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2005年05月23日

【期刊论文】利用RAPD标记构建响叶杨和银白杨分子标记连锁图谱*

尹佟明, 黄敏仁X, X, 王明庥, 朱立煌, 何平, 翟文学

植物学报,1999,41(9):956~961,-0001,():

-1年11月30日

摘要

利用RAPD标记响叶杨(Populus adenopoda Maxim.)×银白杨(P. alba L.)的F1群体,按照拟测交的作图策略,分别构建了响叶杨和银白杨的分子标记连锁图谱。实验过程中对600个随机的寡核苷酸引物进行了重复筛选,共选出128个引物用于作图群体的随机扩增,选择符合1:1分离的拟测交位点。作图群体大小为82个单株(包括双亲)。结果获得了326个拟测交分离位点和7个3:1分离位点。拟测交位点中有238个位点来源于银白杨,有88个位点来源于响叶杨。经偏分离检测,用于银白杨作图的位点共计212个(26个位点偏分离),用于响叶杨作图的位点共计78个(10个位点偏分离)。利用多点连锁分析,银白杨中有189个连锁标记构成了20个不同的连锁群(4个以上标记),6个三连体和16个连锁对,连锁标记覆盖的总图距为2402.4cM(centimorgan)。而响叶杨有41个连锁标记分属于12个不同的连锁群(2个以上标记),标记覆盖的总图距为479.4cM。获得了中等密度的银白杨连锁图谱和响叶杨图谱的一个连锁框架。

分子标记连锁图谱,, 随机扩增多态性DNA,, 响叶杨,, 银白杨,, 拟测交

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2005年05月23日

【期刊论文】利用RAPD标记构建美洲黑杨×欧美杨分子标记连锁图谱

尹佟明, 张新叶, 诸葛强, 黄敏仁, 朱立煌, 翟文学, 邬荣领, 王明庥

遗传HEREDITAS (Beijing) 2000,22(4):209~213 ,-0001,():

-1年11月30日

摘要

本文利用RAPD标记和美洲黑杨(Populus deltoides)×欧美杨(P. euramericana)的F1群体,构建了美洲黑杨×欧美杨的分子标记连锁图谱。实验过程中对1040个寡核苷酸随机引物进行了重复筛选,共选出127个引物用于作图群体(包括双亲共92个无性系)的随机扩增,这127个引物产生229个多态基因座,其中符合“拟测交”1:1分离的有214个。利用多点连锁分析,形成19个连锁群及6个三连体和14个连锁对。由19个连锁群构成的图谱含标记129个,总图距为191412cM,覆盖杨树基因组约73162%。标记间的平均间距为14184cM。本研究获得了中等密度的美洲黑杨×欧美杨的一个连锁框架。

分子标记连锁图谱, RAPD, 美洲黑杨×欧美杨

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2005年05月23日

【期刊论文】四甲基氯化铵在杨树RAPD扩增反应中的作用

尹佟明, 李淑娴, 郑阿宝, 王明庥

植物资源与环境学报,2001,10(2):11-13,-0001,():

-1年11月30日

摘要

根据20个不同RAPD随机引物对杨树DNA的扩增结果,对四甲基氯化铵(TMACI)在杨树RAPD扩增反应中的作用进行了研究,发现TMACI可明显改善杨树的RAPD扩增效果,因此TMACI可作为一种有效成分加入杨树RAPD反应体系中。同时比较了不同浓度的TMACI对杨树RAPD扩增反应的影响,确定最适合杨树RAPD扩增反应的TMACI浓度为10~50μmolPL。利用3个具亲缘关系的杨树家系对含TMACI的RAPD反应体系的实验结果进行验证,证实该体系获得的遗传信息是可靠的。

四甲基氯化, RAPD, 扩增反应特异性, 杨树

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2005年05月23日

【期刊论文】多年生植物模式物种基因组研究的历史及进展

尹佟明, 李淑娴, 郑阿宝, 王明庥

植物分类学报,42(5):464-479 (2004),-0001,():

-1年11月30日

摘要

木本植物有许多不同于一年生草本植物的生物学特性,生物学家提出将木本植物作为研究多年生植物的模式体系。杨属Populus树种由于研究基础较好且基因组较小,目前已被广泛地接受作为多年生植物基因组研究的模式物种。随着杨属树种全基因组序列的测定,杨属树种在多年生植物的功能基因组研究及一些基础科学问题的研究中将发挥重要作用。本文综述了杨属树种基因组研究的历史、进展及将来的研究热点,旨在为我国多年生植物基因组研究提供参考和借鉴。本文主要论述了以下几个方面的内容:(1)对杨属树种开展的细胞遗传学研究;(2)在分子水平上对杨属树种进行的基因组研究,内容包括遗传作图、基因组测序、物理图谱构建、基因芯片及连锁不平衡分析; (3)杨属树种基因组信息在探讨一些基础科学问题中的潜在应用。

基因组, 多年生植物, 模式物种

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2005年05月23日

【期刊论文】马尾松表达序列标签多态性初步分析

尹佟明, 李东, 陈颖, 黄敏仁, 王明庥

林业科学,2004,40(6):176~180,-0001,():

-1年11月30日

摘要

We reported our preliminary study on mapping of the expressed sequence tag (EST) using single- stranded DNA conformation polymorphism (SSCP) on polymerase chain reaction (PCR) product. Five ESTs primer pairs, developed from nuclear genes including CAD(cinnamyl-alcohol dehydrgenase), CHS(chalcone synthase), NIR (nitrite reductase), ARA554 (cDNA expressed in differentiating xylem in Pinus taedae) and GS (glutamine synthetase), were selected to optimize the experimental protocol and generate mapping markers in the megagemtophytes from a single tree of Pinus massoniana. Our ultimate goal was to use SSCP approach to construct a transcriptional map for comparative mapping studies in P. massoniana. The efficiency to construct a transcriptional map in P. massoniana based on the published EST primer pairs derived from other pine species critically depended on the successful amplification of ESTfragments and the ratio of the heterozygous loci revealed in P. massoniana. In this study, 3 (60%) out of 5 tested EST primer pairs were succeeded in amplification, however, only 1 (20%) gene was heterozygous in the tested tree. The ratio of heterozygous loci detected in this study was similar to that revealed by anonymous marker in P. taeda. Therefore, a low efficiency would be expected if the map would be constructed using single pedigree. The segregation ratio of loci revealed by primer pairs would be higher if multiple pedigrees would be used. We proposed that consensus mapping approach based on multiple-pedigree should be used for EST mapping and therefore to increase the efficiency of EST mapping.

单链构象多态性(, SSCP), ,, 表达序列标签(, EST), ,, 马尾松,, 遗传图谱

合作学者

  • 尹佟明 邀请

    南京林业大学,江苏

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