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2006年11月16日

【期刊论文】基于概率神经网络的寄生虫卵显微图像识别

詹希美, 郭晓敏, 伍小明

计算机工程与应用,2005,15:198-223,-0001,():

-1年11月30日

摘要

病原体(虫卵)检测是诊断寄生虫病的最常用和最可靠的方法。该文对寄生虫卵显微图像的自动识别进行了研究,设计了一个基于概率神经网络的分类器。通过对血吸虫等9种寄生虫卵的显微图像进行自动识别,取得了平均正确识别率为99.23%的较好结果。

寄生虫卵, 图像识别, 概率神经网络

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2006年12月01日

【期刊论文】日本血吸虫成虫低密度脂蛋白受体研究

詹希美, 王亮*, 李卓雅, 王轶, 何蔼, 谢敏辉

中国寄生虫学与寄生虫病杂志,2002,20(2)90~93,-0001,():

-1年11月30日

摘要

目的研究日本血吸虫成虫低密度脂蛋白受体,为以后的疫苗研究提供依据。方法自人工感染家兔的肠系膜下静脉取日本血吸虫成虫,用非离子去污剂TritonX2100抽提出日本血吸虫成虫表膜蛋白,反相高效液相色谱(HPLC)进行分离纯化后,收集各主要分离蛋白峰,以125I标记的人血浆低密度脂蛋白(LDL)作为放射性配体,经放射性自显影及放射性受体配体结合分析鉴定能与人血浆125I2LDL特异结合的蛋白。并以SDS2PAGE及等电聚焦电泳确定其纯度、分子量及等电点。结果在日本血吸虫雌、雄成虫虫体表膜均存在可与人血浆125I2LDL特异性结合的蛋白分子,此蛋白是日本血吸虫成虫低密度脂蛋白受体,在HPLC上保留时间为10.5min,SDS2PAGE显示其分子量约60~65kDa,等电点为6.7。结论日本血吸虫雌、雄成虫虫体表膜均存在人血浆低密度脂蛋白受体。

日本血吸虫, 低密度脂蛋白受体, 高效液相色谱(, HPLC), , 放射性受体配体结合分析

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2006年11月16日

【期刊论文】广州管圆线虫成虫eDNA文库构建*

詹希美, 梁瑜, 王轶, 何蔼, 李道宁, 俞慕华, 李卓雅, 张瑞琳

中国人兽共患病杂志,2003,19(2):34-37,-0001,():

-1年11月30日

摘要

目的构建广州管圆线虫成虫cDNA文库。方法提取广州管圆线虫成虫总RNA,用Clontech公司SMARTTMcDNA文库构建试剂盒反转录合成第一链cDNA,然后通过长距离PCR方法合成双链cDNA并扩增;PCR产物与kTripIEX2载体连接并包装,建成未扩增文库;检测未扩增文库滴度和重组效率后,进行文库扩增及测定扩增文库的滴度。结果经测定,未扩增文库滴度为9.7×10pfu/ml,重组效率达99.2%以上,文库扩增后滴度达9.13×10pfu/ml。结论已成功构建了广州管圆线虫成虫cDNA文库。

广州管圆线虫, cDNA文库, 构建

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2006年11月16日

【期刊论文】广州管圆线虫Y-丁基甜菜碱羟化酶基因的获得与分析*

詹希美, 孟锦绣, 梁瑜, 何蔼, 李卓雅, 雷智刚, 易冰, 张瑞琳

中国人兽共患病杂志,2004,20(3):186-189,-0001,():

-1年11月30日

摘要

目的对广州管圆线虫成虫cDNA文库的插入片段进行研究。方法铺平板培养广州管圆线虫成虫cDNA文库,从中挑选生长、分离良好的噬菌斑进行PCR扩增,根据PCR产物电泳结果挑选较大的cDNA插入片段进行克隆、测序和原核诱导表达,对表达产物进行免疫学鉴定,用生物信息学方法分析其结构和功能。结果获得了国内外尚未见报道的广州管圆线虫全长基因,该基因长1416bp,编码由421个氨基酸组成的7-丁基甜菜碱羟化酶(gsmma-butyrobetaine,2-oxoglu-tarateclioxygenase。GAMMA-BBH,EC1.14,11.1);免疫学鉴定结果显示GAMMA-BBH不能与大鼠的抗血清结合。结论首次获得广州管圆线虫成虫GAMMA~BBH表达基因,为广州管圆线虫的研究提供实验室依据。

广州管圆线虫, eDNA文库, 克隆, 7-丁基甜菜碱羟化酶, 生物信息学

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2006年11月16日

【期刊论文】刚地弓形虫LDH-Like MDH cDNA的克隆和序列分析*

詹希美, 申川军, 何蔼, 郑小英, 余南, 郑斌, 郑焕钦, 李卓雅, 曹爱莲, 詹希美**

中国人兽共患病杂志,2005,21(6):461~466,-0001,():

-1年11月30日

摘要

目的获取弓形虫RH株速殖子苹果酸脱氢酶(MDH)的cDNA全长序列,并对推导翻译出的氨基酸(aa)序列进行分析。方法将NCBIGenBank中登录的弓形虫MDHEST序列进行比对、拼接和电子延伸,发现近5’末端的部分核酸序列缺失。基于分析,设计的上游、下游引物分别包含起始密码子ATG和终止密码子TGA(TGA-UGA),使经RT.PCR扩增出的片段对应完整的CDS或者ORF。之后对MDHCDS推导翻译出的aa序列进行了保守功能域和同源性分析。结果本研究克隆的MDH的cDNA全长951bp,推导翻译出的蛋白质有316个aa组成,约35kDa,与预期大小接近。保守功能域分析表明。弓形虫MDH最接近类一乳酸脱氢酶型(1actatedehydrogenase-like)MDH,其准确定名缩写为LDH-likeMDH,同时弓形虫MDH还具有其它脱氢酶类的特征。弓形虫MDH除与隐孢子虫和恶性疟原虫高度同源外,还与很多细菌等物种同源,但与人的同源性最低(22%)。弓形虫MDHcDNA序列在NCBIGenBank中登录号为AY650028,对应aa序列的登录号为AAT67462。结论本研究首次获得了弓形虫MDH基因的全长cDNA序列和对应的aa序列。MDH是三羧酸循环中的重要酶类。该酶活性的改变。将直接影响弓形虫的存活。弓形虫MDHaa序列与人MDH蛋白问的同源性很低,提示基于MDH蛋白作为药靶,经高通量技术筛选抗弓形虫药具有可行性。

弓形虫, 苹果酸脱氢酶, 克隆, 序列分析

合作学者

  • 詹希美 邀请

    中山大学,广东

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