regression equations between body–size and head–size variables were presented to predict body size from head dimension. The coefficients of determination of captive animals concerning body–and head–size variables can be considered extremely high, which means most of the head–size variables studied can be useful for predicting body length. The result of multivariate allometric analysis indicated that the head elongates as in most other species of crocodilians. The allometric coefficients of snout length (SL) and lower ramus (LM) were greater than those of other variables of head, which was considered to be possibly correlated to fights and prey. On the contrary, allometric coefficients for the variables of obita (OW, OL) and postorbital cranial roof (LCR), were lower than those of other variables.

Regression analysis, Allometry, Chinese alligator

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2009年09月27日

【期刊论文】扬子鳄的线粒体全基因组与鳄类系统发生

吴孝兵, 吴孝兵①③, 王义权①②*, 周开亚①, 朱伟栓①, 聂继山④, 王朝林④

科学通报,2003,48(18):1954~1958,-0001,():

-1年11月30日

摘要

通过酶切、克隆、测序、结合Long-PCR和PrimerWalking法对扬子鳄线粒体DNA基因组进行全序列测定,结果表明,扬子鳄线粒体基因组DNA序列全长为16746bp,其基因组碱基组成为29.43%A,24.59%T,14.86%G,31.12%C.与其他大多数脊椎动物相同,其基因组由13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因及1个非编码的控制区(D-loop)组成,基因的排列与已测序的鳄类相似在全序列分析的基础上,对12SrRNA基因序列、16SrRNA基因序列、蛋白质编码基因序列及其合并数据用MP法和ML法构建系统发生树,结果表明扬子鳄与密河鳄的亲缘关系较近,支持传统观点根据树的支长数值估计钝吻鳄属发生的时间为74.9MaBP,扬子鳄与密河鳄分歧的时间为50.9MaBP.

扬子鳄, 线粒体基因组, 全序列, 系统发生, 分歧时间

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2009年09月27日

【期刊论文】扬子鳄鞣制皮革和鳞片的DNA提取方法*

吴孝兵, 史燕, 吴孝兵**, 晏鹏, 赵哲

动物学报,2004,50(2):297~301,-0001,():

-1年11月30日

摘要

运用一种改进的提取方法,作者从鞣制皮革中成功地提取了总DNA,同时还对尾尖皮、鳞片、盐腌生皮等皮质进行了DNA提取;用12SrRNA基因扩增的通用引物、扬子鳄鉴别引物、微卫星引物及RAPD引物进行PCR扩增,并对部分扩增结果进行测序,以检验提取效果。结果证明,几种皮质标本都可提取出DNA,其中尾尖皮和鳞片的提取效果较好,用四种引物都可扩增出明显亮带;盐腌生皮和鞣制皮提取结果也很好,并且用12SrRNA通用引物、扬子鳄鉴别引物扩增的亮带较明显,可进行扬子鳄皮质用品等的分子鉴定及部分序列的扩增和测序研究[动物学报50(2):297-301,2004]。

扬子鳄, 皮革, 总DNA, PCR

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2009年09月27日

【期刊论文】扬子鳄MHC Ⅱ类B基因第二外元的克隆及序列分析

吴孝兵, 史燕, 吴孝兵*, 晏鹏, 陈壁辉

动物学研究,2004,25(5):415~421,-0001,():

-1年11月30日

摘要

3头扬子鳄血样取自宣城安徽省扬子鳄繁殖研究中心。利用一对简并引物对MHCⅡ类B基因第二外元的部分片段进行扩增;通过克隆、单链构象多态性分析、测序,并将测得序列与下载的8个物种MHC序列比对,确定序列差异和变异位点;利用MEGA软件构建NJ树,PAUP4.0构建MP树。结果得到10种不同的序列,片段长166bp。核苷酸序列中有38个变异位点,氨基酸序列中有23个变异位点;推定的抗原结合位点非同义替换(dN)明显高于同义替换(dS)。10种序列的NJ树和MP树极为相似,均为A、B两个分支,两个分支明显的特异性位点核苷酸序列中有9个,氨基酸序列中有7个。表明扬子鳄MHCⅡ类B基因第二外元有较高的多态性,有利于扬子鳄饲养种群的遗传保护。

扬子鳄, MHC Ⅱ类B基因第二外元, 序列分析

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2009年09月27日

【期刊论文】野生扬子鳄生境特征分析

吴孝兵, 吴陆生, 吴孝兵*, 江红星, , 王朝林

生物多样性,2005,13(2):156~161,-0001,():

-1年11月30日

摘要

作者分别于2002和2003年抽样调查了安徽省扬子鳄国家级自然保护区有或曾经有野生扬子鳄(Alligatorsinensis)分布的22个样地,选择了与野生扬子鳄生存有关的8类生态因子,即水域中岛屿情况、水域水面的稳定度、水体pH值、螺类丰富度、岸线植被盖度、岸线土壤质地、苦竹密度和植被类型,运用资源选择函数结合主成分分析方法研究了野生扬子鳄对生境的选择。结果表明岸线植被盖度对野生扬子鳄的生境选择影响最大,其次是水体pH值,再次是螺类丰富度、苦竹密度、水域水面的稳定度和土壤质地;而水域中岛屿情况与植被类型对野生扬子鳄生境选择的影响则较弱。

Alligator sinensis, 生境特征, 资源选择函数, 主成分分析

合作学者

  • 吴孝兵 邀请

    安徽师范大学,安徽

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