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2011年05月23日

孙杰，冯鸿杰，，王杰，孙君灵，张新宇，贾银华， *，杜雄明

作物学报，2010，36（6）：961～967，-0001，（）：

-1年11月30日

以2个棕色和3个白色纤维陆地棉做完全双列杂交，分析陆地棉棕色纤维的遗传效应、长绒与短绒的遗传相关及F1的色泽差异。用扫描仪获取长绒和短绒图像，利用Photoshop9.0获取图像RGB信息、量化纤维色泽。按照QGAStation软件中的ADM和AD模型，采用MINQuE法分析，调整无偏预测法（AUP）预测各遗传效应值。结果表明，棕色棉的长绒和短绒的遗传规律一致，其加性和显性遗传方差均极显著，其中，长绒的加性遗传方差比率为0.8501，约为显性遗传方差比率的6倍，短绒的加性遗传方差比率为0.8726，约为显性遗传方差比率的8倍；相关分析显示长绒和短绒的基因型和表现型均达显著相关，基因型相关系数达0.9935；5个亲本加性效应均不相同，但均达极显著水平，其中，棕色棉为正效应，白色棉为负效应。说明棕色纤维陆地棉的长绒和短绒色泽的遗传变异主要来自加性和显性效应，其中加性效应起主导作用；长绒和短绒的色泽遗传存在连锁和互作；因不同品种（系）的加性效应大小不同，造成不同F1纤维色泽的表现差异。

天然棕色棉，遗传效应，纤维色泽，遗传分析

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2011年05月23日

【期刊论文】棉纤维特异表达蓝铜蛋白基因（GhBCP1）的克隆与鉴定

孙杰，田琴，李艳军，郭芳，张新宇，王海云

中国农业科学，2010，43（3）：612-617，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

【目的】对从棉纤维细胞分离获得的基因GhBCP1进行序列和表达分析，初步分析其功能。【方法】采用mRNA荧光差异显示结合cDNA末端快速扩增技术克隆基因全长cDNA序列，用生物信息学方法对获得的cDNA序列及推定氨基酸序列进行分析，并用荧光实时定量PCR法研究基因在不同组织中的表达。【结果】克隆了一个棉纤维特异表达基因的全长cDNA，命名为GhBCP1（GenBank登录号：EF222282），该cDNA全长721bp，含有一个编码176个氨基酸蛋白的开放阅读框。BLAST分析表明该基因所编码产物为一个蓝铜蛋白。Southern杂交分析表明该基因在陆地棉（Gossypium hirsytumL.）中有2个拷贝。实时荧光定量PCR分析发现该基因在棉花纤维细胞特异表达，在纤维发育过程中，GhBCP1转录产物的累积主要发生在纤维细胞发育由伸长向次生壁合成转换阶段。【结论】GhBCP1基因的组织特异性和发育阶段性表达初步证明该基因的功能可能与次生壁合成的起始密切相关。

棉花，纤维，蓝铜蛋白，特异表达

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2011年05月23日

【期刊论文】天然棕色棉查尔酮合成酶基因(GbCHSl)的克隆和实时定量表达分析

孙杰，杨会娜，田新惠，李艳军，李明月，冯鸿杰，孙杰*

棉花学报，2010，22（1）：42～48，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

根据植物查尔酮合成酶基因保守区序列设计引物，以发育18d的天然棕色棉纤维为材料，用RT-PCR结合RACE技术分离得到了一个查尔酮合成酶基因的全长cDNA（GenBank登录号：EU921263），将该基因命名为GbCHSl。实时荧光定量PCR检测显示。GhCHSl基因在棕色棉纤维细胞中优先表达，且在棕色棉纤维中的表达量远高于其近等基因系白色棉，但是该基因在绿色棉中几乎检测不到。这些试验结果暗示。该基因可能在棕色棉纤维色素形成中发挥重要作用。

查尔酮合成酶，天然彩色棉，实时定量RT-PCR

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2011年05月23日

【期刊论文】TRAP转运体——一种新的依赖于胞外溶质结合受体的转运系统

孙杰，王永宝，，陈爱民，王彦章

《生命的化学》，2009，29（6）：789～793，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

TRAP转运体（tripartite ATP-independent periplasmic transporter，TRAP-T）是近期发现的一类溶质吸收系统，广泛存在于原核生物中。该转运体具有一个与ABC转运系统相似的胞外溶质结合受体（extracy toplasmic solute-bindingreceptor，ESR），是一类新的依赖于ESR的二级主动转运系统，它利用离子电化学势梯度而不是ATP水解，为溶质吸收提供能量。对于少数TRAP-T的溶质底物和生理作用的研究，揭示了TRAP-T不仅具有高度的溶质亲和性，而且其组分也可以被招募行使其他功能。本文综述了TRAP-T的组成、调控机制及其功能的研究进展。

TRAP转运体，胞外溶质结合受体， ABC转运系统，溶质吸收系统

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2011年05月23日

【期刊论文】拟南芥mRNA及其靶序列配对特征分析

孙杰，刘冲，，范云六，王磊

中国农业科技导报，2009，11（4）：53～57，-0001，（）：

-1年11月30日

摘要

microRNAs（miRNAs）是真核生物中一类长度约为22nt的非编码小分子RNA，miRNA与AGO等蛋白形成RISC沉默复合体，通过剪切或翻译抑制对靶基因起负调控作用。对拟南芥miRNA序列及其配对的靶序列间的特征进行了统计分析，结果表明miRNA序列5'端富含A、U，第1、第19碱基位对U、C具有较强的倾向性；miRNA与靶序列间常有l～4个碱基错配，错配碱基常出现在第1，第2和第21位，而第3～第6，第9～第10，第16～第17碱基配对较为保守，为人工合成miRNA的设计及miRNA靶基因的预测以提供了依据。

拟南芥，基因沉默， RNAi，微小RNA，人工小RNA

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